国家自然科学基金(69935020)

作品数:22被引量:99H指数:6
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相关作者:徐安龙李衍达赵贵军陈慧萍涂洪斌更多>>
相关机构:中山大学清华大学中国人民解放军第一军医大学广州医学院附属肿瘤医院更多>>
相关期刊:《中国微生态学杂志》《中国现代医学杂志》《清华大学学报(自然科学版)》《微生物学通报》更多>>
相关主题:CDNA表达文库毒腺碱基分布基因组生物信息学更多>>
相关领域:生物学医药卫生自动化与计算机技术社会学更多>>
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赤魟亲环素A的融合表达、纯化及活性特征被引量:5
《中国现代医学杂志》2004年第11期67-70,共4页涂洪斌 朱俊杰 张强 彭立胜 钟肖芬 陈慧萍 姜孝玉 杨文利 
国家高技术海洋领域863项目(2001AA626010);国家自然科学基金委重点项目(69935020)
目的探讨赤鱼工亲环素A基因(dsCypA)的生物学功能。方法构建硫氧还蛋白基因融合表达体系PETTRX-dsCypA,低温诱导表达的融合蛋白dsCypA-TRX,利用金属螯合亲和层析纯化后,经蛋白酶切割和进一步纯化,得到高纯度成熟重组dsCypA,测定其酶活...
关键词:赤魟 亲环素A 融合表达 酶活性 
金钱鱼毒腺cDNA表达文库的构建及EST序列分析被引量:9
《中国生物化学与分子生物学报》2004年第2期166-170,共5页陈慧萍 姜孝玉 涂洪斌 杜晶春 卫剑文 杨文利 徐安龙 
国家高新技术海洋领域 863项目 (2 0 0 1AA62 60 61);国家自然科学基金重点项目(6993 5 0 2 0 )~~
以金钱鱼 (Scatophagusargus)毒腺为出发材料 ,构建以真核表达载体pcDNA3 0为基础的金钱鱼毒腺cDNA表达文库 .应用SMARTTM cDNALibraryConstruction技术和生物信息学分析等方法 ,通过对文库克隆的序列测定和初步生物信息学分析 ,获得了 ...
关键词:金钱鱼 毒腺 CDNA 表达文库 EST 序列分析 功能基因 
初步建立真核基因调控元件模块的搜索方法被引量:1
《第一军医大学学报》2004年第2期172-176,共5页钟东 张振书 刘宇虎 郑国清 刘小意 卢阳 赵贵军 徐安龙 
国家自然科学基金重点项目(69935020);国家自然科学基金(30171053);中山大学青年教师科研启动基金(33110-1131091)~~
依据基因调控知识对现有方法进行了综合及改进:(1)在序列搜索方面,结合多序列低分值查询与多个保守片段搜索两种方法获得匹配序列,然后序列相互打分,最后进行聚类分析;(2)在位点搜索方面,综合应用位置权重矩阵、成对寡核苷酸及Smith-Wat...
关键词:真核基因 基因调控 搜索方法 调控元件模块 数据库 
多重证据法与族源研究——以中国西南族群生物遗传多样性与区域文化研究为例被引量:4
《中山大学学报(社会科学版)》2003年第4期56-61,共6页周大鸣 梅方权 
国家社会科学基金(OOBZH001);国家自然科学基金(69935020)
文章通过对云南纳西族、独龙族的基因分析,结合与古羌人相关的藏、彝、白、哈尼、普米、景颇、拉祜族等族群的基因特征,融合包括体质人类学、民族学、语言学、考古学的广义人类学、历史学的研究成果,提出族源研究的多重证据法,并对今后...
关键词:名重证据法 基因研究 族源 
62种细菌基因组中密码子碱基位置上碱基分布的差异性及相关性被引量:4
《中国微生态学杂志》2003年第3期134-136,共3页钟东 赵贵军 刘宇虎 杨兴龙 徐安龙 张振书 
国家自然科学基金重点项目资助 (No 6993 5 0 2 0 ) ;国家自然科学基金项目资助 (No 3 0 1710 5 3 ) ;中山大学青年教师科研启动基金项目 (No 3 3 110 113 10 91)
应用生物信息学方法 ,对已完成测序的 6 2种细菌基因组进行 :1 同一密码子碱基位置上不同碱基分布频率的比较 ;2 不同密码子碱基位置上同一碱基分布频率的比较。结果显示 :1 三个密码子碱基位置上及四种碱基的分布频率差异存在显著性 ;...
关键词:细菌 基因组 碱基分布 差异性 相关性 密码子碱基位置 
基于unix的cDNA序列自动分析系统的构建和应用被引量:1
《中山大学学报(自然科学版)》2002年第5期60-63,共4页符志彦 卢阳 叶兰汀 何智良 徐安龙 
国家自然科学基金资助项目 (3980 0 0 73) ;国家自然科学基金重点资助项目 (6 9935 0 2 0 )
基于unix/linux操作系统和mysql数据库 ,利用phred/phrap ,stackpack ,blast软件 ,对cDNA和EST序列进行大规模自动分析。它可以完成从测序峰图文件向核酸序列的转化 ,去除载体污染和重复序列 ,序列聚类 ,拼接 ,分析可变剪切 ,数据库搜...
关键词:cDNA序列自动分析系统 大规模测序 unix/linux操作系统 phred/phrap软件 stackpack软件 blast软件 系统开发 MYSQL数据库 
隐Markov模型在剪接位点识别中的应用被引量:9
《清华大学学报(自然科学版)》2002年第9期1214-1217,共4页夏慧煜 周晴 李衍达 
国家自然科学基金资助项目 (6993 5 0 2 0 )
剪接位点的识别是基因识别中的一个重要环节。由于现有的基因识别算法主要关注编码区的整体特性 ,而并不着重考虑个别位点的信息 ,因此难以准确地识别出剪接位点。考虑到剪接位点附近的保守序列的相邻碱基之间应该存在某种相关性 ,利用...
关键词:隐MARKOV模型 剪接位点 基因识别 基因编码区 序列长度 保守序列 概率统计方法 
广州地区汉族人乙型肝炎病毒感染与HLA-DPB1基因的相关性研究被引量:6
《中国病理生理杂志》2002年第8期907-909,共3页刘泽寰 范新兰 林蒋海 符志彦 潘德京 付永贵 贾宗剑 徐安龙 
国家杰出青年基金资助项目 (No .3972 50 0 7);国家自然科学基金重点项目 (No .699350 2 0 )
目的 :探讨人类白细胞抗原 (HLA)的DPB1基因与广州地区汉族人乙型肝炎病毒 (HBV)感染的相关性。方法 :采用测序分型技术 (SBT)对广州地区汉族人中 58例乙型肝炎患者和 75例正常个体的HLA -DPB1基因位点进行了基因分型。结果 :两者的HLA ...
关键词:广州市 汉族 乙型肝炎病毒感染 乙型肝炎病毒 HLA抗原 人类白细胞抗原 DPB1基因 
平颏海蛇PLA_2在大肠杆菌中的融合表达被引量:1
《微生物学报》2002年第4期400-405,共6页杨文利 叶兰汀 邹兰 汪枫 徐安龙 
国家高新技术海洋 86 3项目 ( 2 0 0 1AA6 2 6 0 1 0 );国家自然科学基金重点项目 ( 6 9935 0 2 0 )~~
将编码平颏海蛇磷脂酶A2 的基因 (PLA2 9)分别克隆于硫氧环蛋白基因融合表达载体pThioHisC和pTRX的HP trxA和trxA基因的 3′末端 ,构建符合读码框的融合表达载体pThioHisC PLA2 和pTRX PLA2 。 2 5℃下经IPTG诱导 ,PLA2 融合蛋白在两...
关键词:平颏海蛇 PLA2 大肠杆菌 融合表达 磷脂酶A2 亲和层析 蛇毒 
微生物基因组的生物信息学研究平台的建立被引量:1
《微生物学通报》2002年第4期22-28,共7页赵贵军 何智良 卢阳 叶兰汀 徐安龙 
国家自然科学基金重点项目(No.69935020)
随着人类基因组计划及其它测序工作顺利进行,人们已经得到了大量的基因序列。如何阐明这些序列的功能和意义,是功能基因组学的主要任务。生物信息学和比较基因组学为加速这一进程提供了有利的工具。该研究建立了对已经完成全基因组测序...
关键词:微生物基因组 生物信息学 研究平台 细菌基因组 功能注释 
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