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国家自然科学基金(30670497): 作品数：25被引量：67H指数：5; 导出分析报告; 相关作者：王存新陈慰祖刘斌何红秋胡建平更多>>; 相关机构：北京工业大学乐山师范学院更多>>; 相关期刊：《Science China(Life Sciences)》《Acta Pharmacologica Sinica》《Science China Chemistry》《物理化学学报》更多>>; 相关主题：HIV-1整合酶HIV-1整合酶分子对接分子动力学模拟更多>>; 相关领域：生物学医药卫生理学自然科学总论更多>>

分子信标方法研究HIV-1整合酶3'加工反应动力学被引量：1: 《中国生物工程杂志》2012年第2期76-81,共6页何红秋刘斌陈慰祖王存新; 国家自然科学基金(30670497);北京市自然科学基金(5072002);重庆市科技攻关重点项目(CSTC2010AB5101)资助项目; HIV-1整合酶催化病毒cDNA与宿主细胞基因组DNA的整合,是病毒在宿主细胞中增殖的一个关键酶。3'加工是整合酶催化整合过程的第一步反应,3'加工反应动力学的研究对整合酶催化机理研究和以整合酶为靶点的药物研发都具有重要意义。构建了野...; 关键词：HIV-1 整合酶分子信标3’加工动力学

HIV-1整合酶活性检测方法的研究进展: 《北京工业大学学报》2011年第5期794-800,共7页王存新陈霞何红秋谭建军; 国家自然科学基金资助项目(30670497);北京市自然科学基金资助项目(7082006);国家'九七三'计划资助项目(2009CB930200); H IV-1整合酶介导病毒DNA与宿主染色体的整合,是病毒复制周期中必不可少的环节,抑制整合酶能有效阻止病毒在体内复制.同时,人体细胞中无整合酶的功能类似物,因此,整合酶是抗H IV-1的理想靶点.近年来,整合酶活性的体外检测方法得到快速发...; 关键词：艾滋病病毒整合酶活性检测方法

计算机辅助设计抗HIV-1整合酶抑制剂的研究进展被引量：4: 《生物物理学报》2010年第12期1088-1100,共13页刘畅谭建军刘明张小轶陈慰祖王存新; 国家自然科学基金项目(30670497);"973"计划项目(2009CB930200);北京市自然科学基金项目(5072002和7082006);博士启动基金项目(X0015001200801)~~; HIV-1整合酶是HIV-1生命周期中必不可少的酶之一,已成为目前最具潜力的抗HIV药物设计的靶点之一。2007年,Merk公司研发的MK-5108作为首个整合酶抑制剂药物被美国食品药物管理局批准上市,标志着整合酶抑制剂研究的重大突破,也激发了抗HI...; 关键词：HIV-1整合酶抑制剂合理药物设计

基于残基涨落的加权氨基酸网络的构建及应用: 《北京工业大学学报》2010年第12期1695-1699,共5页齐立省陈慰祖王存新; 国家自然科学基金资助项目(30670497); 提出了一种以残基间距离涨落为权重的氨基酸网络的加权方式.对180个蛋白质的加权与非加权氨基酸网络的拓扑特征量进行了分析.统计结果表明,氨基酸网络具有明显的小世界特征,加权网的平均集聚系数比非加权网的小.节点度分布具有幂律形式...; 关键词：氨基酸网络残基涨落小世界特性幂律分布

T66I突变提高HIV-1整合酶大肠杆菌表达可溶性研究: 《中国生物工程杂志》2010年第8期17-21,共5页杨东刘斌何红秋张小轶张海锋许先进陈慰祖王存新; 国家自然科学基金(30670497);北京市自然科学基金(7082006)资助项目; 在研究HIV-1整合酶(IN)抗药性突变T66I时,发现这一突变同时可以提高整合酶的溶解性。原核表达了IN1?288/T66I和野生型(WT),取菌体破碎后的上清,SDS-PAGE和his标签蛋白质染色进行分析,结果表明IN1?288/T66I可溶性约是WT的2.4倍。600ml培...; 关键词：整合酶可溶性表达 T66I突变

HIV-1跨膜蛋白gp41与N-取代吡咯衍生物的结合模式研究(英文)被引量：3: 《生物化学与生物物理进展》2010年第8期904-915,共12页丛肖静谭建军刘明陈慰祖王存新; supported by grants from The National Natural Science Foundation of China(30670497);National Basic Research Program of China(2009CB930200);Beijing Natural Science Foundation(5072002,7082006);Research Fund for the Doctorate Program(X0015001200801)~~; 采用分子对接,分子动力学(MD)模拟和分子力学/泊松-波尔兹曼溶剂可有面积方法与分子力学/广义伯恩溶剂可及面积方法(MM-PBSA/MM-GBSA),预测两种N-取代吡咯衍生物与HIV-1跨膜蛋白gp41疏水口袋的结合模式与作用机理.分子对接采用多种受体...; 关键词：HIV-1融合抑制剂跨膜蛋白gp41 分子对接分子动力学模拟 MM-PBSA/MM-GBSA

Network analysis of protein-protein interaction被引量：3: 《Chinese Science Bulletin》2010年第9期814-822,共9页Shan Chang XinQi Gong Xiong Jiao ChunHua Li WeiZu Chen CunXin Wang; supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant Nos. 20773006, 30670497, 10974008);Beijing Natural Science Foundation (Grant No. 4102006) ;Specialized Research Fund for the Doctoral Program of Higher Education (Grant No. 200800050003); Residue networks are constructed by defining the residues as the vertices and atom contacts between them as the edges. The residue network of a protein complex is divided into two types of networks, i.e. the hydrophob...; 关键词：interface CHARACTERISTIC PATH LENGTH RESIDUE network SCORING FUNCTION

Molecular dynamics simulation of the transmembrane subunit of BtuCD in the lipid bilayer被引量：1: 《Science China(Life Sciences)》2010年第5期620-630,共11页SUN TingGuang1,2,LIU Ming1,CHEN WeiZu1 & WANG CunXin1 1College of Life Science and Bioengineering,Beijing University of Technology,Beijing 100124,China 2Department of Biological and Chemical Engineering,Guangxi University of Technology,Liuzhou 545006,China; supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant Nos 20773006 and 30670497);the Beijing Natural Science Foun-dation (Grant Nos 7082006 and 5072002);the Specialized Research Fund for the Doctoral Program of Higher Education (Grant No 200800050003); Based on the crystal structure of the vitamin B12 transporter protein of Escherichia coli(BtuCD) a system consisting of the BtuCD transmembrane domain(BtuC) and the palmitoyloleoyl phosphatidylcholine(POPC) lipid bila...; 关键词：BtuCD POPC FUNCTIONAL MOTION principal component analysis

Development of a high-throughput assay for the HIV-1 integrase disintegration reaction被引量：8: 《Science China(Life Sciences)》2010年第2期241-247,共7页HE HongQiu,LIU Bin,ZHANG XiaoYi,CHEN WeiZu & WANG CunXin College of Life Science and Bioengineering,Beijing University of Technology,Beijing 100124,China; supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant No. 30670497);the Beijing Natural Science Foundation (Grant No. 5072002); Both HIV-1 integrase (IN) and the central catalytic domain of IN (IN-CCD) catalyze the disintegration reaction in vitro.In this study,IN and IN-CCD proteins were expressed and purified,and a high-throughput format enz...; 关键词：HIV-1 INTEGRASE IN-CCD DISINTEGRATION HIGH-THROUGHPUT ASSAY

蛋白质复合物结构预测的集成分子对接方法被引量：2: 《中国科学（C辑）》2009年第10期963-973,共11页龚新奇刘斌常珊李春华陈慰祖王存新; 国家自然科学基金(批准号:30670497和20773006);教育部博士点基金(批准号:200800050003);国家重点基础研究发展计划(批准号:2009CB930200)资助项目; 蛋白质分子间相互作用与识别是当前生命科学研究的热点,分子对接方法是研究这一问题的有效手段.为了推进分子对接方法的发展,欧洲生物信息学中心组织了国际蛋白质复合物结构预测(CAPRI)竞赛.通过参加CAPRI竞赛,逐步摸索出了一套用于蛋...; 关键词：蛋白质复合物结构预测结合位点分子对接 CAPRI

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