内含子序列

作品数：31被引量：77H指数：6
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线粒体核糖体蛋白基因中内含子序列间匹配特性分析
《内蒙古师范大学学报（自然科学版）》2021年第3期219-225,共7页冯雪 李瑞芳 杨萨如拉 程永霞 赵瑞峰 
内蒙古自治区自然科学基金资助项目(2019MS03042);内蒙古自治区高等学校科学技术研究资助项目(NJZY17043);内蒙古师范大学科研创新基金资助项目(CXJJSS19112)。
选取线粒体核糖体蛋白基因序列为样本,采用Smith-Waterman方法,通过局部比对得到了每个物种基因的第一内含子与其它内含子序列之间的最佳匹配片段。以此为基础,分析了第一内含子序列特征及其与同基因中其它内含子的相互匹配特性。结果显...
关键词：线粒体核糖体蛋白 最佳匹配片段 局域比对 内含子 
mRNA序列与相应UTR中内含子序列的相互作用被引量：1
《内蒙古大学学报（自然科学版）》2020年第4期384-391,共8页张强 赵小庆 薄素玲 曹艳娟 苏文霞 
内蒙古农业大学博士科研启动基金(NDYB2016-13);内蒙古农业大学基础学科科研启动基金(JC2017003);国家自然科学基金(11747084);内蒙古自然科学基金(2018BS03001)。
UTR区中的内含子对基因的表达调控过程发挥着重要的作用,它通过与相应mRNA的序列匹配方式发生相互作用并实现对基因的表达调控。采用Smith-Waterman算法进行局域比对,获得UTR区中的内含子与相应mRNA序列之间的最佳匹配片段。分析6个物种...
关键词：MRNA 内含子 局域比对 最佳匹配片段 G+C含量 
拟南芥外显子连接序列上最佳匹配片段的偏好
《内蒙古大学学报（自然科学版）》2020年第2期148-153,共6页张强 赵小庆 薄素玲 曹艳娟 苏文霞 
内蒙古农业大学基础学科科研启动基金(JC2017003);国家自然科学基金(11747084);内蒙古自然科学基金(2018BS03001);内蒙古农业大学博士科研启动基金(NDYB2016-13)。
内含子序列通过与相应mRNA序列的匹配参与基因表达调控。采用Smith-Waterman局部比对方法,以拟南芥全基因组基因序列为基础,获得了内含子序列与其对应的外显子连接序列的最佳匹配片段。为了揭示两者之间的序列匹配特征,给出匹配频率在...
关键词：内含子序列 外显子连接序列 序列比对 外显子连接复合物(EJC) 最佳匹配片段 
家鼠的核糖核蛋白基因中内含子序列间成环匹配特征分析被引量：1
《内蒙古师范大学学报（自然科学汉文版）》2020年第1期78-82,共5页杨萨如拉 李瑞芳 冯雪 
内蒙古自然科学基金资助项目(2019MS03042);内蒙古高等学校科学技术研究项目(NJZY17043)
选取家鼠基因组中核糖核蛋白基因序列作为研究对象,采用Smith-Waterman局域比对法研究了内含子序列之间的相互匹配特征。结果表明,大多数第一内含子的长度分布在98 bp左右,第一内含子GC含量大多分布在43%~45%之间。第一内含子与其他相...
关键词：内含子序列 成环匹配特征 局域比对 最佳匹配 
果蝇成熟mRNA序列与其相应内含子序列的匹配特征分析被引量：5
《内蒙古大学学报（自然科学版）》2018年第6期612-619,共8页薄素玲 李宏 张强 杨振华 包通嘎拉 应智强 赵小庆 
国家自然科学基金(31500677;31260219;11747084)
研究成熟mRNA序列与其相应内含子序列的相互作用规律对于揭示基因表达调控具有重要意义.本文以黑腹果蝇第一号染色体蛋白质编码基因序列为研究对象,采用SmithWaterman局域比对的方法,在mRNA序列和内含子序列之间进行匹配性比对分析.研...
关键词：果蝇mRNA 内含子 最佳匹配片段 匹配频数分布 配对率 
内含子序列在甘蓝MAGIC亲本间亲缘关系分析中的应用
《华中农业大学学报》2017年第1期16-21,共6页安光辉 严承欢 张维奕 彭丽莹 陈炯炯 
湖北省自然科学基金项目(2013CFB204)
为探究甘蓝多亲本高级世代互交系(multiparent advanced generation inter-cross,MAGIC)亲本间的亲缘关系和遗传多样性,以便对MAGIC杂交亲本的选择提供依据,采用生物信息学的方法对单拷贝基因进行全基因组鉴定,并采用其内含子序列分析对...
关键词：甘蓝 单拷贝基因 内含子 系统进化树 
基于叶绿体ndhA基因内含子序列的DNA条形码在秋海棠属物种鉴定中的应用
《北方园艺》2016年第16期103-107,共5页赵博 李景剑 毛世忠 唐文秀 
广西自然科学基金资助项目(2012GXNSFBA053075)
以18种秋海棠属植物为试材,基于叶绿体ndhA基因内含子片段,利用Codon Code Aligner软件拼接序列后,通过MEGA软件进行比对并计算19个秋海棠属植物种间及种内遗传距离,最后利用邻接法构建分子系统树,研究了该片段作为DNA条形码对秋海棠属...
关键词：秋海棠属 ndhA基因内含子 DNA条形码 物种鉴定 
我国科学家发现基因剪接调控新机制
《科学通报》2016年第11期1265-1265,共1页本刊讯 
mRNA选择性剪接是真核生物中基因表达的一种高效、精准的调控机制,它是指剪接体通过在mRNA前体上的识别定位,准确地切除内含子序列,将不同的外显子序列拼接到一起,产生不同的成熟mRNA转录本.选择性剪接是形成结构和功能多样的蛋白质的...
关键词：调控机制 基因剪接 科学家 MRNA前体 选择性剪接 内含子序列 基因表达 真核生物 
Not just a sponge: new functions of circular RNAs discovered被引量：5
《Science China(Life Sciences)》2015年第4期407-408,共2页WANG ZeFeng 
One of the most exciting findings in RNA biology is the discovery of numerous circular RNAs （circRNA） in mammalian genome. Once being considered as low abundance splicing byproducts, circRNAs are surprisingly abunda...
关键词：RNA 圆形 内含子序列 海绵 剪接位点 动物基因组 生物合成 副产品 
恶性疟原虫ApiAP2蛋白与var基因内含子序列相互作用的体内鉴定被引量：3
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》2014年第1期1-5,共5页韩世通 张青锋 潘卫庆 
国家自然科学基金(No.31271388);中央高校基本科研业务费专项资金~~
目的鉴定恶性疟原虫ApiAP2蛋白家族成员PF3D7_1107800与var基因内含子保守序列(iNPE)存在体内相互结合作用。方法提取恶性疟原虫标准株3D7基因组DNA,PCR扩增PF3D7_1107800基因5′端片段。扩增产物经双酶切后连接入原核表达载体pGex-4T-1...
关键词：恶性疟原虫 ApiAP2 var基因 内含子调控蛋白 
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