王树林

作品数:12被引量:46H指数:4
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供职机构:湖南大学更多>>
发文主题:基因表达谱DNA序列生物信息学RNA-SEQ基因更多>>
发文领域:自动化与计算机技术电子电信生物学医药卫生更多>>
发文期刊:《电脑开发与应用》《生物物理学报》《计算机工程》《计算机学报》更多>>
所获基金:国家自然科学基金湖南省自然科学杰出青年基金湖南省教育厅优秀青年基金更多>>
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基于神经网络的多类肿瘤亚型识别研究被引量:2
《计算机工程与应用》2008年第11期237-240,共4页阳少林 王树林 
湖南省杰出青年自然科学基金(the Excellent Youth Foundation of Hunan Province under Grant No.06JJ1010)。
基于基因表达谱建立具有有效预测性的肿瘤分类模型对肿瘤的临床诊断与治疗具有非常重要的意义。针对肿瘤亚型识别问题,所要解决的一个关键问题就是发现决定肿瘤亚型的一组特征基因子集。提出了一个组合式的肿瘤信息基因选择策略:首先从...
关键词:肿瘤 基因表达谱 特征基因 特征选取 神经网络 
肿瘤信息基因启发式宽度优先搜索算法研究被引量:17
《计算机学报》2008年第4期636-649,共14页王树林 王戟 陈火旺 李树涛 张波云 
湖南省自然科学杰出青年基金(06JJ1010)资助~~
基于基因表达谱的肿瘤检测方法有望成为临床医学上一种快速而有效的肿瘤分子诊断方法,但由于基因表达谱数据存在维数过高、样本量很小以及噪音很大等特点,使得肿瘤信息基因选择成为一件有挑战性的工作.根据肿瘤基因表达谱样本集的特点,...
关键词:基因表达谱 肿瘤分类 信息基因选择 支持向量机 全折交叉验证方法 
k-长DNA子序列计数算法研究被引量:2
《计算机工程》2007年第9期40-42,共3页王树林 王戟 陈火旺 张鼎兴 
国家自然科学基金资助项目(60233020)
基因组的结构与功能存在密切联系,其功能主要通过DNA子序列来表达,因此研究DNA序列结构对于生物信息学来说具有重要的意义。该文研究了k-长DNA子序列在DNA全序列中出现频数的计数问题,设计并实现了k-长DNA子序列内部计数算法和外部计数...
关键词:k-长DNA子序列 DNA序列 B树 全基因组 
基于主成份分析的肿瘤分类检测算法研究被引量:9
《计算机工程与科学》2007年第9期84-90,共7页王树林 王戟 陈火旺 张波云 
国家自然科学基金资助项目(60233020)
基于基因表达谱的肿瘤诊断方法有望成为临床医学上一种快速而有效的诊断方法,但由于基因表达数据存在维数过高、样本量很小以及噪音大等特点,使得提取与肿瘤有关的信息基因成为一件有挑战性的工作。因此,在分析了目前肿瘤分类检测所采...
关键词:支持向量机 基因表达谱 肿瘤分类 主成份分析 
基于集成神经网络的计算机病毒检测方法被引量:6
《计算机工程与应用》2007年第13期26-29,共4页张波云 殷建平 张鼎兴 蒿敬波 王树林 
国家自然科学基金(the National Natural Science Foundation of China under Grant No.60373023);湖南省教育厅优秀青年基金资助项目(No.05B072)。
在借鉴传统的特征扫描技术的基础上,提出了一种基于n-gram分析的计算机病毒自动检测方法。将基于信息增益的特征选择技术引入集成神经网络的构建中,结合Bagging算法,同时扰动训练数据和输入属性生成精确且差异度大的个体分类器,在此基...
关键词:计算机病毒 集成学习 信息增益 BP神经网络 
基于分形的DNA序列可视化表示研究被引量:1
《计算机科学》2006年第7期158-163,共6页王树林 王戟 陈火旺 张波云 
国家自然科学基金资助项目(60233020)
DNA序列可视化表示对于研究其结构与功能具有至关重要的意义,它有助于重复子序列的识别、内含子与外显子的区分以及DNA序列进化研究等等。本文首先介绍了生成DNA序列分形图像的Hao方法和经典的混沌游戏方法,然后深入分析和比较了这两种...
关键词:DNA序列 迭代函数系统 混沌自动机 分形 
k-长DNA子序列频数分布研究被引量:1
《生物物理学报》2006年第3期177-196,共20页王树林 王戟 陈火旺 张鼎兴 
国家自然科学基金项目(60233020)~~
在详细阐述了生成DNA序列分形图像的Hao方法后,提出一种能够直观显示k-长DNA子序列频数分布差异性的三维频数分布图生成方法。把3D频数分布图转化为1D对数频谱图,突出显示了频数分布的局部特征,提出k-长DNA子序列频数区划分准则,并详细...
关键词:DNA序列 k-长DNA子序列 三维频数分布图 非中心F分布 分形 n阶零间隔 
基于Junit自动生成类测试案例框架的实现被引量:7
《计算机工程与应用》2006年第1期89-91,共3页余波 王树林 张大方 
国家自然科学基金资助项目(编号:60473031)
论文对Java程序的抽象类、包含内隐类的接口、其它内隐类和普通类的测试提出了不同的测试案例模式,结合Liskov替代原则对类测试的要求,实现一个基于Junit生成包含测试神谕的测试案例框架的工具。借助该工具,程序员在编写测试案例时,只...
关键词:类测试 单元测试 测试神谕 自动化测试工具 
网元管理系统的一种实现方法
《电脑开发与应用》2004年第11期29-30,33,共3页张波云 张鼎兴 王树林 唐文胜 
网元管理是网络管理系统的基础,根据TMN的思想,提出了一种网元管理系统的实现方法,该系统能够实现性能管理、配置管理、故障管理以及安全管理的4个功能。给出了TMN网络管理模型图。
关键词:网元管理系统 实现方法 网络管理模型 配置管理 网络管理系统 性能管理 故障管理 TMN 功能 
网元管理系统的研究与实现被引量:1
《计算机与现代化》2004年第8期7-9,13,共4页张鼎兴 张波云 唐文胜 王树林 
TMN的提出极大地发展了网络管理系统 ,网元管理是网络管理系统的基础。本文介绍了网元管理的基本概念 ,总结出网元管理系统应该具有的 5个功能 ,并以路由器的网元管理系统为例 。
关键词:网元管理系统 TMN管理模型 SNMP 
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