GENBANK数据库

作品数：20被引量：97H指数：6
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基于GenBank数据库的不同基因型细粒棘球绦虫系统进化分析被引量：1
《中国血吸虫病防治杂志》2020年第1期36-46,59,共12页吴世乐 朱文君 范得艳 石兵强 安永德 王春亮 韩秀敏 郭亚民 
青海省卫生科技计划项目(2017-wjzdx-22)。
目的分析GenBank数据库中公布的细粒棘球绦虫各基因型细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(Cox1)基因序列,探索细粒棘球绦虫各基因型在全球不同地区的遗传变异及分化情况。方法收集GenBank数据库中公布的不同基因型细粒棘球绦虫Cox1基因序列,排除同...
关键词：细粒棘球绦虫 基因型 进化分析 细胞色素氧化酶亚基Ⅰ 
我国部分新型布尼亚病毒分离株全基因组序列分析被引量：2
《江苏预防医学》2018年第6期623-625,648,共4页刘秀兰 姚学君 张雪峰 管书慧 姜仁杰 
江苏省重大传染病防控科技示范项目(BE2015714);江苏省流行病学重点学科(ZDXK A2016008)
目的 分析我国新型布尼亚病毒分离株全基因组序列，了解遗传进化特点。 方法 利用DNA STAR和MEGA 6.0软件，对GenBank数据库收录的我国75株分离株全基因组序列进行分析，构建系统进化树，并对毒株核苷酸和氨基酸突变位点进行统计。 结...
关键词：新型布尼亚病毒 全基因组 序列分析 GENBANK数据库 
苹果褪绿叶斑病毒辽宁分离物生物学和基因组研究被引量：3
《植物病理学报》2018年第5期716-720,共5页张双纳 李正男 张尊平 范旭东 任芳 胡国君 董雅凤 
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610182016017);中国农业科学院科技创新工程
苹果褪绿叶斑病毒（Apple chlorotic leaf spotvirus，ACLSV）属于乙型线形病毒科（Betaflexiviridae）纤毛病毒属（Trichovirus），基因组为正义单链RNA。含有约7500个核苷酸。编码3个部分重叠的开放阅读框。目前从GenBank数据库可以...
关键词：苹果褪绿叶斑病毒 基因组序列 分离物 GENBANK数据库 生物学 辽宁 开放阅读框 ACLSV 
美国Dryad数据库共享政策及启示被引量：7
《中国科技资源导刊》2015年第6期48-52,94,共6页林芳芳 赵辉 
国外开放数据库数据共享政策对国内数据库建设和运维具有一定借鉴意义，有利于促进国内数据共享的发展。以Dryad数据库为例，从数据收集、数据发布、数据保存、收费和使用4个角度进行分析，采用对比分析法将Dryad与GenBank、Figshare进...
关键词：Dryad数据库 数据共享政策 开放数据库 GENBANK数据库 Figshare数据库 
GenBank数据库中黄麻EST-SSR标记的开发及其通用性评价被引量：15
《作物学报》2014年第7期1213-1219,共7页张立武 袁民航 何雄威 刘星 方平平 林荔辉 陶爱芬 徐建堂 祁建民 
高等学校博士学科点专项科研基金新教师类资助课题(20133515120002);国家现代农业产业技术体系建设项目(CARS-19-E06);农业部东南黄红麻实验观测站(农科教发2011);国家自然科学基金项目(31000734)资助
从GenBank公共数据库中下载黄麻表达序列标签838条,利用SSRPrimer软件对其进行SSR位点查找,利用Primer 3.0软件设计66对SSR引物,通过琼脂糖凝胶研究这些SSR引物的PCR扩增特点,以检测其多态性。结果表明,66对SSR引物在黄麻属6个不同类型...
关键词：黄麻 EST SSR 标记开发 多态性 
GenBank数据库中微生物rDNA序列准确性研究被引量：4
《食品与发酵工业》2012年第3期28-31,共4页陈源源 沈微 樊游 石贵阳 王正祥 
国家自然资源科技平台(No.2005DKA21208);教育部科技基础条件平台(No.505006)资助
rDNA序列同源性分析是目前常用的一种微生物分子鉴定方法。在该方法中,待鉴定微生物的rDNA序列需要与GenBank数据库中的相关序列进行同源性比对,从而得出该菌株的具体种属。从GenBank数据库中收集了细菌16S rDNA序列、丝状真菌ITS序列...
关键词：微生物鉴定 GENBANK数据库 RDNA序列 准确性 
携带双毒力基因的副溶血性弧菌tdh、trh基因分子特征研究被引量：2
《应用预防医学》2010年第5期257-259,共3页王红 黄彦 唐振柱 李秀桂 孙贵娟 吕素玲 黄立嵘 程国强 
目的了解广西境内海产品牡蛎中分离到的携带tdh和trh两种毒力基因的副溶血性弧菌GX21的基因分子特征,分析与各地副溶血性弧菌的相关性,探讨水产品中副溶血性弧菌流行趋势。方法将监测海产品牡蛎中分离到的一株携带两毒素基因的副溶血性...
关键词：副溶血性弧菌 毒力基因 GENBANK数据库 比对 
GenBank数据库和PubMed数据库中序列数据信息检索比较被引量：3
《中华医学图书情报杂志》2009年第3期44-46,共3页李轶 
通过对GenBank数据库和PubMed数据库的数据来源、检索界面和检索结果等的对比分析,发现2个检索库检索的序列数据信息存在差别,GenBank数据库检索结果和检准率均高于PubMed数据库。
关键词：GENBANK PUBMED ENTREZ 生物信息学 医学文献检索 
茶园土壤耐酸铝微生物的分离鉴定及其耐铝特性研究
《中国茶叶》2008年第5期40-40,共1页
对茶园土壤中耐酸铝微生物进行分离纯化，并选择其中的3株真菌，用通用引物NS1和NS8 PCR扩增出全长18S rDNA基因，测序后与GenBank数据库中的相似序列构建系统发育树，结合真菌形态分析，初步鉴定为：Aspergillus zonatus，Penicilliums...
关键词：分离鉴定 茶园土壤 耐酸铝 微生物 ASPERGILLUS 特性 GENBANK数据库 RDNA基因 
肝癌差异表达基因EEG1的克隆和鉴定
《世界华人消化杂志》2008年第8期829-832,共4页黄春玲 王效民 张忠英 邱兴峰 刘平果 李岗山 彭友源 
目的:筛选和克隆肝癌和正常肝组织差异表达的基因片段,以探讨肝癌的发病机制.方法:应用mRNA差异显示技术(mRNA-DD),比较肝癌及正常肝组织基因表达的差异,对获得的差异基因片段进行克隆、测序,测序结果提交GenBank数据库中进行同源性分析...
关键词：差异表达基因 肝癌组织 MRNA差异显示技术 GENBANK数据库 克隆 正常肝组织 差异基因片段 RT-PCR 
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