国家自然科学基金(90403010)

作品数:18被引量:47H指数:3
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表观遗传因素在RNA剪接过程中的作用
《中国生物化学与分子生物学报》2011年第9期791-796,共6页陈伟 罗辽复 
国家自然科学基金(No.90403010);河北联合大学博士科研启动基金(No.10101115)资助~~
RNA剪接是真核生物基因表达过程中的重要环节,增加了蛋白质的多样性和基因表达的可调节性.日益增多的研究表明,RNA剪接并不是独立的生物过程.RNAⅡ型聚合酶(RNApolymerase-Ⅱ,RNA PolⅡ)、核小体定位和组蛋白修饰等因素都与RNA剪接过程...
关键词:RNAPolⅡ 核小体定位 组蛋白修饰 RNA剪接 
以信息关联和偏信息关联为工具标记基因组
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2011年第1期62-68,共7页高扬 罗辽复 
国家自然科学基金资助项目(90403010)
在30个物种中分别随机选取长度为20万碱基的序列片断,通过方差分析和多重比较检验考察其多项信息参数作为基因组识别码的有效性.结果表明:在16种偏信息关联中,FA(k)C,FC(k)A,FG(k)T和FT(k)G的识别能力最强.这说明基因组签名偏好AC和GT语...
关键词:信息关联 偏信息关联 基因组签名 识别码 
应用离散增量方法识别人类MicroRNAs前体序列
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2010年第6期673-677,共5页高智红 张利绒 罗辽复 
国家自然科学基金资助项目(No.60963015和No.90403010);内蒙自然科学基金资助项目(No.2009BS0102)
MicroRNAs(miRNAs)是一类约为21-26个碱基长度的非编码单链RNA.根据Mi-croRNAs前体序列(pre-miRNAs)的碱基保守特征和二级结构特征,应用多样性增量方法(ID方法)和支持向量机(SVM)分析,以内含子区(intron)、外显子区(exon)、基因间区(int...
关键词:pre-miRNAs 离散增量 二级结构特征 
基因组信息、密码进化、折叠动力学和熵产生——理论生物学的几个基本问题被引量:5
《科技导报》2010年第15期106-111,共6页罗辽复 
国家自然科学基金项目(90103030,90403010);内蒙古自治区科学技术特别贡献奖励基金(2008)
数千个基因组的测序完成,海量资料数据呼唤着生命科学的理性和实证性更完美地结合。基因组信息学是理论生物学的龙头。本文遵循生命信息运行的密码—序列—结构—功能的主线,论述了生命科学的理性化途径,讨论了若干基因组生物学的基...
关键词:基因组信息 进化 遗传密码 蛋白质折叠 熵产生 
基因组信息、密码进化、折叠动力学和熵产生——理论生物学的几个基本问题
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2010年第4期468-474,共7页罗辽复 
国家自然科学基金资助项目(90103030和90403010);内蒙古自治区科学技术特别贡献奖2008基金
以信息为主线论述了生命科学的理性化途径,着重总结了作者及其研究小组在理论生物学领域的工作,包括基因组序列识别码的形成和构建,基因组的进化方向和最大信息原理,遗传密码的适应性进化,基于量子跃迁的蛋白质折叠动力学,细胞开关相变...
关键词:基因组信息 密码进化 折叠动力学 熵产生 
肠道病毒71型基因组中小干扰RNA的靶位点预测被引量:1
《生物信息学》2009年第4期292-294,299,共4页陈伟 罗辽复 
国家自然科学基金资助项目(90403010)
肠道病毒71型(EV71)已经在世界范围内有过十多次大的爆发与流行,近年来EV71病毒的流行在亚洲逐渐呈上升的趋势,但是目前尚无有效的治疗措施,因此迫切需要一种治疗EV71的有效药物。本文采用生物信息学的方法,对人类EV71病毒三个不同株型(...
关键词:肠道型病毒71 RNA干扰 二级结构 靶位点 
基于组蛋白甲基化信息的H2A.Z和H2A核小体识别被引量:1
《生物物理学报》2009年第4期269-274,共6页陈伟 罗辽复 
国家自然科学基金资助项目(90403010)~~
组蛋白H2A的变体H2A.Z在基因的表达过程中发挥着重要的作用。根据H2A.Z和H2A核小体中组蛋白甲基化修饰方式的不同,作者应用多样性增量二次判别方法(increment of diversity with quadratic discriminant,IDQD)成功地对H2A.Z和H2A核小体...
关键词:H2A H2A.Z 组蛋白甲基4JC 多样性增量二次判别法 
酵母基因组中核小体偏好序列的识别被引量:1
《生物信息学》2009年第2期159-162,共4页陈伟 罗辽复 
国家自然科学基金资助项目(90403010)
应用多样性增量结合二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法,对酵母基因组中的核小体强/弱偏好序列进行了识别。10交叉检验的预测成功率超过了97%,受试者操作特性(receiver operating cha...
关键词:核小体 多样性增量 二次判别分析 
Discrimination of intra/extracellular sidedness segments of transmembrane proteins
《生物物理学报》2009年第S1期193-194,共2页Wei Chen, Liao-fu Luo School of Physical Science and Technology, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China 
supported by National Natural Science Foundation (No.90403010)
Topology of the transmembrane protein is closely related to its functions. So, it is desiderated to depict the topology of transmembrane proteins. In this work, an effective approach
关键词:TRANSMEMBRANE protein topology INCREMENT of diversity QUADRATIC DISCRIMINANT analysis 
用4肽结构字预测蛋白质二级结构被引量:2
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2008年第3期300-306,共7页冯永娥 罗辽复 
国家自然科学基金资助项目(90403010)
介绍一种新的方法来预测蛋白质二级结构.该方法是基于4肽结构字的基础上,利用4肽结构字建立多样性源同时结合二次判别法来预测一个序列片段中心残基的二级结构,最后对预测后的结果进行修正.对1645个蛋白进行检验,其21残基片段中心残基,1...
关键词:蛋白质二级结构 4肽结构字 多样性增量 二次判别法 结构涨落 边界修正 长程关联 
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