田菲菲

作品数：10被引量：15H指数：2
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供职机构：西南交通大学生命科学与工程学院更多>>
发文主题：分子对接HPV16/18E6蛋白分子动力学分子模拟更多>>
发文领域：生物学医药卫生理学化学工程更多>>
发文期刊：《生命科学研究》《化学进展》《华西药学杂志》《癌变．畸变．突变》更多>>
所获基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金国家高技术研究发展计划更多>>
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综合scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq技术建立与肝癌CD8^(+)T细胞相关的预后模型
《西安交通大学学报(医学版)》2025年第1期169-177,共9页刘洋 池晴佳 田菲菲 
中央高校基本科研业务费基础研究培育计划医工结合专项(重点项目)(No.2682023ZTPY071)。
目的 通过单细胞测序(scRNA-Seq)和Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq)技术鉴定出与肝癌CD8^(+)T细胞相关的生物标志物并建立预后模型。方法 从GEO数据库中下载肝癌的单细胞数据集,通过scRNA-Seq技术提取患者与对照组间CD8^(+)T细胞的差异表...
关键词：肝癌 单细胞测序(scRNA-Seq) Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq) CD8^(+)T细胞 预后模型 
柴胡蚤休汤治疗肝细胞癌关键靶点的网络药理学研究及预后模型的建立
《华西药学杂志》2024年第1期18-24,共7页唐屿 池晴佳 田菲菲 封顺 
国家自然科学基金资助项目(批准号:22174117)。
目的采用网络药理学研究柴胡蚤休汤治疗肝细胞癌的关键靶点,并构建风险评分模型用于解决肝癌的预后问题。方法通过网络药理学、LASSO COX建模和体外细胞实验方法,探讨柴胡蚤休汤治疗肝细胞癌的主要药用活性成分、作用分子靶点及相关基...
关键词：柴胡蚤休汤 活性成分 网络药理学 肝细胞癌 分子对接 风险评分模型 肝癌预后 体外细胞实验 
八种黄酮类天然产物对高危型HPV16/18 E6蛋白的分子对接研究被引量：4
《化学通报》2020年第2期144-149,共6页徐苗 张天一 丁欢 田菲菲 
国家自然科学基金项目(31601066)资助
宫颈癌以其高发病率和高死亡率严重危害女性健康,传统治疗手段有效率低且治疗过程给患者带来极大痛苦。近年来,许多天然植物来源化合物已被确定为治疗和预防宫颈癌的有希望的药物来源,但天然产物治疗癌症的具体作用机制尚未明确。因此,...
关键词：高危型HPV E6蛋白 黄酮化合物 分子对接 
HPV16/18 E6蛋白与小分子抑制剂RITA和姜黄素的结合模式研究被引量：1
《生命科学研究》2019年第5期367-376,共10页张天一 徐苗 丁欢 田菲菲 
国家自然科学基金资助项目(31601066)
持续感染高危型人乳头瘤病毒(human papilloma virus, HPV)会导致宫颈上皮细胞的细胞周期发生变化和免疫逃逸,最终导致宫颈癌。高危型HPV病毒的E6蛋白对抑癌蛋白p53的泛素化降解可被小分子化合物RITA (reactivation of p53 and inductio...
关键词：宫颈癌 小分子抑制剂 分子对接 结合模式 
PD-1/PD-L1信号通路抑制剂在宫颈癌治疗中的研究进展被引量：5
《癌变．畸变．突变》2019年第5期417-420,共4页徐苗 张天一 田菲菲 
国家自然科学基金(31601066)
程序性死亡配体1(PD-L1)是一种免疫抑制性共刺激分子,其与程序性死亡受体1(PD-1)结合可以抑制T细胞增殖分化并导致T细胞凋亡.多种肿瘤细胞通过大量表达PD-L1使肿瘤细胞逃避免疫系统的监视与攻击.PD-1/PD-L1信号通路抑制剂作为免疫疗法...
关键词：PD-1/PD-L1信号通路 宫颈癌 免疫逃逸 免疫治疗 
分子动力学模拟残基突变对芳香烃受体配体结合区的影响被引量：1
《化学通报》2017年第2期179-184,207,共7页康文渊 徐锡明 郭建秀 田菲菲 
国家自然科学基金项目(31601060和11671329);2015年度中央高校基本科研业务费专项资金项目(2682015CX051);西南交通大学青年教师百人计划项目(2682013BR022)资助
芳香烃受体(Aryl hydrocarbon receptor,AhR)属于配体依赖性的转录因子蛋白。本文通过对AhR配体结合区域(Ligand binding domain,LBD)的结构功能及物种特异性分析,发现在其结合腔口有一些关键残基可能起到"门控"作用,进一步将野生型(WT)...
关键词：分子模拟 分子动力学 突变 芳香烃受体 
噻吩并嘧啶类FLT3抑制剂结合模式预测与分析被引量：1
《化学通报》2015年第10期944-944,共1页康文渊 丁若凡 范倩 田菲菲 
FLT3(FMS样酪氨酸酶III)是酪氨酸激酶受体(RTKIII)成员之一,其异常超表达或突变与急性髓细胞白血病(AML)呈现非常大的相关性,成为治疗AML的重要靶位点。本文采用不同的方法对FLT3活性位点进行了预测,利用分子对接、分子动力学以及药效...
关键词：FLT3 活性位点预测 分子对接 分子动力学 药效团分析 
系统比较氨基酸描述子在多肽定量构效关系中的应用被引量：2
《生物学杂志》2014年第1期87-93,共7页许航 田菲菲 吴坚 
中央高校基本科研业务费科技创新项目资助(编号:SWJTU11CX113)
氨基酸描述子是采用多元统计方法从大量氨基酸性质参数中提取得到的少数关键信息成分,目前已被广泛应用于多肽生物活性预测及蛋白质功能判别等领域。鉴于近年来氨基酸描述子种类的极速扩增,收集了目前国内外发表的27种氨基酸描述子,并...
关键词：氨基酸描述子 经典肽集 定量构效关系 
计算肽学
《化学进展》2012年第9期1674-1682,共9页任彦荣 田菲菲 周鹏 
国家高技术发展计划(863)项目(No.2006AA02Z31);国家自然科学基金项目(No.31200993);重庆市教育委员会资助项目(No.KJ101507)资助
肽作为重要的生理活性物质一直受到相关领域的广泛关注。近年来,由于肽在细胞信号转导中所扮演的中心角色以及作为生物药物靶向蛋白质相互作用网络等特殊性质的发现,再次唤起了人们对肽的浓厚兴趣。与之相伴的是,肽的理论和计算研究工...
关键词：计算肽学 蛋白质/肽相互作用 分子模拟 药物设计 
采用高斯过程模拟预测域/肽识别和相互作用被引量：1
《中国科学：化学》2012年第8期1179-1189,1263-1288,共11页任彦荣 陈绍成 邹晓川 田菲菲 周鹏 
国家高技术研究发展计划(863计划;2006AA02Z31);重庆市教育委员会项目(KJ101507)的资助
细胞信号网络中的蛋白质相互作用常通过结合-折叠偶合方式实现,即来自一方蛋白的刚性肽识别域与来自另一方蛋白表面的一段柔性寡肽片段发生识别和结合,从而介导母体蛋白相互作用.深入分析域/肽识别和相互作用的理化性质及精确预测其作...
关键词：高斯过程 统计建模 机器学习 域/肽作用 
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