国家自然科学基金(90103033)

作品数:22被引量:129H指数:7
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模拟退火算法的一种改进及其应用研究被引量:22
《大连理工大学学报》2006年第5期775-780,共6页赵晶 唐焕文 朱训芝 
国家自然科学基金资助项目(90103033)
针对连续函数全局优化问题提出了改进的模拟退火算法:采用新的解扰动策略,并将局部极小化过程引入模拟退火算法.数值试验证实了该算法的可行性及有效性.作为该方法的应用,计算了著名的L ennard-Jones簇问题,通过比较说明新方法可以提高...
关键词:最优化方法 模拟退火算法 Lennard-Jones簇问题 蛋白质结构预测 
无参数鲁棒线性规划支持向量机分类的牛顿法
《计算机工程》2006年第5期10-12,共3页宋杰 唐焕文 
国家自然科学基金重大研究计划资助项目(90103033)
Mangasarian最近提出的用于分类的无参数鲁棒线性规划支持向量机克服了标准支持向量机的一些缺点,而且模型简单,容易实现。该文讨论了这种新型支持向量机的线性规划问题的最小2-范数解,在此基础上给出了一个快速的牛顿算法。
关键词:支持向量机 无参数鲁棒线性规划支持向最机 牛顿算法 分类 
脊椎动物线粒体全基因组中的超级保守序列与进化被引量:5
《科学通报》2006年第4期427-430,共4页涂四利 方伟武 
国家自然科学基金重大研究计划项目(批准号:90103033);国家重点基础发展规划项目(批准号:2004CB318000)资助.
近年来,超级保守序列及小RNA研究受到了高度重视,它们在后基因组时代正起着越来越重要的作用.通过对540多兆数据的比较分析,在352种脊椎动物线粒体全基因组中发现了4段独有的超级保守序列,它们的长度为22-30bp.令人惊讶的是,它...
关键词:线粒体基因组 超级保守序列 小RNA 生物进化 
基于迭代渐进多序列比对算法研究被引量:1
《计算机工程》2005年第17期32-33,61,共3页张敏 方伟武 张俊华 迟忠先 
国家自然科学基金资助项目(90103033)
提出一种新的迭代渐进多序列比对算法IPMSA。采用公共多序列比对数据库BAliBASE中142组蛋白质序列作为比对测试数据,并与ClustalW进行比较。比对结果的统计分析表明,IPMSA算法的比对准确率高于ClustalW。
关键词:迭代渐进多序列比对 渐进比对算法 迭代策略 准确率 
进化策略的一种改进及其在蛋白质结构预测中的应用被引量:2
《计算机与应用化学》2005年第12期1097-1100,共4页张红娟 李斌 唐焕文 郭崇慧 
国家自然科学基金资助项目(90103033)
进化策略算法是一种模拟自然界生物进化过程的全局优化方法。本文将一种改进的进化策略算法应用于蛋白质三维 HPNX非格模型,较成功地预测了蛋白质序列1RPB、1BPI和1UBQ的折叠趋势,说明了三维HPNX非格模型比简化HP非格模型更能准确地描...
关键词:进化策略 HPNX非格模型 蛋白质折叠 
一种禁忌搜索算法在二维HP非格模型中的应用被引量:3
《计算机与应用化学》2005年第12期1101-1105,共5页岳晓晖 唐焕文 郭崇慧 
国家自然科学基金资助项目(90103033)
禁忌搜索算法是一种启发式的全局优化算法,是局部搜索算法的一种推广,已被成功地应用于许多组合优化问题,本文探讨将一种记忆的禁忌搜索算法应用于求解蛋白质结构预测问题。文中首先介绍了一种二维HP非格模型,此模型最后可以归结为一个...
关键词:蛋白质结构预测 二维HP非格模型 禁忌搜索算法 
蛋白质折叠过程中的长短程作用研究被引量:2
《计算机与应用化学》2005年第10期832-836,共5页张红娟 唐焕文 
国家自然科学基金资助项目(90103033)
基于蛋白质二维HP非格模型和改进的模拟退火算法研究了长短程作用在蛋白质折叠过程中的作用。通过试验得出1ECD、2RNS、1PHT、1WBC等序列的折叠构型,并根据PDB中所提供的上述序列的结构信息,具体讨论了长程作用对蛋白质构型的影响,说明...
关键词:长短程相互作用 蛋白质折叠 模拟退火算法 二维HP非格模型 
一种新的无约束优化线搜索算法被引量:5
《运筹与管理》2005年第5期18-23,共6页朱训芝 唐焕文 
国家自然科学基金资助项目(90103033)
在对各种有效的线搜索算法分析的基础上,给出了一种求解光滑无约束优化问题的新的线搜索算法。对于目标函数是二次连续可微且下有界的无约束优化问题,算法具有与Wolfe-Powell线搜索算法相同的理论性质。在每一步迭代中算法至多需要计算...
关键词:运筹学 线性搜索 Wolfe-Powell准则 无约束优化 
基于线性规划的ν-支持向量机分类器被引量:2
《大连理工大学学报》2005年第2期303-307,共5页宋杰 唐焕文 
国家自然科学基金资助项目(重点项目:90103033).
Scho..lkopf等提出的基于二次规划的ν-支持向量机(ν-SVM)与标准SVM相比,其优势在于可以控制支持向量的数目和误差,但由于增加了模型的复杂性,限制了其应用.为此,构造了一种基于线性规划的ν-SVM分类器,模型简单,参数ν具有明确的意义...
关键词:支持向量机分类器 SVM分类器 线性规划算法 二次规划 数值实验 直接利用 训练速度 分类效果 复杂性 误差 控制 模型 
一类连续函数模拟退火算法及其收敛性分析被引量:17
《计算数学》2005年第1期19-30,共12页靳利霞 唐焕文 李斌 计明军 朱训芝 
国家自然科学基金(90103033)资助.
高维连续函数的全局优化问题普遍存在于计算生物学、计算化学等领域.针对这类问题和现有连续函数模拟退火算法的某些不足,本文给出了一类改进的模拟退火算法.采用一种简单的方法证明了算法的全局收敛性.数值结果表明,对于高维连续函数,...
关键词:连续函数 全局收敛性 模拟退火算法 高维 计算化学 全局优化问题 收敛性分析 全局最优 数值 快速 
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