复旦大学理论生命科学研究中心

作品数：20被引量：163H指数：5
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发文作者：刘捷孟贺平安徐昭更多>>
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元基因组学方法在环境微生物中的研究进展被引量：2
《生物技术通报》2015年第11期51-59,共9页刘捷孟 戚继 
新一代测序技术的快速发展,使得元基因组学研究方法成为了理解环境微生物群落结构和相互作用的重要手段之一。元基因组学方法不需要将环境样本中的微生物单独分离培养,而是作为整体进行研究,因而可以回避传统研究时分离培养微生物的困...
关键词：元基因组 高通量测序 生物信息 环境微生物 
生物领域是数理和计算科学的广阔用武之地被引量：1
《科技导报》2010年第11期3-3,共1页郝柏林 
生物是物,生物有形、生物有数、生物有理。DNA双螺旋结构和遗传密码的发现,开启了分子生物学时代。生物学已经积累了大量事实和数据,而且每日每时产生着海量新数据。2003年完成的人类基因组计划，花费了约30亿美元测定一个人基因组的30...
关键词：生物领域 计算科学 人类基因组计划 DNA双螺旋结构 遗传密码 分子生物 生物学 
生物领域是数理和计算科学的广阔用武之地
《生理通讯》2010年第3期62-63,共2页郝柏林 
生物是物，生物有形、生物有数、生物有理。DNA双螺旋结构和遗传密码的发现，开启了分子生物学时代。生物学已经积累了大量事实和数据，而且每日每时产生着海量新数据。2003年完成的人类基因组计划，花费了约30亿美元测定一个人基因组...
关键词：生物领域 计算科学 人类基因组计划 DNA双螺旋结构 生物学规律 基因组测序 遗传密码 分子生物 
CVTree在454高通量测序分析菌群结构中的应用被引量：10
《中国微生态学杂志》2010年第4期312-316,共5页华蔚颖 徐昭 张梦晖 李旻 张晨虹 赵立平 
863专题项目(2008AA02Z315);自然基金项目(30730005;20875061);上海市科委国际合作项目(075407001)
目的探究将基于短串频度的CVTree方法用于反映菌群结构的16S rRNA基因的454高通量测序数据分析的可行性,为快速分析高通量菌群结构数据提供新的方法。方法对一个四世同堂的中国家庭7名成员肠道菌群和不同基因型及饮食类型的小鼠肠道菌群...
关键词：CVTree 454高通量测序 菌群结构 
怀念陈春先
《物理》2009年第11期817-819,共3页郝柏林 
关键词：物理学家 理论研究 科学工作者 陈春先 
周光召同志的学风被引量：1
《物理》2009年第5期295-297,共3页郝柏林 
关键词：学风 物理研究所 理论物理 自然科学 格林函数 行政工作 近距离 
老老实实做研究
《中国学术期刊文摘》2006年第18期I0001-I0001,共1页郝柏林 
我国科学界存在的不正之风，正在受到社会各界首先是学术界的关注。其实，净化学术环境，关键就在于“老实”二字。农民种地，工人做工，天经地义。科学家是劳动者，首先就要老老实实地劳动。科学院院士要亲身做研究，而不是靠旧日老本...
关键词：科学家 学术环境 研究人员 劳动者 学术界 科学院 实验室 
老老实实做研究被引量：5
《科技导报》2006年第1期1-1,共1页郝柏林 
关键词：学术环境 学术界 学术研究 自然科学基础研究 
利用Pearson相关系数定量分析生物亲缘关系被引量：103
《计算机工程与应用》2005年第33期79-82,99,共5页张宇镭 党琰 贺平安 
论文主要利用计算语言学中使用的统计学方法定量分析生物物种的亲缘关系。以包含生物体遗传信息的核酸序列为研究对象,采用计算语言学的思想和方法,将每一个生物体的核酸序列看作一篇很长的自然语言文本,抽取核酸序列的双核苷酸频率分...
关键词：Pearson相关系数 核酸序列 自然语言文本 
组分距离方法构建基于核糖体蛋白质或氨酰tRNA合成酶的原核生物亲缘树被引量：4
《中国科学（C辑）》2004年第2期186-194,共9页卫海滨 戚继 郝柏林 
国家重点基础研究项目(批准号: G2000077308);国家自然科学基金(批准号: 30170232);中国科学院创新工程资助项目;上海市通过复旦大学的资助
最近新发展的基于计算短串频度,推断原核生物系统发生关系的K串组分距离方法,以整个蛋白质组作为数据集.采用每个物种的全部核糖体蛋白质或氨酰tRNA合成酶,得到一致结果.已知后一组蛋白质在单个使用时,产生彼此不同的进化树.我们构建进...
关键词：古细菌 系统发生树 组分距离 核糖体蛋白质 氨酰TRNA合成酶 原核生物亲缘树 
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