生物序列

作品数：109被引量：133H指数：6
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相关作者：林劼朱香元张法王国仁熊赟更多>>
相关机构：大连理工大学中国科学院中国科学技术大学山东大学更多>>
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基于密度感知模式的生物序列分类算法
《计算机应用》2018年第2期427-432,共6页胡耀炜 段磊 李岭 韩超 
国家自然科学基金资助项目(61572332;81473446);中国博士后科学基金特别资助项目(2016T90850);中央高校基本科研业务费资助项目(2016SCU04A22)~~
针对现有的基于模式的序列分类算法对于生物序列存在分类精度不理想、模型训练时间长的问题,提出密度感知模式,并设计了基于密度感知模式的生物序列分类算法——BSC。首先,在生物序列中挖掘具有"密度感知"的频繁序列模式;然后,对挖掘出...
关键词：生物序列 序列分类 序列模式 密度感知模式 分类规则 
GPU OpenFlow海量数据网络处理模型——GOMDI被引量：1
《计算机应用》2014年第8期2243-2247,2272,共6页张伟 解争龙 丁要军 张潇晓 
国家自然科学基金资助项目(61102018);陕西省教育厅科研计划项目(12JK0933);陕西省科技厅科研计划项目(2013JM8037);咸阳师范学院专项科研基金资助项目(12XSYK068)
OpenFlow的出现提高了现有网络的服务质量(QoS),但在处理海量数据时存在网络会话识别效率低、网络报文转发路径不佳等缺点。在OpenFlow的研究基础上,提出了海量网络数据处理(GOMDI)模型,通过将GPU并行计算、生物序列算法和机器学习方法...
关键词：OpenFlow GPU 生物序列 机器学习 
含先验信息的学习机在生物序列分析中的应用
《计算机应用》2005年第9期2169-2170,共2页刘颖 林元烈 覃征 
国家自然科学基金资助项目(10371063);国家科技攻关项目(2004BA711A21);国家863计划资助项目(2003AA412020)
生物序列分析是机器学习和数据挖掘技术一个重要的应用领域。它的特别之处在于,很多有领域背景的先验知识可以在分析过程中得到利用,从而改善分析的效果。在对蛋白质的乙酰化修饰的预测过程中,通过合理地利用先验信息,改进模式提取方法...
关键词：先验信息 生物序列分析 机器学习 支持向量机 
基于比对相似度动态矩阵聚类算法在基因序列中的应用被引量：1
《计算机应用》2004年第8期35-37,共3页张白妮 骆嘉伟 汤德佑 
湖南省自然科学基金项目 (0 3JJY30 95)
基于BAG图的聚类算法 ,利用聚类单元引导类的分割 ,保证聚类结果不会产生过多的类碎片 ,但其相似分数阈值Cutoff初始值和最长公共子串最小长度阈值Threshold如何确定并没有明确给出。提出基于比对相似度动态矩阵的聚类算法 ,并在此基础...
关键词：生物序列 聚类 最长公共子串 比对相似度动态矩阵 
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