洪国藩

作品数:40被引量:74H指数:5
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供职机构:中国科学院上海生命科学研究院更多>>
发文主题:结瘤基因PCR检测试剂盒水稻特异性引物更多>>
发文领域:生物学农业科学文化科学自然科学总论更多>>
发文期刊:《遗传》《世界科学》《电子显微学报》《微生物学通报》更多>>
所获基金:上海市科学技术委员会资助项目国家攀登计划国家高技术研究发展计划国家科技部专项基金更多>>
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一组高度保守的水稻trs-like基因的鉴定与分析
《Acta Genetica Sinica》2004年第8期822-829,共8页胡欣 胡昊 洪国藩 韩斌 
中国科技部;中科院;上海市科委共同资助~~
基于对水稻基因组序列的注解和同源搜索的结果 ,用RT PCR结合测序的方法证明了水稻中至少有 10个具有转录活性的trs like基因。这 10个基因的编码产物与酵母TRAPP蛋白复合体已知 10个亚基中的 6个分别同源。其中 4对基因是双拷贝的 ,另 ...
关键词:水稻 TRAPP亚基 内质网-高尔基体转运牵引 基因组序列注解 反转录PCR 
水稻两个frr基因的结构、转录特性及同源性分析被引量:2
《植物生理与分子生物学学报》2004年第1期105-114,共10页胡欣 胡昊 洪国藩 韩斌 
中国科技部;中科院;上海市科委共同资助。
对水稻中两个核糖体再循环因子同源基因OsfrrA 和OsfrrB进行了鉴定与分析。这两个单拷贝基因分别位于水稻的4号和7号染色体上,且在细胞器基因组中未发现同源序列。它们在不同组织中的转录特性及其蛋白质产物的N端特征提示其翻译产物会...
关键词:核糖体再循环因子 水稻 终止后复合体 半自主细胞器 
水稻逆转录转座子RIRE10拷贝数与LTR区转录活性的鉴定被引量:2
《生物化学与生物物理学报》2003年第8期768-773,共6页王嵘 洪国藩 韩斌 
国家科技部基金资助;中国科学院基金资助;上海市科学技术委员会基金资助~~
在水稻第四号染色体的长臂上鉴定了一个结构完整的Ty3型逆转录转座子RIRE10。RIRE10两LTR间的中间区域在gag pol的上游还包含另一个开放阅读框。通过RT PCR与Northern印迹杂交检测到来自LTR区的转录产物 ;根据点杂交结果 ,鉴定出包含中...
关键词:栽培稻 逆转录转座子 转录 LTR区 水稻基因组 
Characterization of a S-locus-related Receptor-like Kinase Cluster in Rice Chromosome 4被引量:1
《Acta Botanica Sinica》2002年第11期1346-1350,共5页雷海燕 周波 洪国藩 韩斌 
科技部 ;中国科学院 ;上海市科委资助项目~~
We have identified 14 S _locus glycoprotein (SLG)_related protein kinase genes in a 323 kb contig of rice (Oryza sativa L.) chromosome 4 and we detected the transcription pattern of this gene cluster by reverse tra...
关键词:Oryza sativa   receptor_like protein kinase S  _locus receptor kinase S  _locus glycoprotein rice (  Oryza sativa  ) 
对水稻 4号染色体上一个编码二氢黄酮醇还原酶类似蛋白基因簇的结构和进化分析(英文)
《生物化学与生物物理学报》2002年第6期685-689,共5页雷海燕 周波 张宇 洪国藩 韩斌 
科技部,中国科学院,上海市科委资助项目~~
通过对水稻 4号染色体一段 32 3kb的序列测定和分析 ,在其中 56kb的区域内发现了一个由 7个编码二氢黄酮醇还原酶 (DFR)类似蛋白基因组成的基因簇。这 7个基因在基因簇中串联排列 ,每个基因都由 6个外显子和 5个内含子组成。这 7个基因...
关键词:水稻 4号染色体 编码 二氢黄酮醇还原酶 类似蛋白基因簇 结构 进化分析 
一种使用混合PCR筛选技术高效延伸水稻BAC-重叠群的方法(英文)
《生物化学与生物物理学报》2002年第3期358-364,共7页胡昊 李滔 穆洁 韩斌 洪国藩 
水稻基因组测序国际合作项目 (IRGSP );中国科学院资助项目;国家科技部资助项目;上海市科委资助项目~~
使用“克隆连克隆 (clonebyclone)”战略进行水稻基因组测序需要依赖于构建好的基因组物理图。工作着眼于水稻籼稻广陆矮 4号 (OryzasativaindicaGuangLuAi4)第四号染色体长臂上 5 6 .1~ 6 8cM的区域 ,采用PCR方法筛选BAC全库来延伸重...
关键词:混合PCR 筛选 高效延伸 水稻 细菌人工染色体 重叠群 
菌落PCR在大规模基因组测序中的应用被引量:25
《生物化学与生物物理进展》2002年第2期316-318,共3页唐晔盛 李英 朱静洁 胡欣 林志新 韩斌 洪国藩 
一种利用菌落直接PCR扩增DNA并用于测序的实验方法 .通过对引物的设计和菌液浓度控制 ,使PCR反应后的内容物对测序干扰减到最小 .与传统的测序过程比较 ,它省去了抽提模板DNA一步 ,节省了大量时间和实验成本 .另外此方法可对BAC亚克隆...
关键词:菌落PCR 大规模基因组测序 应用 水稻基因组 测序 
可诱导结瘤基因nodA的体外转录被引量:1
《生物化学与生物物理学报》2002年第1期73-76,共4页张磊 洪国藩 
国家攀登计划资助项目 (No .910 2 310 0 2 )~~
报道结瘤基因nodA的体外诱导转录 :当转录体系中有一定量的调控蛋白NodD和植物诱导分子柚皮素 (naringenin )存在时 ,在体外转录的产物中始终存在着与体内转录相一致的特异产物。体外诱导转录表明 ,可诱导结瘤基因nodA在体内转录时 ,可...
关键词:可诱导结瘤基因 体外转录 诱导 nodA 根瘤菌 
水稻基因组中一类具有潜在转座活性的Solo-LTR的结构分析和鉴定被引量:1
《生物化学与生物物理学报》2001年第2期158-162,共5页周波 陈泽华 韩斌 洪国藩 
在水稻 4号染色体两个BAC克隆序列分析中 ,发现了两个solo LTR ,分别命名为SLTR1和SLTR2。它们分别位于水稻 18SrRNA基因和一逆转座子内部。序列比较发现 ,SLTR1和SLTR2存在着较高的同源性 ,并与水稻逆转座子RIRE8的LTR序列高度同源 ,...
关键词:水稻 solo-LTR 逆转座子 基因组 结构分析 
对水稻第4号染色体长臂近端粒区一个过氧化物酶基因簇的结构分析
《生物化学与生物物理学报》2001年第2期163-172,共10页陈泽华 周波 韩斌 钱跃民 洪国藩 
通过对定位BAC克隆 q30 37(H0 2 0 7F0 1)的序列测定和分析 ,在其中一个 2 2 .5kb的区域发现一个由 5个第三类过氧化物酶基因 (依次命名为osp1、osp2、osp3、osp4、osp5 )组成的基因簇。分析表明 ,osp1、osp2和osp3分别含 1个内含子 ,o...
关键词:过氧化物酶 基因簇 串联基因复制 直向同源基因 水稻 染色体 
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