信息基因

作品数:21被引量:66H指数:4
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相关领域:自动化与计算机技术更多>>
相关作者:乔红艳叶明全王俊骆建华张泽民更多>>
相关机构:武汉理工大学上海交通大学北京大学皖南医学院更多>>
相关期刊:《山东科技大学学报(自然科学版)》《上海交通大学学报》《中国细胞生物学学报》《中国肿瘤》更多>>
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基于代价敏感机器学习的肿瘤分类预测研究
《电脑知识与技术》2024年第31期8-11,共4页熊月玲 唐晓磊 
国家自然科学基金项(项目编号:81601806);安徽省高等学校科研项目(项目编号:2023AH051748);芜湖市卫健委科研项目(项目编号:WHWJ2023y012);皖南医学院中青年科学基金项目(项目编号:WK2022F43)。
为了提高肿瘤分类的精准度,识别信息基因,构建机器学习模型对肿瘤基因表达数据进行分析。该研究从Kent Ridge数据库下载了五组肿瘤基因表达谱数据,利用优化的代价敏感信息增益(CSIG)算法快速过滤无关和冗余基因,筛选出误分类损失较小的...
关键词:肿瘤基因表达谱 信息基因 肿瘤分类 代价敏感学习 机器学习 
基于一种集成的信息基因选择方法的乳腺肿瘤识别研究被引量:2
《中国肿瘤》2019年第7期557-562,共6页杨晓慧 白欣宇 乔江华 陆寓非 
[目的]探讨导致乳腺癌的可能致病基因及其生物学意义。[方法]基于国际上通用的乳腺癌公共测试集Breast-2 (79)数据库,提出了一种集成的决策信息因子(decision information factor,DIF)方法,以有效地选择出候选致病基因,并完成乳腺癌识...
关键词:乳腺癌 微阵列基因表达数据 加权基因共表达网络 决策信息因子 反空间稀疏表示 
图谱方法实现DLBCL信息基因的提取与分类
《佳木斯大学学报(自然科学版)》2019年第1期50-53,109,共5页左常玲 夏百花 
安徽三联学院校级平台重点项目(PTZD2017002);安徽三联学院校级自然一般项目(KJYB2018001)
对肿瘤信息基因的提取及基因表达谱数据的处理,是基因表达谱研究中至关重要的一步。基于图谱理论提出一种新的DLBCL信息基因提取方法。首先,对每一个基因在不同条件下的表达情况构图,使其便于利用图论知识挖掘规律;进而进行奇异值分解(S...
关键词:图谱理论 肿瘤 基因表达谱 信息基因 
基于对称不确定性和SVM递归特征消除的信息基因选择方法被引量:15
《模式识别与人工智能》2017年第5期429-438,共10页叶明全 高凌云 伍长荣 万春圆 
国家自然科学基金项目(No.61672386);教育部人文社会科学研究规划基金项目(No.16YJAZH071);安徽省自然科学基金项目(No.1708085MF142);安徽高校省级自然科学研究重点基金项目(No.KJ2016A275;KJ2014A266)资助~~
基因表达谱中存在大量与肿瘤分类无关的基因,严重降低肿瘤诊断的准确率.基因表达谱还存在高维小样本、噪声大等问题,增加肿瘤诊断的难度.为了获取基因数量较少且分类能力较强的信息基因子集,文中提出基于对称不确定性(SU)和支持向量机...
关键词:基因选择 对称不确定性 支持向量机 递归特征消除 肿瘤分类 
文化算法框架下混合群智能算法的肿瘤信息基因选择被引量:1
《四川大学学报(自然科学版)》2015年第3期573-579,共7页张浩 叶明全 汪楠 
安徽省高校自然科学研究重点项目(KJ2014A266)
为了消除与分类无关和冗余基因,以提高基因的分类精度和效率,提出一种文化算法框架下混合群智能算法的肿瘤信息基因选择方法.首先采用ReliefF算法初选基因子集,然后利用文化算法框架下混合群智能算法选择最优的信息基因,最后在3个标准...
关键词:信息基因 RELIEFF算法 人工鱼群算法 粒子群优化算法 
基于RD-SVM的肿瘤信息基因选择算法被引量:4
《计算机应用与软件》2015年第5期310-313,共4页谢志伟 王志明 骆剑锋 
广东省高新技术产业化项目(2012B010100050);东莞市高等院校科研机构科技计划重点项目(2011108101010)
为了从高维、小样本的基因表达数据中有效地选择特征基因,消除与肿瘤分类无关的数据,提出一种随机矩阵替换与支持向量机的肿瘤信息基因选择算法(RD-SVM)。首先构建多组0/1随机向量表示的信息基因子集,并以支持向量机构建分类器评价每组...
关键词:基因选择 肿瘤表达谱 信息基因 支持向量机 
小样本情况下的异常基因鉴别方法研究
《科技信息》2012年第31期101-102,共2页徐瑞吉 
在小样本情况下,为了有效地提取"信息基因",本文采用Bootstrap算法将小样本转化为大样本,同时将噪声去除,而后采用信息熵和Bhattacharyya距离取交集的方法剔除无关基因,最终得到"信息基因"。通过算例可以证明本文方法的科学性和可行性。
关键词:小样本 信息基因 信息熵 BOOTSTRAP Bhattacharyya 
基于支持向量机的结肠癌信息基因提取被引量:3
《山东科技大学学报(自然科学版)》2012年第3期84-89,共6页李烨 王永丽 贺国平 
国家自然科学基金项目(10971122);山东省优秀中青年科学家科研奖励基金项目(2010BSE06047);高等学校博士学科点专项科研基金项目(20093718110005);山东省科技攻关计划项目(2009GG10001012);山东省自然科学基金项目(Y2008A01)
基于结肠癌基因表达谱数据集,提出了一种信息基因提取的新方法。该方法结合了支持向量机(SVM)、Bhattacharyya距离、递归特征消除(RFE)和快速基于相关性过滤器(FCBF)方法。首先,利用Bhattacharyya距离与SVM-RFE方法结合去除无关基因,然...
关键词:结肠癌 支持向量机 信息基因 BHATTACHARYYA距离 递归特征消除 快速基于相关性过滤器 
基于统计分析法的肿瘤特征基因提取和分类研究
《襄樊学院学报》2011年第8期13-16,共4页赵亚宁 赵彦晖 
在前人研究基础上对传统"信噪比"公式进行修正,然后对带有能够确定出肿瘤类型信息的基因表达谱样本的2000个基因数据进行剔除冗余数据处理,通过模糊聚类分析法进行分类,并对分类效果进行检验,说明修正的"信噪比"在数据冗余处理效果比较...
关键词:癌症 模糊聚类分析法 信噪比 肿瘤特征基因 信息基因 
B2B在线支付进化系统的信息基因测度模型被引量:1
《武汉理工大学学报(信息与管理工程版)》2011年第5期689-693,720,共6页杨琦峰 沈鑫 宋平 谢光萍 王俊 
国家自然科学基金资助项目(71073122);武汉理工大学自主创新研究基金人文社科重点资助项目(2010-lb-011)
针对现有B2B在线支付系统存在的局限性,缺乏有效协同运作机制的问题,基于协同论的序参量原理,发现参与者信息基因是决定B2B在线支付进化系统宏观有序性的微观序参量,构建了"身份特征值+信誉度"二维属性的参与者信息基因模型及有序度测...
关键词:B2B在线支付进化系统 序参量 信息基因模型 协同性 
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