王东

作品数：7被引量：15H指数：1
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供职机构：军事医学科学院生物工程研究所更多>>
发文主题：共表达红霉素DNA片段广度优先搜索算法基因工程菌更多>>
发文领域：生物学医药卫生更多>>
发文期刊：《生物技术通讯》《中国生物工程杂志》《生物工程学报》《军事医学》更多>>
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计算机重构石油烃降解的微生物代谢途径
《生物技术通讯》2012年第2期220-227,共8页王东 何涛 邵卫东 汪莉 王玉民 
国家自然科学基金(30800644);国家高技术研究发展计划(2007AA022204);国家重大新药创制专项(2008ZXJ09007-001)
目的:用计算机重构石油烃降解通路,为石油污染的生物修复提供理论依据。方法:利用KEGG反应、化合物数据提取反应等式,过滤掉所有反应中的通用化合物及小分子化合物并构建反应矩阵,然后利用广度优先搜索算法在反应矩阵中搜索降解石油烃...
关键词：石油污染 生物修复 基因工程菌 广度优先搜索算法 
红霉素大环内酯合成通路在大肠杆菌中的重建被引量：1
《生物工程学报》2012年第2期222-232,共11页何彰华 王洋 叶丙雨 师明磊 王东 范秋声 黄芬 赵志虎 
国家重大新药创制关键技术平台(No.2008ZXJ09007-01)资助~~
研究在大肠杆菌中重建了红霉素大环内酯(6-脱氧-红霉内酯B,6dEB)合成通路。先将参与6dEB合成所必需的基因分别克隆于多基因串联共表达载体中,获得单基因重组质粒;再利用载体中XbaⅠ/SpeⅠ互为同尾酶的特性实现相关基因的串联组合,获得...
关键词：6dEB 共表达 SDS-PAGE 质谱 
应用Red重组技术构建四环素抗性多基因串联表达载体被引量：1
《军事医学》2011年第10期754-757,799,共5页何彰华 师明磊 王洋 叶丙雨 黄芬 张彦 范秋声 王东 肖丽霞 张乐之 李德彬 闫兴 赵志虎 
国家重大新药创制关键技术平台(2008ZXJ09007-01)
目的构建一种四环素抗性的多基因串联表达载体。方法设计同源臂引物,通过重叠延伸PCR获取含四环素抗性基因的打靶序列,应用pKD46介导的Red重组系统,在DH5α内替换多基因串联表达载体pET-m28a(+)中的抗性基因序列;再利用同尾酶(isocaudar...
关键词：四环素抗药性 多基因串联表达载体 RED重组 质粒 红霉素 
超声处理导致交联DNA序列特异性断裂被引量：1
《生物技术通讯》2011年第4期504-508,共5页王东 师明磊 王洋 赵志虎 
国家重点基础研究发展计划(2009CB825600);国家自然科学基金(30871374;31071119)
目的:研究在交联状态下超声方法处理DNA是否导致DNA随机断裂。方法:通过建立一种新的Clone-Sequencing筛选技术,利用NCBI等相关网站,结合Vector-NTI等软件分析得到不同断裂位点的核苷酸序列,利用SPSS 18.0软件,对不同断裂位点核苷酸序...
关键词：超声 交联DNA 断裂位点 Clone-Sequencing 5'-ApN-3' 5'-TpN-3' 
乙醇合成途径的计算机重构
《生物技术通讯》2011年第4期513-518,共6页王东 何涛 汪莉 王玉民 邵卫东 
国家自然科学基金(30800644)
目的:用计算机重构乙醇合成途径,为合成生物燃料乙醇提供理论依据。方法:利用KEGG反应、化合物数据提取反应等式,过滤掉42个通用代谢物参与的反应,然后利用剩下的反应构建反应矩阵;利用广度优先搜索算法在反应矩阵中搜索生成乙醇的代谢...
关键词：乙醇 基因工程菌 合成生物学 广度优先搜索算法 
一种多基因串联共表达载体的构建被引量：11
《中国生物工程杂志》2011年第1期40-45,共6页何彰华 王洋 赵珺 刘晓杰 张丽华 王东 师明磊 黄芬 尤平 赵志虎 
国家重大新药创制关键技术平台资助项目(2008ZXJ09007-01)
为了构建一种可用于串联共表达多个基因的原核表达载体,通过PCR引入点突变,对商业载体pET-22b的酶切位点进行定向改造,设计独特的XbaⅠ/SpeⅠ模块。获得改造成功的载体pET-m22b,测序结果显示启动子、核糖体结合位点、多克隆位点及终止...
关键词：表达载体 共表达 串联组合 代谢通路组装 
含有分裂型内含肽DnaE基因的表达盒设计、合成及高效表达载体的构建被引量：1
《生物技术通讯》2010年第6期751-756,共6页赵珺 王洋 师明磊 王东 田靖 耿排力 赵志虎 
目的:建立一种简便、快捷的基因从头设计、优化与合成策略,进行含有分裂型内含肽DnaE基因的表达盒全合成并构建高效表达载体。方法:以免费软件GeneDesign 3.0为主要平台,同时结合Tandem Repeats Finder、UNAFold等不同生物信息学软件,...
关键词：内含肽DnaE 基因设计与合成 生物信息学 
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