基因间序列

作品数:9被引量:6H指数:2
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相关机构:内蒙古大学蒙特利尔大学孟山都技术公司牛津大学创新有限公司更多>>
相关期刊:《水生生物学报》《山西大同大学学报(自然科学版)》《生物物理学报》《上海中医药大学学报》更多>>
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基于三代测序技术对中药灵芝和食用菌rRNA基因及其基因间序列的鉴定研究
《上海中医药大学学报》2022年第6期5-12,共8页张韦唯 袁育红 戈雅倩 朱彦蓉 赵解南 孙建鹤 黄林佳 胡泽华 许嘉豪 郭琳婷 高宇峰 张益辉 王燕萍 黄钢 王毅兴 戴方平 
国家自然科学基金资助项目(81830052);国家重点研发计划项目(2020YFA0909000);上海市分子影像重点实验室建设项目(18DZ2260400);上海市浦东新区中医治未病高峰学科建设项目(PDZY-2018-0603);上海市浦东新区学科带头人项目(PWRd2019-04);江苏省南通市科技局科技基金项目。
目的:基于三代PacBio测序技术,建立中药灵芝和食用菌rRNA 18S-ITS-28S全长序列文库,从分子水平快速、准确鉴定和研究品种。方法:对收集到的8种食用菌和1种中药材真菌灵芝抽提基因组DNA,设计引物扩增18S-ITS-28S全长序列,18S-ITS-28S全...
关键词:灵芝 食用菌 RRNA基因 测序分析 鉴定 
斑马鱼和鲤miR-1-2/133a-1基因间序列活性和调控研究
《水生生物学报》2021年第3期507-513,共7页龚葭薇 何梅 闫学春 孔德麟 梁洋 
黑龙江省博士后科研启动基金(LBH-Q19061);黑龙江省自然科学基金(LH2020C053)资助。
分别以斑马鱼(Danio rerio)和鲤(Cyprinus carpio L.)为研究材料,通过克隆斑马鱼和鲤miR-1-2和133a-1的基因间增强子序列,利用活体和离体实验探讨其是否具有肌肉特异性;并通过荧光素酶报告系统等研究转录因子MyoD是否调控该序列。研究...
关键词: 斑马鱼 肌肉发育 MYOD miR-1-2/133a-1 基因间序列 
应用Hapmap数据库分析HBG1-HBD基因间序列单倍型及标签SNP的挑选被引量:1
《医学研究生学报》2016年第12期1281-1285,共5页韩文平 黄盛文 黄凌 王偲颖 韩媛媛 王予川 安邦权 
国家自然科学基金(81260089);贵州省科技创新人才团队建设项目(黔科合人才团队[2015]4019号);贵州省科学技术基金项目(黔科合J字[2015]2091号)
目的 HBG1-HBD基因间序列在γ珠蛋白基因表达有重要作用,文中分析中国北京汉族人群HBG1-HBD基因间序列的单倍型并挑选标签SNP(tag SNP)。方法从Hapmap数据库中下载HBG1-HBD基因间序列上中国北京汉族人群的所有SNP数据。应用Haploview 4....
关键词:HAPMAP HBG1-HBD基因间序列 单倍型 标签SNP位点 
基于编码序列、基因间序列和氨基酸序列构建的系统发生关系比较被引量:2
《生物物理学报》2012年第2期157-168,共12页杨林源 李宏 赵小庆 刘国庆 
国家自然科学基金项目(30660044)
以7种古菌、46种细菌和10种真核生物的基因组为样本,考虑碱基间的短程关联和长程关联作用,得到编码序列的密码对和基因间序列的三联体对中不同位点的二核苷酸频率,据此构建了基于编码序列和基因间序列的系统发生关系。无论是基于编码序...
关键词:系统发生关系 二核苷酸频率 碱基长程关联 编码序列 基因间序列 
大黄鱼紧密连锁的α-和β-珠蛋白基因间序列功能分析被引量:1
《水生生物学报》2008年第3期413-416,共4页姚康 王文策 耿梅梅 吴信 李铁军 褚武英 
国家自然科学基金项目(30528006);浙江省科技厅重点科技攻关项目(2005C23085)资助
关键词:大黄鱼 PCR 珠蛋白 基因间序列 调控 
果蝇DNA和基因间序列的两个信息参数沿染色体分布
《山西大同大学学报(自然科学版)》2007年第6期18-21,共4页解廷月 
以果蝇染色体的全序列和基因间序列作为研究对象.分别用描述序列构成的两个信息参数X和F分析两类序列沿着染色体分布特征,并着重讨论染色体着丝粒及其周围区域的分布规律,用线性拟合和多项式拟合分析染色体各类序列沿染色体的统计分布特...
关键词:果蝇染色体 信息参数 序列沿染色体排列 
模式生物的外显子、内含子和基因间序列的识别(英文)
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2005年第2期166-172,共7页陈翠霞 李前忠 林昊 
国家自然科学基金项目 (3 0 1 6 0 0 2 5)~~
基于核酸序列在剪切位点上保守性、组分的不同和编码序列阅读框架的3周期性,模式生物全基因组序列分为外显子、内含子和基因间序列三类.三个标准离散源分别由64个三联体在整条序列上的概率和4个碱基序列首尾(剪切位点附近)共30个位点上...
关键词:外显子 内含子 基因间序列 剪切位点 面散增量 
用离散量预测拟南芥全基因组中内含子、外显子和基因间序列
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2004年第4期418-422,共5页陈翠霞 李前忠 王小龙 
国家自然科学基金项目资助(30160025)
将拟南芥基因组全序列,按内含子、外显子及基因间序列区分为三类.在统计分析的基础上,选取21种三联体的概率,作为信号参数,并以这些参数分别构建内含子、外显子和基因间序列的离散源,计算了离散量.某区间上任意一段序列的类型是由其离散...
关键词:长度分布 特征三联体 离散量 离散增量 
预测线虫和酵母基因组中内含子、外显子及基因间序列的离散增量方法被引量:2
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2004年第1期60-65,共6页鲍卫华 李前忠 
国家自然科学基金资助项目(30160025)
把基因组中的内含子、外显子和基因间序列分为三类序列,从这些序列中取64种三核苷的重复出现次数作为离散源的状态参数,计算三类序列的标准离散量,比较待测序列的离散量与三个标准离散量之间的离散增量值,由离散增量的最小值决定待测序...
关键词:序列预测 离散量 离散增量 
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