CTCF

作品数:87被引量:174H指数:6
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鸡CTCF基因真核表达载体的构建及其对脂类代谢作用的研究
《常熟理工学院学报》2025年第2期54-60,共7页夏磊 魏志恒 裴军 刘世昊 周博 徐璐 郁建锋 顾志良 
江苏省自然科学基金项目“RNA去甲基化酶FTO对鸡肝脏细胞脂类代谢和脂肪沉积作用的机制研究”(BK20191476)。
CCCTC结合因子(CCCTC-binding factor,CTCF)是一种多功能且高度保守的转录调节因子,参与转录调控、染色质结构维护、细胞分化等多种生物学过程.本研究通过RT-qPCR检测CTCF基因在鸡不同组织中的表达量,发现CTCF在脑和心脏中高表达.构建的...
关键词:CCCTC结合因子 鸡肝癌细胞 脂滴沉积 甘油三酯 脂类代谢相关基因 
头颈鳞状细胞癌患者CTCF、FAT1基因突变特征与表达水平及其对预后影响
《临床军医杂志》2025年第2期158-161,共4页李丹 杨瑞 刘兵 孙丁禹 汤雨龙 
辽宁省自然科学基金医工交叉联合基金(2022-YGJC-08)。
目的探讨头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者CTCF、FAT1基因的突变特征及表达情况,并分析其与患者预后的关系。方法回顾性分析了自2016年1月至2022年1月在北部战区总医院口腔科接受手术治疗的22例HNSCC患者的临床资料,通过基因组测序检测突变,...
关键词:头颈鳞状细胞癌 基因检测 预后 
Virus Infection Induces Immune Gene Activation with CTCF-anchored Enhancers and Chromatin Interactions in Pig Genome
《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》2024年第5期109-120,共12页Jianhua Cao Ruimin Ren Xiaolong Li Xiaoqian Zhang Yan Sun Xiaohuan Tian Ru Liu Xiangdong Liu Yijun Ruan Guoliang Li Shuhong Zhao 
supported by the National Key R&D Program of China(Grant No.2021YFF1000601);the Hubei Provincial Natural Science Foundation(Grant No.2023AFB1085);the Wuhan Science and Technology Major Project on Key Techniques of Biological Breeding and Breeding of New Varieties(Grant No.2022021302024853);the National Natural Science Foundation of China(Grant Nos.31772563,31790414,and 31771402);the Fundamental Research Funds for the Central Universities(Grant No.2662014PY067).
Chromatin organization is important for gene transcription in pig genome.However,its three-dimensional(3D)structure and dynamics are much less investigated than those in human.Here,we applied the long-read chromatin i...
关键词:CTCF ChIA-PET CHROMATIN Immunity PIG 
Permissive role of CTCF–Hoxb7a–Cdkn2a/b axis in the emergence of hematopoietic stem and progenitor cells during zebrafish embryogenesis
《Journal of Genetics and Genomics》2024年第9期974-977,共4页Wenjuan Zhang Xiaofen Liu Wenzhi Xue Lei Gao Dantong Li Changbin Jing Jian Zhao Weijun Pan 
supported by the National Key R&D Program of China(2018YFA0800203);the National Natural Science Foundation of China(Distinguished Young Scholars 31925014,Key Program 32130033;General Program 31571505);the Key Research Program of Frontier Sciences,Chinese。
Hematopoietic stem and progenitor cells(HsPCs)are a subset population of multi-potent cells with self-renewal capability and differentiation into all lineages of blood cells(Zhang and Liu,2024).HSPCs arise from the ve...
关键词:CTCF eliminate HEMATOPOIETIC 
CTCF调控小鼠AML12肝细胞系脂质代谢功能与基因表达
《上海交通大学学报(医学版)》2024年第9期1069-1082,共14页陈怀煌 左武 卞迁 
国家自然科学基金(32200432,32370607,32170544,31970585);上海市自然科学基金(23ZR1435700);上海高水平地方高校创新研究团队(SHSMUZLCX20211700);上海交通大学医学院“双百人”项目(20171920)。
目的·明确CCCTC结合因子(CCCTC-binding factor,CTCF)对肝细胞脂质代谢的调控作用,并探究CTCF调控肝细胞基因表达的作用机制。方法·通过慢病毒将稳定表达Ctcf shRNA的DNA序列整合到小鼠永生化的AML12肝细胞系中,实现对Ctcf的稳定敲低...
关键词:CCCTC结合因子(CTCF) AML12细胞系 脂质代谢 转录调控 
Chuanxiong Rhizoma extracts prevent liver fibrosis via targeting CTCF-c-MYC-H19 pathway被引量:4
《Chinese Herbal Medicines》2024年第1期82-93,共12页Yajing Li Fanghong Li Mingning Ding Zhi Ma Shuo Li Jiaorong Qu Xiaojiaoyang Li 
supported by the Beijing Municipal Science&Technology Commission(No.7212174);the National High-Level Talents Special Support Program to XL;National Key Research and Development Program on Modernization of Traditional Chinese Medicine(No.2022YFC3502100);National Natural Science Foundation of China(No.82004045 and No.82274186).
Objective:Hepatic fibrosis has been widely considered as a conjoint consequence of almost all chronic liver diseases.Chuanxiong Rhizoma(Chuanxiong in Chinese,CX)is a traditional Chinese herbal product to prevent cereb...
关键词:Chuanxiong Rhizoma CHOLANGIOCYTES ductular reaction Ligusticum chuanxiong Hort. liver fibrosis lncRNA H19 
CTCF介导的拓扑关联结构域边界的预测
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2023年第5期482-490,共9页孙慧敏 张利绒 刘利 韩璐 王云杰 
国家自然科学基金项目(61962041,62062053,61961031)。
转录因子的结合能够影响拓扑关联结构域(TAD)结构,进而限制了调控元件间的相互作用。以GM12878细胞系为研究对象,构建了转录因子CTCF介导的TAD边界和非边界数据集。然后,利用CTCF结合峰强度、模体打分、物种保守性、CTCF结合方向性和CTC...
关键词:转录因子CTCF 拓扑关联结构域 支持向量机(SVM) 
CTCF基因变异所致精神发育迟滞21型2例患儿的临床特征及遗传学分析被引量:1
《中华医学遗传学杂志》2023年第5期543-546,共4页律玉强 宋风玲 张开慧 高敏 马健 王东 宛雅 刘毅 盖中涛 
山东省自然科学基金(ZR2020QC066);济南市卫生健康委员会科技计划(2019-1-35)。
目的分析2例发育迟缓患儿的临床及遗传学特征。方法以2021年8月18日就诊于山东大学附属儿童医院的2例患儿为研究对象, 对其进行临床和实验室检查。采集患儿及其父母的外周血样, 同时进行染色体核型和高通量测序分析。结果 2例患儿均表...
关键词:发育迟缓 精神发育迟滞21型 CTCF基因 高通量测序 
CTCF基因突变致胎儿不良妊娠结局的遗传学分析
《中国产前诊断杂志(电子版)》2023年第1期18-22,共5页谢潇潇 蒋晓莹 胡凌云 周红辉 汪龙霞 游艳琴 卢彦平 
国家重点研发计划(2021YFC1005300);军队育龄家庭出生缺陷的遗传病学研究(19JSZ16)。
目的探讨CTCF基因致病突变的产前遗传学分析及咨询。方法运用染色体核型分析、荧光原位杂交技术(FISH)、染色体微阵列分析(CMA)及全外显子组测序技术(WES)对一例产前超声发现双侧肾脏回声增强结构模糊的胎儿进行产前遗传学检测。结果核...
关键词:CTCF基因 双肾回声增强 全外显子组测序 胎儿 
敲低CTCF对5-氟尿嘧啶、顺铂耐药结直肠癌细胞恶性生物学行为的影响及其机制被引量:5
《山东医药》2023年第1期42-46,共5页王蓉荻 郭旭 徐孟 
目的探讨敲低CCCTC结合因子(CTCF)对5-氟尿嘧啶(5-Fu)、顺铂(DDP)耐药结直肠癌(CRC)细胞恶性生物学行为的影响及其机制。方法体外传代培养CRC耐药细胞株HT29/5-Fu、HT29/DDP,筛选HT29/5-Fu、HT29/DDP细胞半数抑制活性(IC_(50))时5-Fu或...
关键词:结直肠癌 5-氟尿嘧啶 顺铂 化疗耐药 恶性生物学行为 HEDGEHOG信号通路 
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