碱基关联

作品数:13被引量:13H指数:3
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人类核糖体蛋白加工假基因与其同源基因的序列信息差异
《科技创新导报》2013年第2期14-15,共2页刘红梅 
引入信息参数—非均匀指数和紧邻碱基关联,对核糖体蛋白加工假基因与对应核糖体蛋白基因编码序列之间进行了对比分析,发现绝大多数(约占89%)假基因的非均匀性明显弱于对应功能基因编码序列,绝大多数(约占88%)假基因的紧邻碱基关联强于...
关键词:加工假基因 功能基因 非均匀指数 碱基关联 
加工假基因演化过程中的两种信息流
《生物信息学》2009年第3期207-211,共5页刘国庆 李宏 赵朝霞 
国家自然科学基金(30660044);高等学校博士点基金(20050126003)资助项目
定义描述DNA序列组分差异性和碱基关联的两个参数,分析了人类加工假基因演化过程中其组分信息和碱基关联信息的变化特征,发现随时间的推移,加工假基因的组分逐步向其侧翼序列漂移,紧邻碱基关联逐步增强。这表明本研究所得参数可很好地...
关键词:加工假基因 组分差异性 碱基关联 背景突变偏好 
基于碱基关联二联体位置权重矩阵预测酵母转录因子结合位点被引量:3
《生命科学研究》2008年第2期115-120,共6页杨科利 许强 
宝鸡文理学院硕士科研启动项目(ZK0791;ZK0792)
基于已知的酵母转录因子结合位点数据资料,构建转录因子结合位点碱基关联二联体位置权重矩阵,整合碱基关联二联体位置权重矩阵和碱基保守性参量M2i,提出一种新的预测转录因子结合位点的方法(PWMSA).利用self-consistency和cross-validat...
关键词:转录因子结合位点(TFBS) 位置权重矩阵(PWM) 碱基保守性 
密码子前后双碱基关联与蛋白质二级结构的关系被引量:1
《内蒙古工业大学学报(自然科学版)》2003年第3期170-174,共5页胡秀珍 肖奕 
内蒙古自然科学基金资助项目(20001301)
对人(Homosapiens)的117个蛋白质和大肠杆菌(E.coli)的87个蛋白质的各二级结构相对应的mRNA序列中的密码子前后双碱基关联作了统计分析,分析发现它们的使用对不同种属蛋白质二级结构有不同的偏好,对同一种属蛋白质的不同二级结构也有不...
关键词:蛋白质二级结构 同义密码子 双碱基关联 
核酸序列的矩阵表示被引量:3
《内蒙古大学学报(自然科学版)》1999年第1期41-44,共4页李前忠 
国家自然科学基金
提出了用矩阵形式一对一地表示核酸序列的方法.发现通过矩阵运算很容易得到描述核酸序列中单碱基出现概率和碱基相关出现概率的矩阵和值,并且很易推广到多个碱基关联的情况.对于核酸序列的编码区,用这种矩阵方法计算出密码子的使用...
关键词:核酸序列 矩阵表示 碱基关联 DNA 
锥体虫、果蝇基因编码区的密码子使用、碱基间关联与基因表达水平的关系研究
《内蒙古大学学报(自然科学版)》1997年第5期626-635,共10页李宏 李前忠 罗辽复 
国家自然科学基金;内蒙古教育厅基金
用自洽信息聚类方法预测了锥体虫(Trypanosomabrucei)(81个基因)和果蝇(Drosophila)(124个基因)的基因表达水平、高表达基因同义密码子的使用规律,求出了描述基因表达水平的参数IE值和CA...
关键词:同义密码子 基因表达水平 碱基关联 锥体虫 果蝇 
编码序列和非编码序列中核苷酸关联性质的比较研究
《内蒙古大学学报(自然科学版)》1997年第2期169-176,共8页贾力军 罗辽复 
国家自然科学基金
定义了核苷酸序列的信息关联和16种碱基关联,并求得了它们的涨落限.从关联长度和关联强度两个方面研究了编码序列和包含编码区和非编码区的全序列的核苷酸关联性质,并用快速付立叶分析的方法研究了关联的周期性.结果表明,编码序...
关键词:核苷酸关联 编码序列 DNA 碱基关联 信息关联 
DNA编码序列的关联特性被引量:1
《内蒙古大学学报(自然科学版)》1996年第5期622-624,共3页罗辽复 李炜疆 
国家自然科学基金
用DNA行走方法和信息剩余度方法研究了核酸编码序列中的碱基关联,指出了这种关联的短程性.讨论了碱基组成漂变导致的表现关联效应和各种关联模的涨落限.对最近的有关文献作了评述.
关键词:DNA 编码序列 碱基关联 信息剩余度 关联模 
DNA碱基组成和碱基关联的进化被引量:2
《内蒙古大学学报(自然科学版)》1996年第5期635-641,共7页贾力军 罗辽复 李炜疆 
国家自然科学基金
据DNA序列新资料,研究了DNA碱基组成和关联与序列进化的关系,进一步证实了关于分子进化信息参数的发现:D2和X及其第一子序列的值在粗粒平均的意义下随进化增长,对MyosinHeavyChain(MHC)序列进行了单...
关键词:碱基组成 碱基关联 分子进化 DNA 编码序列 
碱基关联与基因表达水平的关系被引量:3
《内蒙古大学学报(自然科学版)》1996年第1期35-44,共10页李宏 罗辽复 
国家自然科学基金;博士点基金
研究了E.coli和Yeast基因编码区内碱基关联与基因表达水平的关系,结果表明:1)单碱基构成与基因表达水平有一定的关系;2)紧邻、次紧邻碱基间的关联(t≤2)与基因表达水平有较好的线性关系;3)密码子第1位碱基的...
关键词:碱基 密码子 关联熵 基因表达水平 
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