丁若凡

作品数:5被引量:12H指数:2
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供职机构:西南交通大学生命科学与工程学院更多>>
发文主题:肝细胞癌肝癌细胞HEPG2查尔酮合成酶基因序列基因克隆更多>>
发文领域:医药卫生农业科学理学化学工程更多>>
发文期刊:《生物技术通讯》《化学通报(中英文)》《生物技术通报》更多>>
所获基金:中央高校基本科研业务费专项资金国家自然科学基金国家级大学生创新创业训练计划国家大学生创新性实验计划项目更多>>
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肝癌细胞HepG2中增强子的识别及生物信息学分析
《生物技术通讯》2017年第4期455-459,523,共6页丁若凡 李宇鹏 张一鸣 朱小冬 胡海碧 刘文荣 李玲 郭志云 
中央高校基本科研业务费专项(2682016YXZT04);国家大学生创新性实验计划(201610613066);四川省大学生创新创业训练计划(2016095)
目的:整合增强子特征识别肝癌细胞HepG2增强子,并对其保守性、GC含量、转录因子调控、靶基因功能等进行分析,以期解析肝癌细胞增强子参与的调控网络。方法:通过整合H3K27ac、H3K4me1和H3K4me3组蛋白修饰及DNaseⅠ高敏位点的Chip-seq数...
关键词:增强子 肝细胞癌 CHIP-SEQ 组蛋白修饰 
抗肿瘤多肽9R-P201诱导下的肝癌HepG2细胞转录组测序分析被引量:4
《生物技术通报》2017年第7期210-215,共6页刘文荣 丁若凡 张一鸣 李宇鹏 李玲 郭志云 
中央高校基本科研业务费专项资金(2682016YXZT04);国家大学生创新性实验计划项目(201610613066)
旨在探索多肽9R-P201处理肝癌HepG2细胞后基因融合、单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)突变、可变剪接等事件,并分析差异表达基因所参与的生物学进程与信号通路,以期解析多肽9R-P201在转录组水平对肝癌细胞的调控。...
关键词:9R-P201 肝细胞癌 转录组测序 基因 
阿霉素诱导下的肝癌细胞HepG2中微小RNA差异表达分析
《生物技术通报》2016年第6期244-249,共6页杨亚蓝 郭志云 丁若凡 茆灿泉 郭建秀 熊莉丽 
国家自然科学基金资助项目(31200999);中央高校基本科研业务费专项资金资助(2682013BR022)
旨在研究阿霉素诱导引起的DNA损伤压力下,肝癌细胞Hep G2中参与DNA损伤应答的mi RNA,并分析这些mi RNA靶基因参与肝癌DNA损伤应答相关的生物学进程与通路。通过小RNA测序检测阿霉素处理肝癌细胞Hep G2前后mi RNA的差异表达情况,使用GO与...
关键词:阿霉素 肝细胞癌 DNA损伤 小RNA测序 micro RNAS 
噻吩并嘧啶类FLT3抑制剂结合模式预测与分析被引量:1
《化学通报》2015年第10期944-944,共1页康文渊 丁若凡 范倩 田菲菲 
FLT3(FMS样酪氨酸酶III)是酪氨酸激酶受体(RTKIII)成员之一,其异常超表达或突变与急性髓细胞白血病(AML)呈现非常大的相关性,成为治疗AML的重要靶位点。本文采用不同的方法对FLT3活性位点进行了预测,利用分子对接、分子动力学以及药效...
关键词:FLT3 活性位点预测 分子对接 分子动力学 药效团分析 
决明查尔酮合成酶全长基因序列的克隆与分析被引量:7
《生物技术通报》2013年第5期99-104,共6页钟德馨 方袁梦梦 郭壮浩 安红强 董银松 丁若凡 王万军 廖海 周嘉裕 
国家自然科学基金项目(31271302);教育部中央高校基本科研业务费专项资金(SWJTU11CX114);西南交通大学"希望之星";国家级大学生创新创业训练计划项目(201210613050)
从决明(Cassia tora)的新鲜子叶中提取基因组DNA作为模板,利用一对特异引物进行PCR扩增,然后克隆测序得到决明查尔酮合成酶(CHS)的基因全长。测序结果表明,决明CHS基因全长为1 766 bp,含有2个外显子和1个内含子。将其提交GenBank,登录号...
关键词:决明 查尔酮合成酶 内含子 基因克隆 序列分析 
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