UPGMA聚类分析

作品数：26被引量：442H指数：11
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相关领域：农业科学生物学更多>>
相关作者：吴波刘德春刘勇孙中海张太平更多>>
相关机构：华中农业大学中国科学院中国林业科学研究院江西农业大学更多>>
相关期刊：《茶叶》《昆虫学报》《果树学报》《园艺学报》更多>>
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3种花色类型滇黄精的遗传关系研究被引量：3
《浙江林业科技》2022年第2期21-26,共6页谢蕾 肖良俊 吴涛 李贤忠 苏包顺 刘志彤 
云南省基础研究计划面上项目(202001AT070146)。
滇黄精Polygonatum kingianum是我国传统名贵中药材,也是最具云南特色的药用植物资源。在大理州大理市挖色镇进行滇黄精资源收集和扩繁过程中,发现滇黄精资源在花被颜色上存在紫红花、白花和白花带紫斑3种类型,其中花被白花带紫斑为新...
关键词：滇黄精 花色类型 ISSR分子标记 遗传关系 UPGMA聚类分析 
基于30个形态性状的中国杏属(Armeniaca Scop.)植物分类学研究被引量：10
《植物资源与环境学报》2016年第3期103-111,共9页王家琼 吴保欢 崔大方 羊海军 黄峥 齐安民 
国家自然科学基金资助项目(31370246)
基于与叶和果实相关的30个形态性状(包括20个定性性状和10个定量性状)对中国杏属(Armeniaca Scop.)11种3变种进行了UPGMA聚类分析和主成分分析;在主成分分析基础上,构建了中国杏属植物的OTU散点图;并且,结合降水量分布图绘制了中国杏属...
关键词：杏属 形态性状 UPGMA聚类分析 主成分分析 OTU散点图 分类学修订 
基于SSR标记的荷花品种遗传多样性及群体结构分析被引量：9
《植物资源与环境学报》2016年第1期9-16,共8页杜凤凤 刘晓静 常雅军 李乃伟 李丕睿 姚东瑞 
国家自然科学基金资助项目(31400604);江苏省自然科学基金资助项目(BK20151370);国家海洋公益性行业科研专项(201505023-4);江苏省中国科学院植物研究所基金资助项目(SQ201403)
采用SSR标记技术对42个荷花品种（Nelumbo spp.）的基因组DNA进行扩增,在此基础上,对供试品种进行UPGMA聚类分析、群体结构分析和主坐标分析（PCo A）。结果表明：采用17对SSR引物从42个荷花品种的基因组DNA中扩增出77个位点,多态性位...
关键词：荷花品种 SSR标记 遗传多样性 UPGMA聚类分析 群体结构分析 主坐标分析(PCo A) 
甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系优化与引物筛选被引量：3
《华中农业大学学报》2015年第6期33-39,共7页徐刚红 姜子德 沈万宽 罗明珠 饶得花 
广东省公益研究与能力创新专项(2014A020208094);华南农业大学人才引进启动资金项目(13009)
以甘蔗黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)交配型菌株基因组DNA为模板,在单因素优化试验的基础上,采用L16(45)正交试验设计,对影响甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系的Mg2+、dNTPs、引物、r Taq DNA聚合酶和模板用量5个因素进行优化,建立优...
关键词：甘蔗黑穗病菌 SCoT标记 体系优化 UPGMA聚类分析 
滇杨优树遗传多样性的AFLP分析被引量：11
《西北林学院学报》2014年第4期103-108,213,共7页纵丹 员涛 周安佩 刘东玉 郑元 段安安 何承忠 
林业公益性行业科研专项(201104076);国家自然科学基金项目(31360184);云南省中青年学术与技术带头人后备人才培养基金项目(2012HB021)
以收集于云南和四川的52株滇杨优树为试验材料,并以1株大叶杨、1株北京杨和2株黑杨做类外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条...
关键词：滇杨优树 AFLP 遗传多态性 遗传相似系数 UPGMA聚类分析 
Genetic Diversity of Tea Plant(Camellia Sinensis(L.) O.Kuntze)in Wuling Mountainous Area Revealed by ISSR Marker被引量：2
《茶叶》2013年第4期205-211,共7页Yue Zhang Li Lu Saiyan Yuan Xin Pang Wei-Dong Wang Lin Zhou John K Tanui Xing-Hui Li 
supported by the earmarked fund for Modern Agro-industry Technology Research System of China (CARS-23);the Priority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education Institutions;the Science and Technology Program of Suzhou (SZGD201067,WZC65,WNZ1002);The PhD Gathering Program of Jiangsu;the Science and Technology Program of Jiangsu Province (BE2011319,BE2012440,BE2013426)
Genetic diversity and relationship of 183 tea germplasms were assessed by inter-simple sequence repeat(ISSR) marker.The study optimized the ISSR-PCR system for tea plants.Results show that genetic similarity among 183...
关键词：ISSR标记 遗传多样性 茶树资源 武陵山区 UPGMA聚类分析 ISSR-PCR 简单重复序列 指纹图谱构建 
HB柚有性后代的杂种鉴定和遗传多样性分析被引量：7
《华中农业大学学报》2012年第5期574-577,共4页杨海健 伊华林 
国家现代柑橘产业技术体系专项
以HB柚为母本,与江西无核椪柑杂交,获得380株杂交后代。筛选出5对SSR引物对其中的90株后代进行检测,杂种率为97.8%;杂种后代中出现了部分条带缺失和新条带。采用UPGMA聚类分析法分析后代群体和亲本的遗传关系,相似系数为0.720时,可将杂...
关键词：HB柚 杂交育种 杂种鉴定 SSR 遗传多样性 UPGMA聚类分析 
应用微卫星标记分析不同桔小实蝇种群的遗传多样性被引量：11
《昆虫学报》2011年第2期149-156,共8页吴仲真 李红梅 宾淑英 申建梅 贺华良 罗梅 马骏 林进添 
国家自然科学基金项目(30671378);广东省自然科学基金(07301292)
为探究不同桔小实蝇Bactrocera dorsalis（Hendel）地理种群的遗传变异、入侵来源和扩散情况,利用13对引物对中国南方10省区、泰国、夏威夷、菲律宾和老挝的30个桔小实蝇种群共180个个体的遗传多样性水平进行了研究。Popgene32和NTSYS-p...
关键词：桔小实蝇 地理种群 遗传多样性 遗传距离 微卫星 UPGMA聚类分析 
福建省6种早熟良种柚的RAPD分子标记研究被引量：4
《漳州师范学院学报（自然科学版）》2009年第2期102-106,共5页罗开梅 潘一山 伍成厚 张敬虎 王惠云 缪巧林 
福建省自然科学基金资助项目(2006J0382);福建省教育厅科技项目(JA06021);漳州师范学院科研基金资助项目(SK05009)
采用改良的CTAB法成功提取龙柚等6种福建省早熟良种柚叶片的DNA,并对其进行RAPD分析.从初选的100个随机引物中筛选出12个扩增效果较好的引物,对提取的DNA进行PCR扩增,获得清晰可重复的位点107个,平均每条引物产生的位点为8.9个,其中多...
关键词：优质早熟柚 RAPD分子标记 UPGMA聚类分析 亲缘关系 
RAPD技术应用于紫杉醇产生菌的分类鉴定
《微生物学杂志》2007年第1期26-29,共4页张鹏 葛菁萍 周晓辉 平文祥 周东坡 
国家自然科学基金项目(30570025);黑龙江十五重大攻关课题资助项目(GA02C101);徐州师范大学校科研基金项目(04XLB18)
紫杉醇是一种用于癌症治疗的特效药物,微生物发酵法是生产紫杉醇的有效方法,采用RAPD技术对4株紫杉醇产生菌的遗传差异进行分析,重新从分子水平对其进行了进一步的分类鉴定;并将为下一步的基因工程育种工作中的基因定位和分子克隆提供...
关键词：紫杉醇 RAPD UPGMA聚类分析 
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