微阵列数据

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基于熵的微阵列数据特征选择
《广西大学学报（自然科学版）》2024年第3期637-643,共7页邓蕊欣 李达 金德泉 
广西自然科学基金项目(2022GXNSFAA035519)。
针对基于熵的特征加权算法忽略了数据集内在特性对特征重要性的影响,导致特征选择效果不佳的问题,提出一种改进的基于熵的特征加权算法,根据信息熵计算特征维度的重要性权重,通过引入交叉验证实现不同数据集的阈值学习,确定用于度量特...
关键词：特征选择 微阵列数据 分类 信息熵 交叉验证 
呼吸道上皮细胞感染人偏肺病毒与核心代谢途径的改变有关
《中华实验和临床病毒学杂志》2022年第4期401-401,共1页麻粉莲(编译) 
人偏肺病毒(human metapneumovirus,hMPV)是导致婴儿、老年人和免疫缺陷患者急性下呼吸道感染的重要原因。微阵列数据的通路分析表明,影响hMPV感染呼吸道上皮细胞的20%基因与代谢有关。研究发现,在hMPV感染后,人呼吸道上皮细胞中糖酵解...
关键词：呼吸道上皮细胞 人偏肺病毒 免疫缺陷患者 通路分析 急性下呼吸道感染 糖酵解途径 微阵列数据 代谢途径 
一种用于癌症分类的两阶段深度特征选择提取算法
《计算机科学》2022年第7期73-78,共6页胡艳羽 赵龙 董祥军 
国家自然科学基金(62076143,61806105);山东省自然基金(ZR2017LF020).
癌症是世界上最致命的疾病之一。利用机器学习处理基因微阵列数据集(Microarray Data)对于协助癌症的早期诊断具有重要作用,但微阵列数据集中基因特征的数目远大于样本数目,造成样本不平衡,影响了分类的效率和精度,因此对基因阵列数据...
关键词：微阵列数据 特征选择 深度学习 随机森林 变分自编码器 
基于BTLBOGSA与CNN的基因微阵列数据分类模型
《广西科学》2022年第2期260-268,共9页赵晚昭 谢聪 
广西自然科学基金项目(2021GXNSFBA220080);广西高等教育本科教学改革工程项目(2021JGA425);广西中青年教师科研基础能力提升项目(2021KY1736);国家自然科学基金企业创新发展联合基金(U19B2021)资助。
针对现有基因微阵列数据分类中存在的数据维度高、容易发生过拟合的问题,提出了基于BTLBOGSA(Binary TLBOGSA)与卷积神经网络(Convolutional Neural Network,CNN)的基因微阵列数据分类模型(BTLBOGSA-CNN)。该模型首先针对基因微阵列数...
关键词：基因微阵列数据分类 教与学优化算法 引力搜索算法 特征选择 卷积神经网络 
基于微阵列数据的肺癌相关核心基因的挖掘和鉴定分析
《临床医学进展》2021年第3期996-1006,共11页高尚 张智云 孟令丙 单梦洁 
背景:肺癌是源于支气管黏膜上皮的恶性肿瘤,发病率和死亡率均居恶性肿瘤首位,由于发病隐匿,早期症状不明显,就诊时大多属晚期,5年总生存率(overall survival, OS)仅为19%,当出现远处转移时其生存率更低。为了筛选肺癌发生发展的潜在基因...
关键词：肺癌 差异表达基因 蛋白质互作网络 生物信息学 
基于微阵列数据的胃癌相关核心基因的挖掘和鉴定分析
《临床医学进展》2020年第11期2695-2704,共10页郭鹏 赵建刚 刘义粉 赵光远 鲍双振 刘防震 尹长恒 裴晓露 
背景:胃癌(GC)是起源于胃黏膜上皮的恶性肿瘤,在我国恶性肿瘤死亡率中占第3位,早期症状不明显,发现时多已发展至晚期,预后较差。为了筛选GC发生发展的潜在基因,本研究从GEO数据库中获得GSE109476和GSE118916进行生物信息学分析。方法:首...
关键词：胃癌 差异表达基因 蛋白质互作网络 生物信息学 
基于微阵列数据探讨金属硫蛋白在吸烟者气道的变化及其可能机制被引量：1
《广东医科大学学报》2020年第3期273-278,共6页区锦涛 吴东 黄丹 李文 
目的 探讨吸烟对气道金属硫蛋白(MT)表达的影响及其可能机制.方法 获取公共基因表达综合数据库(GEO)的微阵列矩阵数据并进行整合分析,以确定烟雾暴露后MT表达的变化趋势;同时使用miRDB数据库预测靶向16个MT的miRNA,CLUSTAL W软件对MT m...
关键词：吸烟 金属硫蛋白 微阵列 微小RNA 
多种归一化方法对miRNA微阵列数据的作用分析及比较被引量：3
《西南师范大学学报（自然科学版）》2020年第5期98-102,共5页侯丽云 张旭 吴珍 
国家自然科学基金项目(11701471);重庆市基础科学与前沿技术研究项目(cstc2017jcyjAX0476).
通过MA图和箱线图比较归一化前后miRNA微阵列数据分布情况的变化,用K-S检验和均方误差来评估6种归一化方法的优良性.结果显示,对于miRNA微阵列数据而言,局部加权回归方法和分位数归一化方法比其它方法效果更好,其中又以局部加权回归方...
关键词：miRNA微阵列数据 归一化方法 MA图 K-S检验 均方误差 
基于SMA模型的扩张型心肌病影响基因分析被引量：1
《数学的实践与认识》2020年第3期180-186,共7页吕清芬 徐美萍 
北京市自然科学基金资助项目“HP空间中次调和函数的积分表示及其应用”(1182008);2019年度青年基金项目“青年教师科研能力提升计划”(PXM2019_014213_000007).
医学研究表明约30%的扩张型心肌病与遗传因素有关,因此从基因水平寻找其病因及发病机制越来越引起国内外学者的重视.采用针对超高维数据的序贯模型平均(SMA)方法对扩张型心肌病转基因小鼠微阵列数据建立回归模型,确定哪些基因对小鼠中G...
关键词：序贯模型平均 变量选择 扩张型心肌病 微阵列数据 
基于混合遗传算法与互信息分析的高维小样本特征选择被引量：6
《计算机应用与软件》2020年第1期247-255,共9页姚树春 刘正 张强 
国家自然科学基金项目(61876117);苏州工业园区服务外包职业学院教改项目(JG-201706);江苏高校“青蓝工程”项目
针对高维小样本数据特征选择冗余度高和过拟合的问题,提出一种基于混合遗传算法与互信息分析的高维小样本特征选择算法。对互信息理论与特征选择问题进行深入分析,利用互信息消除特征冗余度能力强的优点,推理出基于互信息的目标函数和...
关键词：高维小样本数据 特征选择 互信息 遗传算法 过拟合问题 微阵列数据 
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