配体结合

作品数:144被引量:313H指数:8
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多异瓢虫气味受体HvarOR21的基因克隆及配体结合特性分析被引量:1
《昆虫学报》2024年第10期1307-1317,共11页谢佼昕 唐浩宇 赵丹阳 羿超群 刘晓旭 张永军 
国家自然科学基金面上项目(31972338,32372639);国家重点研发计划项目(2021YFD1400700);山西农业大学引进人才科研启动工程项目(2023BQ07)。
【目的】克隆多异瓢虫Hippodamia variegata触角中高表达的气味受体基因HvarOR21,明确HvarOR21的配体结合特性,为揭示多异瓢虫定位猎物栖境的嗅觉识别机制提供理论基础。【方法】基于多异瓢虫成虫触角转录组测序数据与气味受体鉴定结果...
关键词:多异瓢虫 气味受体 双电极电压钳 癸醛 分子对接 
张岩/毛春友教授团队揭示蛋白酶激活受体的栓配体结合和激活机制及G蛋白选择性的结构基础
《浙江大学学报(医学版)》2024年第4期418-418,共1页
2024年7月12日,浙江大学基础医学院张岩/毛春友教授团队联合上海药物研究所徐华强团队在《细胞研究》(Cell Research)上发表了题为“Structural basis of tethered agonism and G protein coupling of protease-activated receptor”的...
关键词:上海药物研究所 基础医学院 蛋白酶激活受体 激活机制 配体结合 G蛋白 PAR1 
人工智能在蛋白质-配体结合亲和力预测中的研究进展被引量:2
《生物工程学报》2024年第7期2070-2086,共17页云轶楠 刘诗梦 代琦 张瑾 王筱 
国家自然科学基金(32172708)。
蛋白质与配体的结合在生命过程中发挥重要作用,计算蛋白质-配体结合亲和力(protein-ligand binding affinity, PLBA)有助于解析蛋白质功能、筛选与蛋白靶点结合的药物以及进行酶的改造等。近年来,人工智能(artificial intelligence,AI)...
关键词:人工智能 蛋白质-配体结合亲和力 药物研发 酶工程 
适用于活性化合物靶点鉴定的无标记蛋白质分析方法
《化学学报》2024年第6期629-640,共12页吕博海 勾文峰 许飞飞 李艳丽 李祎亮 侯文彬 
国家自然科学基金(Nos.82104012,82202950,82303681);中国医学科学院医学与健康科技创新工程重大协同创新项目(No.2021-I2M-1-042);中央高校基本科研业务费专项资金(No.3332022063)资助。
随着越来越多的活性有效成分被发现,探寻这些有效成分的药理作用机制,鉴定它们有效靶点的需求逐渐增加.化学生物学作为近年来新发展的一门交叉学科,是承担此项任务的最佳选择.其中多种无标记蛋白质分析方法通过研究活性分子化合物与蛋...
关键词:靶点鉴定 无标记 蛋白质分析 热力学作用 配体结合 荧光报告 
基于LSTM和注意力机制的蛋白质-配体结合亲和力预测被引量:1
《陕西师范大学学报(自然科学版)》2024年第3期76-84,共9页王伟 吴世玉 刘栋 梁慧茹 史进玲 周运 张红军 王鲜芳 
国家自然科学基金(62072157);河南省科技攻关项目(242102211045,242102210001);河南师范大学高性能计算中心项目。
蛋白质-配体的结合亲和力预测是药物重定位回归中具有挑战性的任务。深度学习方法可以有效预测蛋白质与配体相互作用的结合亲和力,减少药物发现的时间和成本。由此,基于长短期记忆模块(LSTM)和注意力机制模块(attention)提出了一种深度...
关键词:结合亲和力 卷积神经网络 注意力机制 评分功能 机器学习 
绿盲蝽气味结合蛋白AlucOBP31配体筛选及EAG测定
《中国生物防治学报》2024年第2期319-326,共8页武娟 张瑶瑶 李仔博 刘靖涛 安兴奎 刘顺 李瑞军 张永军 
国家自然科学基金(32372639,31972338);现代农业产业技术体系(CARS-02-26);国家重点研发计划(2021YFD1400700)。
绿盲蝽Apolyguslucorum是重要的农业害虫,了解其化学感受机制对该虫的绿色防控具有重要指导意义。气味结合蛋白(Odorant-binding proteins,OBPs)在昆虫化学感受过程中发挥关键作用。为深入探究绿盲蝽OBP家族成员AlucOBP31的生物学功能,...
关键词:绿盲蝽 气味结合蛋白AlucOBP31 配体结合 EAG 化学感受 
GraphPLA:一种预测蛋白质–配体结合亲和力的图神经网络方法
《计算生物学》2024年第1期1-11,共11页郭岳松 刘立伟 
蛋白质–配体结合亲和力是蛋白质与配体相互作用强度的一个重要指标。准确预测蛋白质–配体结合亲和力对于发现药物的新应用至关重要。迄今为止,已经开发了许多计算技术来预测结合亲和力;然而,这些技术中的一部分需要并不常见的蛋白质...
关键词:蛋白质–配体结合亲和力 图卷积神经网络 深度学习 蛋白质–配体结合口袋 图注意力网络 
ADC药物配体结合生物分析常见技术问题探讨
《中国药物评价》2023年第4期281-288,共8页秦秋平 陶亦敏 刘婷婷 闫莉萍 宫丽崑 
目的:抗体药物偶联物(ADC)是一类新的生物治疗药物,通常由细胞毒性有效载荷通过连接子与抗体共价结合组成。ADC在体内经历不断的脱偶联和生物转化过程,导致形成复杂且结构不均一的混合物,除了脱偶联的游离抗体和游离载荷外,还存在不同...
关键词:抗体偶联药物 配体结合分析 药代 抗药抗体 生物分析 
评分函数在蛋白质-配体结合方面的应用研究进展
《计算机应用与软件》2023年第7期61-70,共10页曹雨康 江健 刘杰 
国家自然科学基金面上项目(61573011)。
评分函数作为一种计算方法,广泛应用于基于结构的药物设计中,用于评估蛋白质与配体的相互作用,但分类有些混乱。提出一种适当的分类方案及命名约定并讨论这些分类的区别与联系,有助于反映评分函数在预测蛋白质与配体结合情况这一领域的...
关键词:评分函数 蛋白质配体结合 机器学习 药物设计 
冷杉梢斑螟化学感受蛋白DabiCSP8的配体结合特性分析被引量:1
《植物保护》2023年第3期50-59,74,共11页朱垚龙 王政全 吴春 尹宁娜 刘乃勇 
云南省应用基础研究面上项目(202001AT070100);云南省“高层次人才培养支持计划”青年拔尖人才项目(YNWR-QNBJ-2019-057)。
采用分子生物学和荧光竞争性结合测定等技术,研究了冷杉梢斑螟Dioryctria abietella雌虫性腺和雌、雄成虫足中高表达的化学感受蛋白DabiCSP8基因的表达特征和功能。定量分析结果表明,DabiCSP8基因在雌虫性腺中显著高表达,表达量分别是...
关键词:冷杉梢斑螟 化学感受蛋白 结合测定 Β-紫罗兰酮 分子对接 
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