郭建秀

作品数:4被引量:4H指数:1
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供职机构:西南交通大学生命科学与工程学院更多>>
发文主题:铁皮石斛RNA-SEQ发育过程基因家族生物信息学分析更多>>
发文领域:生物学农业科学理学医药卫生更多>>
发文期刊:《现代生物医学进展》《生物技术通报》《化学通报(中英文)》《生物学杂志》更多>>
所获基金:国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
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铁皮石斛DoTIFY基因家族全基因组鉴定及在原球茎发育过程中的表达被引量:2
《生物学杂志》2021年第5期53-58,共6页胡睿 郭建秀 郭小强 陈凤颖 王万军 
国家自然科学基金项目(31371232);2017年度理工类科技创新项目(A0920502051722-88)。
在铁皮石斛基因组数据中共鉴定出20个铁皮石斛TIFY(DoTIFY)基因。根据铁皮石斛、拟南芥、水稻、向日葵、陆地棉中TIFY的系统发育分析,将DoTFY分为4类:JAZ、PPD、ZIM和TIFY。铁皮石斛原球茎发育5个时期的转录组分析表明,有11个DoTIFY基...
关键词:铁皮石斛 TIFY 生物信息学分析 RNA-SEQ qPCR 
铁皮石斛泛素结合酶DoUBC9的克隆鉴定与表达分析被引量:1
《现代生物医学进展》2019年第13期2407-2413,共7页马凌晖 欧景丹 刘荣荣 胡睿 王万军 郭建秀 
国家自然科学基金项目(31371232,31271302);中央高校基本科研业务费专项资金资助(2682017CX093)
目的:本研究旨在探讨泛素结合酶UBC9在铁皮石斛原球茎发育过程中的分子机制,方法:利用生物信息学手段,从已获得的铁皮石斛基因组中鉴定出UBC9基因,命名为DoUBC9,并利用RACE技术,克隆出DoUBC9 3’端,通过与基因组序列拼接,获得完整序列...
关键词:铁皮石斛 泛素结合酶DoUBC9 基因克隆 进化表达分析 
分子动力学模拟残基突变对芳香烃受体配体结合区的影响被引量:1
《化学通报》2017年第2期179-184,207,共7页康文渊 徐锡明 郭建秀 田菲菲 
国家自然科学基金项目(31601060和11671329);2015年度中央高校基本科研业务费专项资金项目(2682015CX051);西南交通大学青年教师百人计划项目(2682013BR022)资助
芳香烃受体(Aryl hydrocarbon receptor,AhR)属于配体依赖性的转录因子蛋白。本文通过对AhR配体结合区域(Ligand binding domain,LBD)的结构功能及物种特异性分析,发现在其结合腔口有一些关键残基可能起到"门控"作用,进一步将野生型(WT)...
关键词:分子模拟 分子动力学 突变 芳香烃受体 
阿霉素诱导下的肝癌细胞HepG2中微小RNA差异表达分析
《生物技术通报》2016年第6期244-249,共6页杨亚蓝 郭志云 丁若凡 茆灿泉 郭建秀 熊莉丽 
国家自然科学基金资助项目(31200999);中央高校基本科研业务费专项资金资助(2682013BR022)
旨在研究阿霉素诱导引起的DNA损伤压力下,肝癌细胞Hep G2中参与DNA损伤应答的mi RNA,并分析这些mi RNA靶基因参与肝癌DNA损伤应答相关的生物学进程与通路。通过小RNA测序检测阿霉素处理肝癌细胞Hep G2前后mi RNA的差异表达情况,使用GO与...
关键词:阿霉素 肝细胞癌 DNA损伤 小RNA测序 micro RNAS 
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