生物合成基因簇

作品数:182被引量:366H指数:9
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早期描述物种的模式标定及基因组解析:以中国第一个被描述的真菌新种五棱散尾鬼笔为例
《菌物学报》2025年第4期14-28,共15页梁俊敏 王科 杜卓 赵明君 蔡磊 戴玉成 
中华人民共和国科学技术部基础资源调查专项(2021FY100900)。
五棱散尾鬼笔Lysurus mokusin(L.f.)Fr.,又名中华散尾鬼笔,于1774年由法国传教士西博特(Cibot PM)描述与发表,是首个被科学描述的中国真菌新物种,为稳定该名称的准确使用,本研究依照现用命名法规对该物种开展了模式标定和分类学研究,指...
关键词:附加模式 DNA条形码 HiFi测序 双速基因组 生物合成基因簇 
一株产灵菌红素黏质沙雷氏菌的分离鉴定及其基因组分析
《微生物学报》2024年第11期4290-4307,共18页张雨欣 王美燕 李殿怡 司军 卞小莹 牛国清 刘蓉 
国家重点研发计划(2020YFA0907700)。
【目的】对甘蓝根际微生物进行分离,从中选择具有优良性状的菌株,对其次级代谢产物合成能力进行评估,为甘蓝根际微生物资源的发掘利用奠定基础。【方法】采集重庆市武隆区仙女山镇仙女山村甘蓝根,分离培养根际微生物菌株,从中选择一株...
关键词:甘蓝 黏质沙雷氏菌 灵菌红素 基因组分析 生物合成基因簇 异源表达 
环圈链霉菌(Streptomyces anulatus)89-2-2全基因组测序及序列分析被引量:1
《微生物学通报》2024年第8期3085-3102,共18页阮文伟 付建红 崔凤真 铁瑞岚 徐国燕 阿依卡买尔·艾克拜尔 
国家自然科学基金(32260226);新疆维吾尔自治区“天山”创新团队计划(2022D14004);新疆维吾尔自治区自然科学基金(2021D01A122)。
【背景】环圈链霉菌(Streptomyces anulatus)89-2-2是一株中度嗜盐放线菌,其次级代谢产物具有抑制蘑菇酪氨酸酶活性、抑制小鼠黑色素瘤B16细胞内酪氨酸酶活性及黑色素合成的作用。目前S.anulatus 89-2-2基因组序列分析尚未见报道,这限...
关键词:中度嗜盐链霉菌 酪氨酸酶抑制剂 全基因组测序 生物合成基因簇 
喷他霉素新生产菌的发现及产量提高被引量:1
《微生物学通报》2024年第8期2888-2904,共17页孙佳宁 王海燕 范可强 何信 廖振翔 王立艳 黄英 任晋玮 孟大利 潘国辉 
国家重点研发计划(2022YFC2303100);国家自然科学基金(32270081)。
【背景】喷他霉素(pentamycin)是一种多烯大环内酯类抗生素,对白色念珠菌(Candida albicans)、阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis)和其他几种病原菌有显著的抑制活性,在瑞士已被注册用于治疗阴道念珠菌病、滴虫病和混合感染。【目的】...
关键词:次级代谢产物 喷他霉素 生物合成基因簇 基因工程改造 
玉米大斑病菌铁载体合成基因簇鉴定及表达分析被引量:1
《农业生物技术学报》2024年第5期1121-1131,共11页岳浩峰 赵天益 李海笑 闫秋静 徐雅迪 孟亚南 曹志艳 刘宁 董金皋 
国家现代农业产业技术体系(CARS-02);国家自然科学基金(32072370;31901827);河北省自然科学基金(C2020204183);中央引导地方科技发展资金(226Z6502G)。
铁是微生物生长必需的元素,在氧代谢、电子转移以及DNA和RNA合成等过程中发挥重要作用,微生物主要依赖于铁载体吸收环境中的铁离子。铁载体作为微生物分泌的低分子量铁螯合物,协助机体运输铁离子。真菌主要利用非核糖体多肽合成酶编码...
关键词:玉米大斑病菌 铁载体 次级代谢产物生物合成基因簇 基因表达 
青霉属真菌次级代谢基因挖掘的研究进展被引量:1
《中国海洋药物》2024年第1期74-85,共12页孙园园 于豪冰 翟祥宁 宁哲 何颖 胡波 刘小宇 
国家重点研发计划项目(2018YFC1406702)资助。
青霉属真菌是自然界中最常见的真菌,分布范围非常广泛,是最重要的药源真菌,从青霉属真菌中报道了许多具有抗菌、抗肿瘤、抗病毒等活性的次级代谢产物,是药物先导化合物的重要来源。近年来,随着微生物全基因组测序分析技术的发展以及对...
关键词:青霉属 真菌 基因挖掘 次级代谢产物 生物合成基因簇 
Difficidins生物合成基因簇中蛋白激酶基因difB功能研究
《中国海洋药物》2023年第4期19-26,共8页武强强 高宇佳 肖菲 李文利 
国家自然科学基金项目(32070054,32100051)资助。
目的对海洋芽孢杆菌Bacillus methylotrophicus B-9987 difficidins化合物生物合成基因簇中difB基因功能进行探究。方法通过生物信息学手段对difB的功能进行预测;构建difB双交换阻断突变株及高表达株;通过高效液相色谱法(HPLC)分析野生...
关键词:海洋芽孢杆菌 difficidins 生物合成 磷酸化修饰 
自抗基因导向的微生物天然产物挖掘
《南京工业大学学报(自然科学版)》2023年第3期248-258,共11页董华 明灯明 
国家重点研发计划(2019YFA0905700、2017YFC1600900)。
在后基因组时代,天然产物挖掘因其巨大的应用前景一直备受生物医药领域的研究人员关注。随着研究者对天然产物的生物合成研究的不断深入,从海量的基因组数据中挖掘生物合成基因簇,并从中筛选新天然产物的研究策略,已经越来越受到人们的...
关键词:自抗基因 抗性基因数据库 生物合成基因簇 基因组挖掘 天然产物 
宁夏枸杞根际土壤链霉菌Ⅱ-2-2-2的基因组测序和次级代谢产物分析被引量:1
《中国医药生物技术》2023年第2期99-109,共11页胡运琪 许建韧 沈晓华 林文星 吴秀丽 南泽东 马晓莉 江志波 
国家自然科学基金地区科学基金项目(82160672);北方民族大学研究生创新项目(YCX22156);宁夏自然科学基金优秀青年项目(2022AAC05041)。
目的 分析链霉菌Ⅱ-2-2-2基因序列,挖掘潜在次级代谢能力生物合成基因簇。方法 采用IlluminaHiSeq+PacBio测序技术获得链霉菌Ⅱ-2-2-2的基因组草图序列,经antiSMASH(v6.0.1)平台分析次级代谢产物合成基因簇,采用高效液相色谱-四极杆-飞...
关键词:链霉菌Ⅱ-2-2-2 生物合成基因簇 基因组挖掘 分子网络 次级代谢物 
教酒链霉菌中卡西霉素生物合成基因簇的calU3基因功能分析
《基因组学与应用生物学》2023年第4期418-426,共9页苟丽霞 杨清浅 刘孟欣 汪志军 韩铁生 
国家自然科学基金项目(31700083);河北省自然科学基金项目(H2020209001)共同资助。
卡西霉素(calcimycin)是重要的离子载体抗生素,具有广泛的生物活性,其生物合成基因簇已从教酒链霉菌(Streptomyces chartreusis)NRRL3882的基因组DNA中成功克隆,但其生物合成途径尚未阐明。本研究拟分析卡西霉素生物合成途径中calU3基...
关键词:卡西霉素 生物合成 氧化还原酶 FAD依赖 calU3 
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