叶绿体基因组

作品数:739被引量:1433H指数:32
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四种忍冬属植物叶绿体基因组结构特征及系统发育分析
《药学学报》2024年第11期3164-3171,共8页熊瑶 童凌斐 曹岚 慕泽泾 沈成英 杜小浪 
国家科技基础资源调查专项(2018FY100703);江西中医院大学校级科技创新团队发展计划(CXTD22002)。
忍冬属(Lonicera)是忍冬科(Caprifoliaceae)最大的属,忍冬科药用植物在我国历史悠久,资源丰富。由于具有观赏和药用价值,忍冬的经济价值十分突出。然而,受巨大需求和高价刺激的影响,市场上出现了严重的混杂现象。本文通过高通量测序技...
关键词:忍冬 叶绿体基因组 比较分析 系统发育关系 
白鼠尾草叶绿体基因组序列特征与系统进化分析
《药学学报》2024年第5期1484-1493,共10页房振西 季倩 胡佳栋 陈万生 李卿 
国家自然科学基金资助项目(32070327,31770329);国家重点研发计划项目(2022YFC3501700)。
白鼠尾草(Salvia apiana Jepson)是唇形科鼠尾草属多年生亚灌木植物,具有悠久的药用历史。本研究采用PacBio HiFi三代测序技术对白鼠尾草叶绿体基因组进行了测序,完成了物理图谱绘制,对其基因组序列结构特征、密码子偏好性和重复序列进...
关键词:白鼠尾草 叶绿体基因组 序列特征 密码子偏好性 系统进化 
昆明杯冠藤与青羊参叶绿体基因组特征比较及系统发育分析被引量:1
《药学学报》2024年第3期764-774,共11页耿应敏 周兴乾 张体操 郑兰平 
云南省基础研究项目(202301AT070254);云南省应用基础研究中医联合专项(202101AZ070001-056).
昆明杯冠藤和青羊参隶属于夹竹桃科鹅绒藤属,是重要的药用植物。本研究对昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组进行测序、组装,并对两者叶绿体基因组的结构特征及其系统发育位置进行了分析。结果表明,昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组均具有...
关键词:鹅绒藤属 叶绿体基因组 系统发育 高通量测序 DNA条形码 
桔梗特异DNA条形码筛选、种质资源鉴定及遗传多样性分析被引量:2
《药学学报》2024年第1期243-252,共10页王馨 石玥 满金辉 黄钰莹 张晓芹 安克露 何高洁 刘子齐 关范圆 郑语嫣 王晓晖 魏胜利 
国家重点研发计划项目(2022YFX3501505);桔梗等4种精准药材批次分子防伪技术研究项目(2020110031009385)。
中药材桔梗为桔梗科植物桔梗的干燥根,具有多种药理作用,是常用的大宗中药材。本研究利用Illumina HiSeq X Ten平台对6份来自不同产地的桔梗进行叶绿体基因组测序,筛选特异性DNA条形码,基于特异性DNA条形码对不同产区的桔梗样品的种质...
关键词:桔梗 叶绿体基因组 DNA条形码 种质资源 遗传多样性 
款冬叶绿体基因组序列特征及其系统发育分析
《药学学报》2023年第11期3439-3448,共10页净易尧 胡本祥 陈晓颖 姬海月 罗瑶 史嘉周 王帮庆 张岗 高静 杨冰月 彭亮 
国家自然科学基金资助项目(82204578);陕西省科技厅项目(2021JQ-733);公益性行业(中医药)科研专项经费项目(201507002);陕西中医药大学校级课题(2020GP06);陕西中医药大学“秦药”品质评价及资源开发学科创新团队项目(2019-QN01)。
款冬Tussilago farfara L.为菊科植物Compositae款冬属Tussilago多年生草本植物,其干燥花蕾及叶具有良好的生物活性成分,在我国及欧洲地区药用历史悠久。本文对款冬全叶绿体基因组特征、序列重复、结构变异和系统发育进行了研究,利用Ill...
关键词:款冬 菊科植物 叶绿体基因组 序列分析 系统发育 
北苍术特异性DNA条形码筛选、种质资源鉴定及遗传多样性分析被引量:8
《药学学报》2023年第6期1693-1704,共12页尹光耀 袁林 王馨 张志飞 陈颖 刘珊瑚 满金辉 石玥 黄钰莹 张晓芹 王晓晖 魏胜利 
北苍术、赤芍精准药材批次分子防伪技术研究项目(2020110037009381);北京市科学技术委员会基金项目(Z201100005420005)。
北苍术Atractylodes chinensis具有重要药用价值和经济价值。本研究利用Illumina平台测序获得4份不同产地的北苍术的叶绿体全基因组序列,筛选特异DNA条形码,并利用特异DNA条形码对不同产区北苍术样品种质资源鉴定及居群的遗传多样性分...
关键词:苍术 叶绿体基因组 DNA条形码 单倍型 遗传多样性 
尾花细辛与花叶细辛叶绿体基因组比较及系统发育分析被引量:1
《药学学报》2023年第5期1364-1371,共8页柏国清 卢元 尉倩 刘安成 李仁娜 丛晓峰 周军辉 陈尘 
陕西省科学院科技计划项目(2017K-12,2021K-10);陕西省重点研发计划项目(2021SF-391);陕西省自然科学基础研究计划项目(2022JM-458);陕西省创新能力支撑计划项目(2022KJXX-27)。
本研究通过Illumina高通量测序技术对细辛属药用植物尾花细辛(Asarum caudigerum Hance)和花叶细辛(A.cardiophyllum Franchet)进行了叶绿体基因组测序,利用生物信息学分析方法进行组装、注释和结构特征分析,并与已发表的12个马兜铃科...
关键词:细辛属 尾花细辛 花叶细辛 叶绿体基因组 系统发育 
大叶百两金和细柄百两金叶绿体全基因组解析及系统发育分析被引量:1
《药学学报》2023年第1期217-228,共12页曾宪法 刘畅 杨小英 余庆 扶世伦 鄢藤云 蒲翔 
国家重点研发计划项目(2018YFC1708100);贵州省中医药管理局中医药、民族医药科学技术研究课题(QZYY-2021-098);贵州中医药大学2021年度科研创新和探索专项(2018YFC170810101);贵州省“十四五”中医药、民族医药重点学科[QZYYZDXK(JS)-2021-03]。
百两金Ardisia crispa (Thunb.) A. DC.为传统苗药药材,在治疗咽喉痛、扁桃腺炎、肾炎水肿及跌打风湿等方面具有显著疗效。大叶百两金Ardisia crispa var. amplifolia和细柄百两金Ardisia crispa var. dielsii是百两金的变种,两者在物...
关键词:紫金牛属 大叶百两金 细柄百两金 叶绿体基因组 系统发育 
八角枫及其亚种叶绿体基因组序列结构及系统发育分析被引量:6
《药学学报》2022年第10期3229-3239,共11页杨小英 刘畅 曾宪法 刘雄伟 赵杰宏 俸婷婷 周英 
国家重点研发计划项目(2018YFC1708100);贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2019]5407);贵州省“十四五”中医药、民族医药重点学科[QZYYZDXK(JS)-2021-03];贵州省中医药管理局中医药、民族医药科学技术研究课题(QZYY-2021-098);贵州中医药大学2021年度科研创新和探索专项(2018YFC170810101,2018YFC170810201)。
八角枫为八角枫科Alangiaceae八角枫属Alangium常用药用植物,是贵州特色苗药之一,该属植物分化强烈、形态变异复杂,各药材活性成分和药效存在显著差异。本文利用Illumina高通量测序技术对八角枫亚种(稀花八角枫、伏毛八角枫)和毛八角枫...
关键词:八角枫 亚种 叶绿体基因组 重复序列 系统发育 
红花龙胆叶绿体基因组特征及适应性进化分析被引量:4
《药学学报》2022年第10期3240-3253,共14页邓港 吴田泽 高冉冉 王梦月 刘霞 向丽 
国家自然科学基金委-贵州喀斯特中心项目(U1812403-1);国家重点研发计划资助项目(2019YFC1711100)。
红花龙胆(Gentiana rhodantha)为特色苗族药材,在治疗湿热黄疸、小便不利、肺热咳嗽等方面具有显著疗效,但在物种进化关系及分类鉴定方面存在争议。本研究对红花龙胆叶绿体基因组进行了二代、三代测序,并分析其结构特点及适应性进化分...
关键词:红花龙胆 叶绿体基因组 系统发育 适应性进化 密码子 简单重复序列 
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