部分序列分析

作品数:86被引量:437H指数:11
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番茄褐色皱纹果病毒分子检测与基因组部分序列分析
《华北农学报》2024年第3期179-186,共8页华明艳 宋兰芳 崔少杰 孙海波 金凤媚 
国家重点研发项目(2023YFD1201503);天津市农业产学研用“揭榜挂帅”项目(GBGG202313);2023年农业主导产业自主创新科研项目(22023ZYCX016,2023ZYCX017);天津市宝坻区农业科技计划项目(202102,202109)。
为了确定张家口及银川番茄产区是否发生番茄褐色皱纹果病毒病(ToBRFV),探究番茄ToBRFV的遗传信息和演化,为番茄褐色皱纹果病毒的诊断和防治及番茄抗病毒病基因工程提供重要的科学依据,采用张家口和银川两地区疑似病果进行分子检测,并利...
关键词:番茄 番茄褐色皱纹果病毒 分子检测 序列分析 
基于小RNA技术的天津地区番茄花叶病毒分子检测与基因组部分序列分析被引量:2
《华北农学报》2021年第5期176-183,共8页金凤媚 薛俊 孙海波 郝志愚 
天津市农业科技成果转化与推广项目(201901020);天津市科技计划项目(19YFYZSN00090,21ZYCGN00420)。
为了明确引起天津地区番茄果实褐化的病因,采用小RNA深度测序技术和RT-PCR技术对采自天津的番茄病样进行鉴定分析。结果表明,引起天津地区番茄果实变褐的病原为番茄花叶病毒。进一步对该病毒进行了全基因组测序,并对该病毒的外壳蛋白(CP...
关键词:番茄 番茄花叶病毒 小RNA深度测序 分子检测 基因序列分析 
基于D-loop区部分序列分析黔、陕、湘3个大鲵种群系统发育关系和遗传分化被引量:2
《基因组学与应用生物学》2017年第4期1477-1483,共7页吴俣学 黄仁元 姚俊杰 晏宏 黄胜 戴铭恒 吴艳 周红霞 
贵州省农委项目(黔财农[2014]233);贵州省现代农业产业体系(GZCYTX2013-01102);贵州大学研究生创新基金(研农2016023);贵州大学大学生SRT项目(贵大SRT字(2015)095号)基金共同资助
为弄清贵州大鲵群体与中国其他大鲵群体的遗传关系,探究贵州大鲵种群遗传背景,本研究测定了贵州、陕西、湖南共82条大鲵的mt DNA D-loop区部分序列,进行系统发育关系和遗传分化的分析。结果显示:82条序列中共检出7种单倍型序列,贵州大...
关键词:大鲵 D-LOOP 系统发育关系 遗传分化 
宠物犬布氏杆菌的PCR检测及部分序列分析被引量:3
《畜牧兽医学报》2016年第12期2520-2525,共6页孙明 刘巧荣 宋文静 乔明明 顾强 张谦 刘伯华 杨雪松 陈西钊 
"十三五"国家重点研发计划(2016YFD0501006)
对北京关忠动物医院送检的2例疑似感染布氏杆菌宠物犬的7份分泌物进行了布氏杆菌普通PCR、快速实时荧光PCR检测和Multi-PCR鉴定,并对部分基因序列测序分析,旨在对宠物犬感染犬布氏杆菌作出确诊,为宠物犬感染布氏杆菌诊断与防控提供资料...
关键词:布氏杆菌 宠物犬 PCR检测 序列分析 
山西西葫芦花叶病病原鉴定与部分序列分析被引量:5
《山西农业大学学报(自然科学版)》2016年第5期310-314,363,共6页王德富 时晓丽 寇丽莎 庞小静 刘勇 牛颜冰 
公益性行业(农业)科研专项(No.201303028);山西农业大学科技创新基金(20142-10);山西农业大学引进人才科研启动基金(2014YJ05)
利用双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)技术和非序列依赖PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)方法对感病西葫芦进行了分子鉴定。序列测定及分析发现,具有明显花叶和斑驳症状的西葫芦受到黄瓜花叶病毒(Cucumber mosa...
关键词:西葫芦 黄瓜花叶病毒 病原鉴定 序列分析 
天津地区番茄褪绿病毒的分子检测与基因组部分序列分析被引量:8
《华北农学报》2016年第2期23-27,共5页金凤媚 薛俊 宋建 于海涛 段红英 
天津市农业科技成果转化与推广项目(201302040);国家星火计划(2015GA610002)
为了确定天津番茄产区是否发生了番茄褪绿病毒病,了解该病毒天津分离物的主要基因是否发生变异,对该地区发生的To CV进行了分子检测,并对该病毒的外壳蛋白(CP)和热激蛋白70类似物(Hsp70h)的核苷酸和氨基酸进行了序列分析。结果表明,天...
关键词:番茄褪绿病毒 分子检测 外壳蛋白 热激蛋白70类似物 基因序列分析 
基于线粒体DNAD-loop区部分序列分析舟山海域带鱼种群遗传结构被引量:12
《水生生物学报》2015年第2期408-413,共6页郑文娟 杜一超 林洁 蒋晨华 丁沃娜 朱世华 
浙江省教育厅一般科研项目(Y201430356);宁波大学校级科研项目(XYL14030)资助
带鱼(Trichiurus lepturus Linnaeus),俗称刀鱼、白带鱼,隶属鲈形目(Perciformes),带鱼科(Trichiuridae),带鱼属(Trichiurus),广泛分布于世界各温热带海域,在我国主要分布在东海、南海、黄海和渤海[1]。带鱼为我国最重要的捕捞...
关键词:带鱼 线粒体DNA D-LOOP区 遗传多样性 舟山 
白术矮化病毒病病原的分子鉴定和部分序列分析被引量:9
《植物病理学报》2014年第4期357-362,共6页牛颜冰 时晓丽 赵慧琪 张西梅 赵保佳 
山西农业大学"中青年学术带头人及学术骨干"专项资金;山西省自然科学基金(2012011032-5)
本试验在生物学接种的基础上,利用非序列依赖性PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)对白术矮化病毒病病原进行了分子鉴定,序列测定及分析。结果发现,具有矮化症状的白术为黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)所侵染...
关键词:白术 黄瓜花叶病毒 系统进化树分析 
侵染藠头的大蒜潜隐病毒分子鉴定及部分序列分析
《植物病理学报》2013年第4期440-443,共4页吴承春 洪霓 刘勇 徐文兴 王国平 
国家农业行业专项计划(nyhyzx200903017-08)
藠头(Allium chinenseG.Don),为百合科葱属鳞球茎多年生植物,是一种高产、高营养和具有食疗作用的蔬菜类作物,也常作为中药材加以利用和研究。国内外学者对发生在葱属植物上的病毒病原鉴定和分类做了深入研究,但针对蓖头病害的...
关键词:大蒜潜隐病毒 序列分析 分子鉴定 藠头 侵染 病原鉴定 葱属植物 多年生植物 
基于rDNAITS和beta-tubulin gene部分序列分析灵芝属菌株的遗传关系被引量:5
《食用菌学报》2012年第3期37-41,共5页唐传红 苏春丽 张劲松 杨焱 唐庆九 贾薇 冯娜 刘艳芳 吴迪 
科技部农业科技成果转化资金(编号:2012GB2C000148)的部分研究内容
联合ITS序列和beta-tubulin基因部分序列的系统发育分析将分属于8个种的38株菌株分为9个聚类群,聚类结果与物种结果基本一致,只有少数几个菌株,如GL81菌株聚类结果与拉丁名不符,可能由于来源地给出的定名不够准确。根据结果联合信息分...
关键词:灵芝 ITS beta-tubulin基因 遗传多样性 
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