G+C含量

作品数:28被引量:148H指数:7
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miRNA与其靶mRNA 3′UTR序列的匹配特征分析
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2021年第2期150-161,共12页孙佩智 李宏 赵小庆 薄素玲 张泽峰 张强 路战远 
国家自然科学基金(31860304,31500677)。
MicroRNA是调控基因表达的重要功能片段,它们在动植物的生长发育、疾病发生过程中发挥着重要的作用。基于miRecords数据库,以人类、小鼠和大鼠实验验证的miRNA和它们的靶mRNA 3′UTR序列为研究对象,分析了miRNA和其匹配片段在3′UTR序...
关键词:MIRNA 3′UTR序列 匹配片段 作用区域偏好 G+C含量 配对率 
mRNA序列与相应UTR中内含子序列的相互作用被引量:1
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2020年第4期384-391,共8页张强 赵小庆 薄素玲 曹艳娟 苏文霞 
内蒙古农业大学博士科研启动基金(NDYB2016-13);内蒙古农业大学基础学科科研启动基金(JC2017003);国家自然科学基金(11747084);内蒙古自然科学基金(2018BS03001)。
UTR区中的内含子对基因的表达调控过程发挥着重要的作用,它通过与相应mRNA的序列匹配方式发生相互作用并实现对基因的表达调控。采用Smith-Waterman算法进行局域比对,获得UTR区中的内含子与相应mRNA序列之间的最佳匹配片段。分析6个物种...
关键词:MRNA 内含子 局域比对 最佳匹配片段 G+C含量 
植物乳杆菌基因组研究进展被引量:2
《中国科技信息》2017年第12期64-65,共2页朱德全 张路路 尹红 张跃华 张武 刘德江 
黑龙江省教育厅应用重点项目;佳木斯大学科技创新团队项目(cxtd-2016-02);2016年黑龙江省教育厅应用重点项目
植物乳杆菌是一类可在多种环境生存的乳酸菌,具有维持肠道菌群平衡,提高机体免疫力、促进营养吸收的功能。该菌广泛应用在食品发酵、工业生产以及医疗保健等领域。近几年,植物乳杆菌逐渐采用基因组序列揭示其部分益生特性和生理特征,到...
关键词:植物乳杆菌 基因组 革兰氏阳性菌 最适生长温度 发酵制品 兼性厌氧 G+C含量 降低胆固醇 
利用不同G+C含量细菌基因组评估细菌ncRNA基因预测工具被引量:1
《微生物学通报》2014年第12期2583-2592,共10页刘林梦 温权 欧竑宇 
国家自然科学基金项目(No.31170082);高等学校博士学科点专项科研基金项目(No.20130073110062)
【目的】为识别已完成全测序细菌基因组中的ncRNA基因,对3个常用ncRNA预测工具s RNAPredict、PORTRAIT和s RNAscanner进行评估。【方法】选择了细菌ncRNA数据库BSRD收录的含有已知ncRNA基因数目大于30的9个细菌基因组,并按基因组G+C含...
关键词:细菌ncRNA基因 基因组G+C含量 转录起始区域 转录终止区域 预测 
细菌ncRNA基因预测工具的评估
《微生物学通报》2014年第12期2582-2582,共1页金城 
细菌非编码RNA(ncRNA)在RNA的转录调节、染色体复制、RNA加工与修饰、m RNA翻译与稳定性、蛋白质降解与转运以及细菌感染等许多过程中都发挥着重要作用[1]。目前,基于实验鉴定的细菌ncRNA,已开发出不同的生物信息学预测方法[3-6],其中...
关键词:细菌ncRNA基因 G+C含量 预测 
猪伪狂犬病病毒载体重组疫苗研究进展被引量:13
《中国预防兽医学报》2014年第2期160-164,共5页王林青 郑兰兰 李坤 陈红英 李文增 李坤陶 崔保安 
河南省重大科技专项(111100110300);河南省科技发展计划项目(132102110175);郑州师范学院校级课题资助项目(2012079)
猪伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)又名猪疱疹病毒I型(SuidherpesvimstypeI),属于疱疹病毒科(Herpesviridae)甲亚科(Alphaerpesvirinae)水痘病毒属(Varicellovirus),为线状双股DNA病毒,全长约150kb,含有77个读码...
关键词:猪伪狂犬病病毒 重组疫苗 病毒载体 疱疹病毒 DNA病毒 G+C含量 痘病毒 
幽门螺杆菌可塑区的结构及功能研究进展
《医学检验与临床》2014年第1期48-50,共3页王明义 谷玉峰 杨亚超 王少波 岳静 郝俊玲 
江苏省普通高校研究生科研创新计划项目,山东省医药卫生科技发展计划
比较菌株H.pyloriJ99和26695的基因组序列时发现,约占3~4%基因组的基因片段G+C含量为34~35%,低亍H.pylori整体G+C含量(39%),被命名为可塑区。可塑区具有明显的菌株特异性,推测与其致病性关的新基因可能位于该区.研究表...
关键词:幽门螺杆菌 H PYLORI 基因组序列 G+C含量 结构 流行病学调查 基因片段 致病性 
临床分离的嗜麦芽窄食单胞菌的特征分析及耐药性变迁被引量:2
《中华传染病杂志》2013年第4期212-215,共4页胡立芬 叶英 许夕海 沈为华 李旭 李家斌 
基金项目:国家自然科学基金资助项目(81101313,81172737)
嗜麦芽窄食单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia,SMA)属于非发酵菌,是一种革兰阴性极生多鞭毛杆菌,专性需氧,不形成芽孢,在血平板上有强的氨味,呈B溶血。1958年Hugh首次从口腔肿瘤患者咽拭子中发现该菌,称为嗜麦芽假单胞菌(P...
关键词:嗜麦芽窄食单胞菌 耐药性变迁 临床分离 嗜麦芽假单胞菌 嗜麦芽黄单胞菌 G+C含量 非发酵菌 革兰阴性 
散斑壳属两近似种的表型性状和ITS序列分析比较研究
《菌物学报》2010年第3期357-364,共8页顾婷婷 林英任 王士娟 高小明 陈莉 陈江琳 
国家自然科学基金(No.30870014;30770006);教育部高校博士点专项科研基金(No.20070364002);安徽省自然科学基金(No.070411005)
对针叶树散斑壳Lophodermium conigenum与其近似种南方散斑壳L.australe的形态学特征及生态习性等进行了比较研究,同时对这两个种8个菌株的rDNA-ITS区进行了PCR扩增和序列测定,结合GenBank中16个相关ITS序列构建了系统发育树。结果表明,...
关键词:形态学特征 分子性状 G+C含量 系统发育分析 
马立克氏病毒及其载体的研究进展
《中国牧业通讯》2009年第13期9-10,共2页潘青 赵冬凤 胡雪静 刘丽 刘倩 董建伟 
1 分子生物学特性 马立克氏病病毒(MDV)基因组为双股线性DNA,长度约为175kb。MDV的DNA浮力密度为1.706g/mL,碱基组成的G+C含量为46%。火鸡疱疹病毒(HVT)DNA浮力密度和G+C含量与MDV相似。裸露的病毒DNA对单层细胞和易感鸡都...
关键词:马立克氏病毒 火鸡疱疹病毒 分子生物学特性 病毒DNA 马立克氏病病毒 G+C含量 载体 碱基组成 
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