叶绿体基因组

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红凤菜叶绿体全基因组特征及其序列比较分析
《种子》2024年第11期33-41,48,共10页赵夏云 瞿飞 杨静 周麟笔 刘炼 文林宏 
2024年贵州省蔬菜产业技术体系项目(GZSCCYJSTX);贵州省科技支撑项目(黔科合支撑[2022]重点019号);贵州省科研机构创新能力建设专项资金项目(黔科合服企[2022]005);贵州特色园艺作物种质资源收集、创新及利用项目(黔农科种质资源[2023]17号)。
为了更好地了解红凤菜叶绿体基因组(cpDNA)特征及其进化关系,本研究对红凤菜cpDNA进行了测序、组装和注释,并与近缘种进行比较分析。结果表明,红凤菜cpDNA全长为150929 bp,总GC含量为37.18%,包含一个大单拷贝区(LSC,83112 bp)、一个小...
关键词：红凤菜 叶绿体基因组 系统发育分析 
贵州特有植物平坝槭叶绿体基因组特征分析
《种子》2024年第9期1-7,15,共8页周艳 李婧 文香英 
国际植物园保护联盟项目(BGCI30432);国家自然科学基金委员会-贵州省人民政府喀斯特科学研究中心项目(U1812401)。
为研究贵州特有植物平坝槭叶绿体基因组结构与特征,以平坝槭新鲜叶片为材料,提取叶绿体DNA旨在对其基因组进行测序和组装,并进行相关分析。结果表明,平坝槭的叶绿体基因组长度为155069 bp,由大单拷贝区(LSC,84840 bp)、小单拷贝区(SSC,1...
关键词：平坝槭 叶绿体基因组 密码子偏好性 系统发育分析 
倒刺狗尾草叶绿体基因组特征及系统发育分析
《种子》2024年第8期45-51,59,共8页刁玉霖 李竑阳 张海金 张文飞 王凯玺 朱康宁 张蒙 孙鑫 李前 陈国秋 
国家现代农业产业技术体系(CARS-06-14.5-B15);辽宁省民生计划项目(2021JH2/10200029);辽宁省建平县杂粮产业乡村振兴科技特派团(2023020322-JH5/104);谷子产业提升技术示范推广(2024-XCZX-A2-72);辽宁省农业科学院院长基金项目(2024QN1813)。
为了对倒刺狗尾草叶绿体基因组的基本特征和系统发育进行分析,本研究对倒刺狗尾草的叶绿体基因组进行了测序,并对测序结果进行组装、注释和特征分析,并以拟南芥为外类群,利用15种已知叶绿体基因组的禾本科植物构建系统发育树。结果表明...
关键词：倒刺狗尾草 叶绿体基因组 系统发育 
草珊瑚与海南草珊瑚叶绿体基因组结构及系统发育关系分析
《种子》2024年第5期56-63,69,共9页何艳妮 黎前利 杨武海 吴之坤 
国家自然科学基金委员会——贵州省人民政府联合基金项目(U1812403-2);贵州省科技计划项目(黔科中引地[2022]4016)。
利用Illumina全基因组测序数据组装了草珊瑚和海南草珊瑚叶绿体全基因组,两者总GC含量均为39%;草珊瑚叶绿体基因组总大小为158881 bp,包含一个88169 bp的大单拷贝区(LSC)、一个18446 bp的小单拷贝区(SSC)和一对26133 bp的反向重复区(IR...
关键词：草珊瑚属 叶绿体基因组 系统发育分析 
‘波邦’咖啡叶绿体基因组密码子使用特征研究
《种子》2024年第4期27-36,共10页李亚麒 李贵平 李亚男 付兴飞 黄家雄 毕晓菲 喻好好 刘德欣 胡发广 
云南省科技计划项目创新引导与科技型企业培育计划(202204BP090205);云南省农业联合专项(202301BD070001-215)。
本研究对小粒咖啡‘波邦’叶绿体基因组进行系统分析,探讨影响密码子使用偏性形成的因素。结果表明,‘波邦’叶绿体基因组密码子偏好性较弱,倾向于A/T结尾的密码子。ENC-GC3s绘图、PR2绘图以及中性绘图分析表明,‘波邦’密码子偏好性受...
关键词：‘波邦’ 小粒咖啡 叶绿体基因组 密码子偏好性 表达效率 
CITES监管植物习志野叶绿体基因组结构特征及系统发育分析
《种子》2024年第3期18-25,F0002,共9页陈云霞 南程慧 吴显坤 黄娅琳 薛晓明 
江苏高校“青蓝工程”(2021);公安部理论及软科学研究计划项目(2020LLYJSLJY041);江苏省“十四五”重点建设学科“公安技术”项目(2022)。
利用二代测序技术Illumina平台对CITES附录监管物种习志野(Tephrocactus geometricus)进行叶绿体全基因组测序与组装,并对其基因组结构特征及系统进化关系进行分析。结果表明,习志野叶绿体基因组具备典型的环状四分体结构,全长116183 bp...
关键词：习志野 叶绿体基因组 结构特征 系统进化 
伊犁郁金香叶绿体基因组微卫星序列特征分析被引量：1
《种子》2023年第12期9-16,共8页秦斗文 么玉龙 冯伊玲 刘伟强 田吉婷 巨秀婷 
中国科学院“西部之光”项目(中科人字[2022]4号);青海省“昆仑英才”科技领军人才培养项目(青人才字[2022]1号)。
为明确伊犁郁金香叶绿体微卫星特征,为后续伊犁郁金香及郁金香属的系统发育、比较基因组学及遗传改良研究提供参考,同时也为郁金香属的物种分类提供新的依据,以伊犁郁金香叶绿体基因组为研究对象,运用MISA、REPuter、SPSS相关软件,对其...
关键词：伊犁郁金香 叶绿体基因组 微卫星 序列特征 
紫麻属叶绿体全基因组特征及系统发育分析
《种子》2023年第12期24-30,37,共8页秃玉翔 赵文植 沈伟祥 王飞 曹正英 辛培尧 胡青 郝佳波 
云南省“云岭学者人才专项-陆斌”。
紫麻属(Oreocnide Miq.)为荨麻科(Urticaceae)常绿灌木或乔木,全株是良好的药用材料和制麻原料。开展紫麻属叶绿体基因组的相关研究对揭示紫麻属植物的遗传多样性和系统分类具有重要意义。本研究以NCBI数据库中已发布的10个紫麻属植物...
关键词：紫麻属 叶绿体基因组 系统发育 
米槁叶绿体基因组结构及系统发育关系分析
《种子》2023年第11期1-8,共8页黎前利 吴媛 吴之坤 
国家自然科学基金委员会-贵州省人民政府联合基金项目(U1812403-2);贵州省科技计划项目(黔科中引地[2022]4016)。
本研究利用Illumina全基因组测序数据组装了米槁叶绿体全基因组:基因组总大小为152751 bp,总GC含量为39.1%,包含一个93662 bp的大单拷贝区(LSC)、一个18861 bp的小单拷贝区(SSC)和一对20114 bp的反向重复区(IRs)。整个叶绿体基因组共注...
关键词：米槁 樟科 叶绿体基因组 系统发育分析 
珍稀濒危物种无距淫羊藿叶绿体基因组结构特征与系统发育分析
《种子》2023年第11期30-37,48,共9页叶娟 魏升华 何顺志 罗琴 丁宁 王新村 严福林 
贵州省科技计划项目(黔科中引地[2022]4016);贵州省中药材现代产业技术体系建设(GZCYTX2019-2024)。
无距淫羊藿(Epimedium ecalcaratum G.Y.Zhong)为小檗科淫羊藿属形态特殊的类群之一,其分布狭窄,被IUCN列为濒危物种。本研究对无距淫羊藿叶绿体基因组结构及系统发育进行分析,以期为其遗传保护提供理论依据。结果表明,无距淫羊藿叶绿...
关键词：无距淫羊藿 叶绿体基因组 SSR 密码子偏好性 
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