基因组序列

作品数：742被引量：926H指数：12
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独蒜兰属叶绿体基因组序列及密码子偏好性分析
《西南林业大学学报(自然科学)》2025年第2期66-75,共10页陶爱恩 尹成龙 李娅波 张玥 海永林 赵飞亚 
云南省科技厅基础研究计划面上项目(202101AT070001)资助;云南省教育厅科学研究基金项目(2022J1214)资助;云南省大学生创新创业训练计划项目(SC20201332804,SC20211332803,SC202213328004)资助;丽江市科技计划项目(2023LJSNK09)资助;丽江市中青年学术和技术带头人后备人才项目资助;校级中青年学术和技术带头人后备人才项目资助。
为探讨独蒜兰属叶绿体基因组中密码子的使用模式,选取独蒜兰属的16个物种作为研究对象,通过使用Codon W 1.4.2软件以及在线工具CUSP,分析了独蒜兰属密码子的GC含量、相对密码子使用度(RSCU)、有效密码子数(ENC)等参数,并进行了中性绘图...
关键词：独蒜兰属 叶绿体 基因组 密码子 偏好性 
长春地区柯萨奇病毒A6型全基因组特征分析
《中国卫生工程学》2024年第6期728-732,共5页乔凤娟 孙炳欣 张兴国 李晨光 阴媛 张舒峰 
吉林省卫生健康科技能力提升项目(2022GW017)。
目的 分析长春市柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)样本的全基因组特征。方法 选取2019—2022年长春市8份手足口病患儿粪便样本,制备悬液,提取RNA,采用Illumina二代测序技术进行全基因组扩增和测序,利用MegAlign、MEGA11、RDP4、Simplot等生物学...
关键词：柯萨奇病毒A6型(CV-A6) 基因组序列 重组分析 系统进化 长春市 
侵染北京、宁夏和内蒙古番茄的番茄黄曲叶病毒的鉴定和全基因组分析
《植物保护》2024年第5期56-62,共7页陈威 赵鑫茹 周惠 史娟 杨长楷 杨育揆 江彤 周雪平 杨秀玲 
国家重点研发计划(2022YFD1401200);周雪平专家工作站(202205AF150047)。
为明确从北京、宁夏和内蒙古采集的15份疑似病毒感染的番茄样本是否感染番茄黄曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV),利用TYLCV的特异性引物对采集的样本进行检测,结果从8个样本中扩增到TYLCV片段,并获得了8个样本TYLCV的全...
关键词：番茄黄曲叶病毒 PCR 基因组序列 
耐铬Serratia sp. CM01基因组序列及铬代谢基因分析
《生物物理学》2024年第3期39-50,共12页吴焰清 李星龙 王梦佳 肖虹 
以耐铬(VI)菌株Serratia sp. CM01为研究对象,探究其全基因组信息,挖掘其潜在的铬代谢相关基因。本研究采用基因组测序技术对CM01进行全基因组测序并分析其基因序列特征;同时,结合前期差异蛋白研究结果,进行铬代谢相关基因分析。测序结...
关键词：Serratia sp. CM01 全基因组测序 生物信息学 铬代谢相关基因 
侵染中国河北大豆的大豆花叶病毒的鉴定和全基因组序列分析
《植物保护》2024年第4期39-47,共9页杨菲 张明振 周雪平 李方方 
国家自然科学基金(31972244,32172385)。
本研究利用小RNA深度测序技术在河北卢龙大豆叶片上检测到6株大豆花叶病毒(soybean mosaic virus,SMV),命名为SMV-Gm1~SMV-Gm6。根据小RNA深度测序结果和参考基因组序列设计引物克隆了SMV河北分离物的基因组序列。测序结果经拼接后获得...
关键词：大豆花叶病毒 小RNA深度测序 基因组序列 
两个高质量菠菜野生种基因组序列发布
《农业科技与信息》2024年第6期122-122,共1页
近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所叶菜类蔬菜遗传育种创新团队发布了两个高质量菠菜野生种基因组序列,揭示其染色体结构,并挖掘大量与驯化相关的基因,为进一步利用菠菜野生资源、培育优质菠菜品种提供了借鉴。该研究从头组装了两个高...
关键词：染色体结构 叶菜类蔬菜 野生种 栽培种 基因组序列 创新团队 遗传育种 菠菜 
在中国广东侵染胜红蓟的中国胜红蓟黄脉病毒的鉴定和全基因组分析被引量：1
《植物保护》2024年第3期266-271,共6页乔蕊 周雪平 李方方 
国家自然科学基金(32172385)。
2022年9月在广东省罗定市发现了叶片表现为黄色网状症状的胜红蓟病株。为了明确胜红蓟叶片的黄脉症状是否由双生病毒感染引起,本研究使用检测双生病毒的简并引物PA/PB进行PCR扩增,获得约500 bp的片段。根据该序列设计特异性引物扩增并...
关键词：中国胜红蓟黄脉病毒 PCR技术 基因组序列 系统发育分析 
一株野鸭源禽副黏病毒6型的基因组特征分析
《中国动物检疫》2024年第6期32-37,65,共7页丁雨 李旭勇 陈璐 张昕悦 于晓慧 周婉婷 王静静 刘华雷 
国家重点研发计划项目(2022YFD1800600)。
为了解我国野生水禽中禽副黏病毒6型(APMV-6)的生物学特性,对2020年分离的1株野鸭源APMV-6(Wild duck/Shandong/W683/2020)进行了基因组测序及序列分析。结果显示:该APMV-6分离株基因组为单股负链RNA,基因组长度为16230 nt,基因组结构为...
关键词：禽副黏病毒6型 野鸭 基因组序列 
高等生物中基因组序列8-mer频谱分布模式及其在物种进化研究中的应用
《基因组学与应用生物学》2024年第2期228-240,共13页杨振华 王丽 郑燕 
内蒙古自然科学基金项目(2018BS03021);内蒙古自治区高等学校科学技术研究项目(NJZY23086)共同资助。
基因组序列的8-mer频谱具有物种特异性,解读8-mer频谱内在规律,对于揭示基因组序列的结构组成和进化模式具有重要的意义。本研究统计了66个物种的8-mer频谱分布,发现高等哺乳动物8-mer频谱分布以三峰为主,鸟类和爬行类动物频谱分布以双...
关键词：基因组序列 8-mer频谱 分离性 系统发育树 
基因突变,到底是好还是坏
《大众健康》2024年第2期108-109,共2页袁越 
人类基因组计划完成于2003年4月14日。当时除了人类,科学家们只测出了小鼠、大鼠和黑猩猩这3种哺乳动物的全基因组序列,很难作出全面的横向对比。科学家们发现,如果没有横向对比,单从人类基因组序列出发,很难得出太多有意义的结论。于是...
关键词：人类基因组计划 人类基因组序列 基因突变 横向对比 黑猩猩 全基因组序列 哺乳动物 大鼠 
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