系统进化关系

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6种雪茄品系叶绿体基因组比较分析及系统发育关系研究
《特产研究》2025年第1期59-66,78,共9页施友志 申民翀 王剑 潘勇 杜甫 纪桂霞 赵泽玉 李子玮 王琰琰 贾志忠 袁晓龙 吴创 
湖北中烟工业有限责任公司重点科技项目(2021JCYL3SX2A006)。
为探究国内栽培雪茄烟的品系来源,本研究采用第二代测序技术对6种雪茄烟的叶绿体基因组进行了测序和组装,解析了其叶绿体基因组的结构特点,并构建其系统进化关系。结果表明,6种雪茄烟具有典型的叶绿体基因组的4个分区:大单拷贝区(Large ...
关键词：雪茄 叶绿体基因组 系统进化关系 种质资源 
1个侵染贵州火龙果的仙人指X病毒新的分离物基因组序列分析
《贵州农业科学》2025年第1期83-89,共7页郑乾明 王小柯 马玉华 
贵州省高层次创新型人才项目“百层次人才”(黔科合平台人才-GCC〔2022〕025-1);贵州省科技计划项目“贵州山地特色果树种质资源库创新能力建设”(黔科合服企〔2021〕8)。
【目的】分离侵染贵州火龙果的仙人指X病毒(Schlumbergera virus X,SchVX)基因组全长序列,了解其系统进化和遗传变异,为开展贵州火龙果病毒检测和防控奠定基础。【方法】从前期开展的火龙果成熟茎全长转录组测序获得的转录本中筛选SchV...
关键词：火龙果 仙人指X病毒 外壳蛋白 序列一致率 系统进化关系 
了哥王叶绿体基因组分析
《浙江农林大学学报》2024年第2期297-305,共9页吴民华 叶晓霞 谭靖怡 梁秋婷 吴子健 黄琼林 
广东省基础与应用基础研究基金项目(2018A030310116);广东省大学生创新创业训练计划项目(S202310571113);广东医科大学大学生创新创业训练计划项目(GDMU2022113,GDMU2022125)。
【目的】阐明药用植物了哥王Wikstroemia indica的叶绿体基因组结构特点及系统进化地位,为了哥王的资源保护和可持续利用提供科学依据。【方法】采用Illumina测序平台进行了哥王叶绿体基因组测序,并通过生物信息技术和软件进行序列拼接...
关键词：了哥王 叶绿体基因组 密码子偏好性 简单重复序列 序列比对 系统进化关系 
甘蔗野生种割手密叶绿体基因组特征及种内系统进化关系
《基因组学与应用生物学》2023年第12期1295-1310,共16页余熙恺 余泽怀 张清 张兴坦 
国家自然科学基金项目(32222019,32201794)共同资助。
甘蔗野生种割手密(Saccharum spontaneum)为栽培种甘蔗提供了对多种病原菌与逆境具有抗性的优良性状。本研究基于已发表的群体重测序数据,组装并注释了来自亚洲、地中海、印度次大陆、非洲等地域的64个割手密的叶绿体基因组。组装结果显...
关键词：甘蔗属 割手密 叶绿体基因组 系统发育分析 生物信息学 
猫尾草叶绿体基因组结构及其解析被引量：1
《福建农业学报》2023年第9期1094-1102,共9页吴民富 李莎 高柔敏 吴民华 黄琼林 
广东省基础与应用基础研究基金项目(2020A1515110332);湛江市科技计划项目(2019A01008)。
【目的】阐明岭南药食两用植物猫尾草的叶绿体基因组结构特征,为猫尾草资源的保护、利用和开发提供理论依据。【方法】采用高通量测序技术开展猫尾草叶绿体基因组测序,并通过生物信息方法进行拼接、注释、解析以及系统进化分析。【结果...
关键词：猫尾草 叶绿体基因组 结构分析 序列比对 系统进化关系 
蔷薇科小G蛋白ROP的鉴定、分类及特征分析被引量：1
《华北农学报》2023年第S01期8-17,共10页刘礼瑶 熊仁次 何璐 马思洁 杨叔青 
国家自然科学基金项目(32160644);塔里木大学校长基金项目(TDZKBS202101)。
为全面系统地挖掘蔷薇科小G蛋白ROP,在分子水平上为蔷薇科抗病育种提供候选基因。物种系统进化关系分析、ROP蛋白全基因组筛查、Rho功能域分析、蛋白聚类分析及理化性质分析分别运用了NCBI、iTOLv6、GDR、SMART、MEGA 11.0和Maximum-lik...
关键词：蔷薇科 小G蛋白ROP 全基因组筛查 Rho功能域 系统进化关系 蛋白理化特征 
芜菁花叶病毒广东分离物的分子特征和序列分析被引量：3
《植物保护学报》2021年第4期929-930,共2页汤亚飞 张丽 李正刚 蓝国兵 于琳 何自福 佘小漫 
广东省重点研发计划(2019B020217003-05);国家重点研发计划(2018YFD0201209);广东省现代农业产业技术体系创新团队建设项目(2019KJ110);科技创新战略专项资金(高水平农科院建设)(R2019PY-JX005)。
芜菁花叶病毒(turnip mosaic virus,TuMV)是一种(+)ssRNA病毒,基因组全长约为10 kb,根据其基因组系统进化关系,可划分为basal-Brassica(basal-B)、basal-Brassica/Raphanus(basal-BR)、Asian-Brassica/Raphanus(Asian-BR)、world-Brassi...
关键词：芜菁花叶病毒 寄主范围 十字花科蔬菜 分离物 TUMV 系统进化关系 
基于cox3基因分析蛇源裂头蚴种系发育关系被引量：5
《中国预防兽医学报》2020年第6期622-624,共3页谢雯琴 唐伟 胡丹 杨凌宸 刘伟 
湖南省教育厅优秀青年基金项目(17B126);湖南省科技厅项目(2016NK2104);湖南省畜牧局项目(2139999)。
为分析野生蛇源裂头蚴与其它绦虫的种群遗传关系,本研究采集湖南省8个地区野生蛇肌肉中的裂头蚴,采用PCR方法对其线粒体cox3基因序列进行扩增、测序及分析。结果显示,湖南省8个裂头蚴分离株cox3基因核苷酸部分序列长度均为342 bp,其cox...
关键词：蛇 裂头蚴 cox3基因 系统进化关系 
基于线粒体D-loop区和COI基因序列研究2个禾花鲤群体和野生鲤群体的遗传多样性与系统进化关系被引量：19
《淡水渔业》2019年第6期33-40,共8页潘贤辉 周康奇 陈忠 杜雪松 黄姻 覃俊奇 文露婷 潘志忠 邓潜 罗辉 叶华 林勇 
广西创新驱动发展专项资金项目(AA17204080-5);自治区主席科技资金项目(16449-0602);广西科技重大专项资金项目(AA17204095-3);国家自然科学基金资助项目(31960730)
利用线粒体D-loop区和COI基因序列分析了全州禾花鲤(Quanzhou Procypris merus)、融水禾花鲤(Rongshui P.merus)和野生鲤鱼群体的遗传多样性和系统进化关系。基于D-loop区序列分析结果表明:序列长度为927~930 bp,共统计变异位点53个;A、...
关键词：线粒体DNA 禾花鲤(Procypris merus) 遗传多样性 系统进化 
藏系绵羊mtDNA和Y染色体遗传多样性的检测与系统进化关系的分析被引量：4
《黑龙江畜牧兽医》2019年第4期45-47,51,179,共5页董泽生 高雪 吴燕华 李蕾蕾 付弘赟 张瑞娜 贾功雪 
国家重点研发计划项目(2016YFC0501805);青海省重点研发与转化计划项目(2017-NK-114);青海省自然科学基金项目(2017-ZJ-915Q)
为了评估青海地区藏系绵羊各类群的遗传结构与分子进化关系,试验选择青海地区四个典型的地理生态类群(山谷型、欧拉型、高原型和扎什加型)藏羊,提取血液基因组DNA后,分别对线粒体D-loop区序列和Y染色体Sry基因序列进行特异性扩增并测序...
关键词：藏系绵羊 线粒体DNA Y染色体 系统发育 遗传多样性 遗传距离 
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