陈启龙

作品数:21被引量:128H指数:7
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供职机构:上海大学更多>>
发文主题:肺癌组织基因突变SOX基因肺癌SOX更多>>
发文领域:生物学医药卫生自动化与计算机技术文化科学更多>>
发文期刊:《中国医学生物技术应用》《四川动物》《应用生态学报》《计算机与应用化学》更多>>
所获基金:安徽省高校省级自然科学研究项目国家自然科学基金安徽省优秀青年科技基金安徽省自然科学基金更多>>
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一种新的基因注释语义相似度计算方法被引量:4
《生物信息学》2010年第1期23-29,共7页吴飞珍 马文丽 王旺迪 陈启龙 郑文岭 
上海大学研究生创新基因资助
基因本体(GO)数据库为基因提供了统一的注释,有效地解决了不同数据库描述相同基因的不一致问题。但是,根据基因注释如何比较基因的功能相似性,这个问题仍然没有得到有效解决。本文提出一种新的基因注释语义相似度计算方法,这种方法在本...
关键词:基因本体 基因注释 语义相似度 
肺癌组织中SOX4突变蛋白三级结构的建模及分析(英文)被引量:2
《计算机与应用化学》2009年第12期1567-1570,共4页陈启龙 郑文岭 马文丽 吕顺清 
supported by the National Science Foundation of China(39880032);the Youthful Teacher Foundation of Anhui Province(2006jq1235);the Science Foundation of Huangshan University(2007xkjq026);the Innovative Foundation of PhDs of Shanghai University~~
SOX家族与很多人类肿瘤的发生有关.对人类肺癌组织中的SOX4进行测序,发现该基因HMG-box区有突变发生并导致SOX4蛋白的107密码子发生突变.以三级结构已知的SOX2为模板,采用同源建模方法对突变和正常SOX4蛋白FMG-box进行建模.结果显示突...
关键词:同源建模 三级结构 SOX4突变 肺癌 
复合编码支持向量机预测蛋白质二级结构
《微计算机信息》2009年第13期276-278,共3页郑欣亚 马文丽 陈启龙 郑文岭 
基金申请人:马文丽;项目名称:基因组研究与基因分离中DNA阵列技术;基金颁发部门:国家自然科学基金委(39880032)
蛋白质结构与功能一直是生命科学的研究重点。尽管蛋白质二级结构的预测已得到广泛的应用,但其预测的精度一直受到算法的制约。在本文中,采用复合编码代替传统的氨基酸编码方式,结合氨基酸疏水性对蛋白质结构的影响,提出一种新的支持向...
关键词:复合编码 二级结构 三元支持向量机 交叉验证 
分子生物学实验教学的探讨被引量:12
《黄山学院学报》2009年第3期136-138,共3页陈启龙 杨和建 
安徽省教育厅教学研究基金资助(2007jyxm443)
受实验操作技能和实验室条件的影响,一般本科院校的分子生物学实验教学面临极大挑战。文章从地方本科院校的实际出发,就分子生物学的实验内容选择、实验教学方法优化及实验教学效果评价等方面进行探讨,为分子生物学实验课程的不断完善...
关键词:分子生物学 实验教学 教学方法 
基于SwissPdbViewer和MATLAB对人类SOX蛋白三级结构建模及分析(英文)
《系统仿真学报》2008年第14期3637-3643,共7页陈启龙 郑文岭 姚文娟 吴飞珍 马文丽 
国家自然科学基金(39880032);安徽省高校青年教师资助基金(2006jql235);上海大学博士研究生创新基金(2007053)
SOX蛋白具有一个与DNA特异结合的高保守HMG-box结合域。利用MATLAB的Sequence Analysis工具从Genbank中下载人类SOX蛋白序列信息,二次筛选获得22个有效的序列数据。以三级结构已知的SOX2、SRY、SOX5为模板,联合SwissPdbViewer与MATLAB,...
关键词:MATLAB SwissPdbViewer 同源建模 三级结构预测 SOX蛋白 
基于SwissPdbViewer和MATLAB对东北虎Sox蛋白三级结构建模及分析(英文)
《四川动物》2008年第6期997-1002,共6页梁俊毅 陈启龙 
上海大学博士研究生创新基金(2007053)
SOX蛋白具有一个与DNA特异结合的高保守HMG-box结构域。为研究东北虎SOX蛋白三级结构的分子机理,利用MATLAB的Bioinformatics工具从GenBank中下载东北虎SOX蛋白序列信息,以三级结构已知的SOX2为模板,联合SwissPdbViewer与MATLAB,采用同...
关键词:SOX蛋白 MATLAB 同源建模 三级结构 东北虎 
基于12S rRNA基因序列探讨凹耳蛙(无尾目,蛙科)的分类地位被引量:6
《动物分类学报》2007年第3期738-742,共5页唐鑫生 陈启龙 黄松 
安徽省教育厅自然科学基金项目(2004kj329);安徽省高校教学研究项目(2005311);黄山学院校级科研项目(2006XKJ008)资助
为探讨凹耳蛙Rana tormotus的分类地位,测定了凹耳蛙线粒体12S rRNA基因序列,并从GenBank中下载了蛙科33种蛙的同源序列进行分析,用BI法、NJ法和MP法构建分子系统树。结果表明:3种树拓扑结构基本一致,都显示凹耳蛙与长吻胡湍蛙Huia nas...
关键词:凹耳蛙 凹耳湍蛙 12S rRNh基因 湍蛙属 臭蛙属 分类地位 
生物芯片技术及其应用前景被引量:4
《资源开发与市场》2007年第8期725-727,共3页陈启龙 唐鑫生 
安徽省高校青年教师科研资助项目(2006jql235)
生物芯片技术是一项发展迅速的高新技术,广泛应用于生物、医学、农业、环境检测和食品科学等领域,市场前景十分广阔。阐述了生物芯片的基本概念、分类及其主要应用,并对其发展前景作了展望。
关键词:生物芯片 基因 应用前景 
大绿蛙Sox基因和Dmrt基因的序列分析被引量:2
《激光生物学报》2007年第3期310-314,共5页陈启龙 马文丽 郑文岭 姚文娟 聂刘旺 
黄山学院院级科研基金(2004ykj006)
Sox基因家族与Dmrt基因家族在胚胎发育及性别分化中起着重要作用。采用PCR方法,扩增了大绿蛙Sox基因和Dmrt基因的保守区,分别获得长约220 bp和140 bp的片段。序列分析表明,大绿蛙雌雄个体之间Sox基因、Dmrt基因序列没有差异,与人和其它...
关键词:大绿蛙 SOX基因 DMRT基因 
非小细胞肺癌组织SOX4基因突变分析被引量:9
《中华医学遗传学杂志》2007年第5期505-509,共5页陈启龙 郑文岭 姚文娟 聂刘旺 程双怀 马文丽 
安徽省教育厅自然科学基金(2003kjl70),安徽省高校青年教师基金(20D6jql235)
目的研究不同病理类型和病理分期的非小细胞肺癌组织中SOX4基因序列突变情况,探讨SOX4基因在肺癌发生过程中的作用。方法PCR扩增肺癌及癌旁组织SOX4基因HMG-box,并对经单链构象多态性分析有差异的20例病例进行测序。DNA及氨基酸序列...
关键词:肺癌 非小细胞肺癌 SOX4基因 基因突变 
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