国家自然科学基金(60761001)

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离散增量结合二次判别分析预测人类DNA甲基化位点
《生物数学学报》2012年第3期563-570,共8页刘佳 赵秀娟 裴智勇 秦笙 蔡禄 
国家自然科学基金资助项目(60761001);内蒙古自然科学基金(2011MS0504);高等学校科学研究基金(NJZY12103)
DNA甲基化作为直接作用于DNA序列的一种表观遗传修饰,能够在不改变DNA分子一级结构的情况下影响基因表达,在生命活动中扮演着重要的角色.在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在C_pG二核苷酸的胞嘧啶上,并且在基因组中呈现不均匀分布.准确预...
关键词：DNA甲基化 CpG位点 离散增量 二次判别分析 
IDQD算法预测人类蛋白质相互作用
《生物信息学》2010年第4期341-343,346,共4页刘佳 蔡禄 邢永强 
国家自然科学基金资助课题(编号:60761001)
蛋白质是一切生命活动的物质基础,研究蛋白质的相互作用有助于理解生物过程的分子机制,阐明疾病的分子机理。本文依据蛋白质序列组分特征,应用基于多样性增量的二次判别分析方法,对人类的1 963对蛋白质相互作用进行了预测。自洽检验的...
关键词：蛋白质相互作用 多样性增量 二次判别分析 
酵母蛋白质相互作用网络中Hub蛋白分类及作用规律的研究
《生物物理学报》2010年第6期488-496,共9页秦笙 蔡禄 
国家自然科学基金项目(60761001)~~
在蛋白质相互作用网络层面研究蛋白质的生物学功能已成为系统生物学的一项重要工作。Hub蛋白是指蛋白质相互作用网络中连接数较高的蛋白,在生命活动中行使着极为重要的功能。然而仅仅依靠连接数并不能准确反映出蛋白质在生物学网络中的...
关键词：蛋白质相互作用网络 Hub蛋白 GENE Ontology注释 分类 
多样性增量结合支持向量机方法预测酵母核小体定位被引量：1
《生物物理学报》2010年第5期421-428,共8页赵秀娟 裴智勇 刘佳 蔡禄 
国家自然科学基金项目(60761001);内蒙古科技大学创新基金(2009NC066)~~
作为目前遗传学热点领域表观遗传学的重要研究课题,核小体定位参与多种生物学过程并起着非常关键的作用,因此用理论方法预测核小体定位具有重要的生物学意义。该工作以酵母基因组为研究对象,根据其核心DNA与连接DNA序列的组分特征差异,...
关键词：核小体定位 多样性增量 支持向量机 
基于蛋白序列的IDQD算法预测蛋白质相互作用被引量：2
《生物数学学报》2010年第3期501-507,共7页刘佳 裴智勇 邢永强 蔡禄 
国家自然科学基金资助项目(60761001)
基于蛋白质序列组分信息,提出一个离散增量结合二次判别分析法(IDQD)预测蛋白质相互作用的模型,对人类蛋白质相互作用进行预测.自洽检验的识别精度达到75.89%,3-fold交叉检验的敏感性和特异性分别为64.22%和64.68%.结果表明IDQD算法可...
关键词：蛋白质 相互作用 离散增量 二次判别分析 
MSAP技术在植物抗逆性方面的应用被引量：14
《生物技术通报》2010年第6期71-74,79,共5页韩雅楠 赵秀娟 蔡禄 
国家自然科学基金(60761001)
DNA甲基化在植物的生长发育中起着重要的作用。近年来,随着对DNA甲基化研究的重视,基于PCR方法检测DNA甲基化水平的甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)得到广泛的应用。综述了MSAP技术在植物的生物与非生物胁迫研究方面的应用。
关键词：DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性 抗逆性 
基于二级结构预测蛋白质复合体亚基相互作用
《内蒙古科技大学学报》2010年第1期76-79,共4页裴智勇 任松叶 蔡禄 
国家自然科学基金资助项目(60761001)
蛋白质相互作用在生命活动中起着核心作用,蛋白质复合体亚基的结合是蛋白质相互作用的一种重要形式.由于实验方法耗时耗力,因此从理论上预测蛋白质相互作用有着特殊的意义.首先对蛋白质复合体的结合区统计其二级结构、超二级结构和二级...
关键词：二级结构 超二级结构 蛋白质相互作用 支持向量机 
基于二级结构信息的蛋白质相互作用贝叶斯分类预测被引量：1
《内蒙古科技大学学报》2010年第1期80-83,共4页秦笙 蔡禄 
国家自然科学基金资助项目(60761001)
蛋白质相互作用在许多生物学过程中扮演重要角色.蛋白质直接相互作用依赖其空间结构,蛋白质二级结构作为其空间结构的基本元件应该包含相互作用的信息.基于相互作用蛋白对二级结构信息,提出一个蛋白质相互作用的贝叶斯分类器预测模型....
关键词：蛋白质相互作用 二级结构 贝叶斯分类 
基于GO的酵母膜系统蛋白相互作用规律研究
《内蒙古大学学报（自然科学版）》2010年第1期85-90,共6页蔡禄 裴智勇 季风 江威 
国家自然科学基金资助项目(60761001)
引进描述蛋白质相互作用倾向性参数(PIRB),基于GO(Gene Ontology)和相关的数据库中蛋白质功能注释,对酿酒酵母部分膜蛋白相互作用规律进行了研究,构建了基于PIRB的蛋白质相互作用网络图.结果表明各类膜蛋白质之间的相互作用具有明显的...
关键词：蛋白质相互作用 基因本体 相对倾向性因子 膜蛋白 酿酒酵母 
核小体定位研究进展被引量：8
《生物物理学报》2009年第6期385-395,共11页蔡禄 赵秀娟 
国家自然科学基金项目(60761001)~~
核小体定位在诸如转录调控、DNA复制和修复等多种细胞过程中起着重要作用。基因组上核小体位置的确定涉及DNA、转录因子、组蛋白修饰酶和染色质重塑复合体之间的相互作用。核小体定位、组蛋白修饰、染色质重塑等问题已成为目前遗传学研...
关键词：核小体定位 基因表达 实验图谱 理论预测 
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