蛋白质结构预测

作品数:225被引量:488H指数:9
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A wound-induced small polypeptide gene family is upregulated in soybean nodules被引量:2
《Chinese Science Bulletin》2013年第9期1003-1009,共7页LI XiaoLin XU Ji YU GuanQiao LUO Li 
supported by National Key Basic Research Program of China(2011CB100702 and 2010CB126501);National Natural Science Foundation of China(31070218);Shanghai Municipal Natural Science Foundation(09ZR1436500);Knowledge Innovation Program of Chinese Academy of Sciences(2009KIP206)
Small peptides function as key signals in processes,such as plant cell differentiation,organ development and defenses to biotic stresses.A large number of small peptide precursor genes have been predicted from the ana...
关键词:基因家族 大豆根瘤 多肽 创伤诱导 蛋白质结构预测 第6号染色体 绿色荧光蛋白 12号染色体 
Dehouck-Gilis-Rooman统计势能函数的简化
《生物信息学》2013年第1期22-28,共7页陆文伟 黄日波 杜丽琴 韦宇拓 
国家973项目2009CB724703;国家自然科学基金31060125资助
统计有效能函数(Statisticaleffectiveenergyfunction(SEEF))又称统计势能函数,来源于对已知蛋白质结构数据库进行的统计分析。近年来Dehouck-Gilis-Rooman(DGR)小组通过将蛋白质结构的总体统计势能分解成低阶的势能项之和,提出了一种...
关键词:诱导蛋白数据集 能量函数性能 蛋白质结构预测 统计有效能函数 富集 
天然无序蛋白质:序列-结构-功能的新关系被引量:27
《物理化学学报》2010年第8期2061-2072,共12页黄永棋 刘志荣 
国家自然科学基金(20973016、10721403);国家重点基础研究发展计划项目(973)(2009CB918500);教育部留学回国人员科研启动基金资助~~
天然无序蛋白质是一类新发现的蛋白质,它们在天然条件下没有确定的三维结构,却具有正常的生物学功能,广泛参与信号传递、DNA转录、细胞分裂和蛋白质聚集等重要的生理与病理过程.无序蛋白质的发现是对传统的蛋白质"序列-结构-功能"范式...
关键词:天然无序蛋白质 蛋白质折叠 蛋白质相互作用 分子识别 蛋白质结构预测 药物设计 
小麦谷蛋白分子结构研究进展被引量:3
《生物技术》2009年第1期89-93,共5页杨曦 黄伟伟 汪越胜 杨广笑 何光源 
国家"973"计划项目资助(2002CB111302)
小麦谷蛋白是影响面团弹性及烘焙品质的重要因素,有机大分子的结构决定其功能性,因此了解小麦谷蛋白的结构与组成是研究面粉品质的基础。本文综述了近年来国内外利用蛋白质分离技术、多肽合成技术、质谱光谱分析技术及扫描穿隧显微技术...
关键词:麦谷蛋白 面粉品质 分子结构 蛋白质结构预测 二硫键 
蛋白质三维结构预测问题的求解方法被引量:1
《华中科技大学学报(自然科学版)》2007年第9期98-100,共3页许如初 李红华 
国家重点基础研究发展计划资助项目(G1998030600);国家自然科学基金资助项目(10471051)
对蛋白质结构预测问题进行了描述,根据蛋白质结构预测问题在三维欧氏空间的连续模型,通过拟物策略找到了相应的数学模型.由于引入了弹性势能和嵌入势能,将一个有约束的问题转化为一个无约束的问题,并在梯度下降法求解的基础上,设计出一...
关键词:蛋白质结构预测 拟物算法 折叠 弹性势能 嵌入势能 
蛋白质结构预测的拟物拟人算法研究
《计算机应用研究》2007年第8期45-47,共3页许如初 秦明 黄文奇 
国家"973"计划资助项目(NKBRPC:2004CB318000);国家自然科学基金资助项目(10471051)
根据国际上最新提出的蛋白质结构预测问题的三维欧氏空间连续模型,找到了相应的物理模型,并且设计了适当的拟人策略,形成了相应的拟物拟人算法。
关键词:蛋白质结构预测 蛋白质折叠 拟物拟人算法 弯曲势能 距离势能 
马铃薯水通道蛋白基因cDNA克隆、序列分析及表达被引量:8
《农业生物技术学报》2007年第4期677-683,共7页吴旺泽 彭晓莉 王晓明 王蒂 
国家基础研究发展规划(973)项目(No.2006CB708200);甘肃省农业厅项目(No.GNSW-2006-01)资助
以干旱胁迫处理的马铃薯(Solanum tuberosum L.)普通栽培种Gannongshu No.2叶片为材料,提取总RNA,采用RT-PCR方法,扩增出编码288aa序列的水通道蛋白基因StPIP1(Solanum tuberosum L.plasma membrane intrinsic protein gene)cDNA,GenBan...
关键词:马铃薯 水通道蛋白 基因克隆 序列分析 蛋白质结构预测 瞬时表达 
蛋白质三维连续模型结构预测的高效算法被引量:2
《计算机工程与科学》2007年第4期68-71,共4页陈克宾 黄文奇 
国家973计划资助项目(1998030600)
为了解生物学上蛋白质的空间构成情况,通过对生物学上蛋白质实际空间组成结构的分析,本文提出了一种抽象的蛋白质三维结构连续数学模型与之对应,应用拟物的方法找到了对应于此数学模型的物理模型,并且用数学方法客观、精准地对该模型进...
关键词:蛋白质结构预测 折叠 引力势能 局部最小能量 
求解非格点模型的蛋白质结构预测问题的拟物拟人算法
《小型微型计算机系统》2006年第10期1889-1892,共4页刘景发 黄文奇 
国家"九七三"项目(2004CB318000)资助;国家自然科学基金项目(10471051)资助.
本文研究了一个具有两种氨基酸(疏水氨基酸和亲水氨基酸)的三维非格点的蛋白质模型.受物理世界的物体间相互作用的规律和人类社会生活经验的启发,给出了该模型蛋白质结构预测问题的拟物拟人算法.计算结果表明被提出的方法在非格点的蛋...
关键词:蛋白质结构预测 三维非格点模型 拟物拟人算法 NP难度问题 
求解蛋白质结构预测问题的局部搜索算法被引量:4
《计算机科学》2005年第11期148-149,151,共3页吕志鹏 黄文奇 
国家973计划(批准号:G1998030600)资助项目
蛋白质结构预测问题是计算生物学领域的核心问题之一。通过理论计算的方法根据蛋白质氨基酸序列直接预测其空间结构是解决这一问题的有效途径。构造了新的邻域结构,采用了部分随机跳坑策略,对此问题提出了新的局部搜索算法。计算结果表...
关键词:蛋白质结构预测 格点模型 局部搜索 跳坑 局部搜索算法 蛋白质结构 预测问题 CARLO方法 求解 理论计算 
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