密码子用法

作品数：32被引量：484H指数：13
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相关机构：浙江大学四川农业大学湖南省农业科学院中国科学院更多>>
相关期刊：《动物医学进展》《作物学报》《茶叶科学》《分子植物育种》更多>>
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鸟王茶基因密码子偏好性分析被引量：13
《基因组学与应用生物学》2021年第2期795-801,共7页滕腾 赵懿琛 赵德刚 
山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室(贵州大学)开放课题基金资助项目;贵州省高层次创新型人才培养(黔科合人才[2016]4003号);贵州省研究生导师工作室(黔教研合GZS字[2016]03)共同资助。
生物体中普遍存在密码子使用偏好性,这对基因的异源表达效率具有较大影响。本研究使用CodonW软件对鸟王茶(Camellia sinensis var.niaowangensis)转录本中1856个编码氨基酸的基因密码子进行分析,计算其密码子相对使用度,确定了27个最优...
关键词：鸟王茶 密码子用法 高频密码子 密码子偏好性 
黄皮转录组密码子使用偏好性分析被引量：6
《分子植物育种》2018年第18期5904-5913,共10页陆育生 彭程 陈喆 常晓晓 邱继水 林志雄 潘建平 
广东省科技计划项目(2016B020201004);国家自然科学基金项目(31501729);广东省优稀水果产业技术体系项目(2016LM1071);农业部热带作物种质资源保护项目(16RZZY-20);广东省农业科学院院长基金项目(201605)共同资助
为全面了解黄皮(Clausena lansium)表达基因的密码子使用特点,以转录组测序获得的12 696条编码蛋白基因序列为数据来源,利用CodonW 14.4软件对其密码子碱基组成以及有效密码子数(effective number of codon, ENC)、同义密码子相对使用频...
关键词：黄皮 转录组 密码子用法 高频密码子 密码子偏好性 
金鱼密码子用法特点分析被引量：5
《华北农学报》2017年第A01期30-36,共7页张欣 尤宏争 李荣妮 朱莉飞 李文通 梁拥军 史东杰 孙砚胜 
北京市自然科学基金项目(8152017);公益性行业(农业)科研专项(201503108);北京市农林科学院所级科技创新团队建设(JNKST201616);农业部都市农业(北方)重点实验室(99124120)
不同物种间的同义密码子使用偏性存在差异,开展密码子偏好性研究可深入了解基因表达特征,为分子育种提供依据。利用Illumina Hi Seq 2000高通量测序技术获得金鱼的转录组数据,筛选符合条件的编码基因序列(Coding DNAsequence,简称CDS),...
关键词：金鱼 密码子 密码子偏好性 GC含量 
柿属植物叶绿体蛋白质编码基因密码子用法被引量：35
《经济林研究》2017年第2期38-44,共7页傅建敏 索玉静 刘慧敏 谭晓风 
"十二五"科技计划课题"涩柿种质资源收集评价与新品种选育"(2013BAD14B0502)
为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础,利用Codon W、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析。结果显示,柿属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基GC含量为26.9%~27.8%,有效密...
关键词：柿属植物 叶绿体 密码子偏好性 最优密码子 
家蚕cyp450基因家族密码子的用法分析被引量：2
《黑龙江畜牧兽医》2017年第4期46-50,291,292,共7页王晖 高妍夏 杨帆 苏萌 张东豪 宋永学 李季生 
承德医学院校级课题(201419);河北省高等学校科学技术研究项目(QN2016188);河北省教育厅重大课题(ZD2016044)
为了研究家蚕cyp450基因家族的密码子用法及影响密码子使用模式的主要因子,试验采用多种软件分析家蚕cyp450基因家族的碱基组成、序列同源性、密码子偏好性,得到统计cyp450基因家族密码子使用偏好性的各项参数,并对各项指数进行相关性...
关键词：家蚕 cyp450基因 密码子用法 自然选择 突变压力 
13种植物actin基因的密码子使用特性分析被引量：8
《南方农业学报》2016年第4期519-523,共5页赵洋 杨培迪 刘振 成杨 杨阳 
国家自然科学基金项目(31500565);国家茶叶产业技术体系建设专项项目(CARS-23)
【目的】分析13种植物actin基因的密码子组成、密码子偏性及聚类关系,了解其密码子使用模式及影响密码子使用的因素,为深入研究分子进化及物种进化提供参考。【方法】运用Codon W 1.4.4软件分析13种植物的肌动蛋白基因（actin）密码子...
关键词：ACTIN基因 密码子用法 密码子偏性 
小麦麦谷蛋白亚基基因密码子用法特性分析
《计算生物学》2016年第1期18-25,共8页曹兴芹 任燕萍 覃建兵 
该文运用CodonW1.4.2和SPSS16.0软件对13个来源于小麦麦谷蛋白亚基基因的密码子用法特性进行分析。结果显示,除1Dy10基因ENC值小于40外,其余亚基基因ENC值均介于40~50之间;GC3含量均在0.38~0.45之间;1Bx14基因偏向于使用A或T结尾的密码...
关键词：小麦 麦谷蛋白亚基 密码子偏爱性 
噬菌体Bp7尾丝蛋白gp38密码子用法及偏性分析
《动物医学进展》2015年第7期37-42,共6页孙虎芝 任慧英 张灿 
山东省自然科学基金项目(ZR2013CQ024;ZR2009DM009)
为了解噬菌体Bp7尾丝蛋白gp38的密码子使用特征,利用生物信息学方法对1株临床分离的多价烈性噬菌体Bp7尾丝蛋白gp38与其他5株T4类噬菌体进行密码子用法的分析比较。结果发现,Bp7尾丝蛋白gp38与其他5株T4类噬菌体密码子的使用模式差别大,...
关键词：噬菌体 Bp7 尾丝蛋白gp38 密码子 
珍珠鸟(Taeniopygia guttata)Z染色体基因表达的密码子用法
《江西农业大学学报》2013年第6期1279-1283,共5页王樟凤 柴学文 彭武林 黄润红 饶友生 
江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ12658);江西省自然科学基金项目(2010GZN0021)
从EMBL数据库下载珍珠鸟(Taeniopygia guttata)Z染色体全部基因的cDNA序列,共有610个基因的CDS序列纳入统计分析。使用CodonW(1.4.2)对CDS序列进行密码子偏性研究,确定了UUC、CUC、CUG等28个密码子为珍珠鸟Z染色体基因表达的"最优"密码...
关键词：珍珠鸟 Z染色体 密码子 用法 
结球甘蓝核基因组密码子使用偏爱性分析被引量：7
《园艺学报》2013年第10期1927-1934,共8页仪登霞 杨丽梅 方智远 刘玉梅 庄木 张扬勇 刘基生 刘博 武剑 耿丽丽 张杰 张振贤 
国家自然科学基金项目(31071697);国家‘863’计划项目(2008AA10Z105);国家大宗蔬菜产业技术体系项目(nycytx-35-gw01);‘十二五’国家科技支撑计划项目(2012BAD02B01);农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目
根据甘蓝测序结果,利用CodonW软件对结球甘蓝的48 000个蛋白质编码基因序列进行了分析,计算出同义密码子相对使用频率,确定了TCT、CCT、AGA、GTT、GCT、GAT等6个高频密码子。将甘蓝与大肠杆菌、拟南芥、棉花、水稻的密码子使用频率进行...
关键词：甘蓝 密码子用法 高频密码子 密码子偏爱性 
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