李维忠

作品数:12被引量:31H指数:2
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供职机构:北京大学化学与分子工程学院物理化学研究所更多>>
发文主题:化学修饰超氧化物歧化酶修饰蛋白质配体更多>>
发文领域:生物学理学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
发文期刊:《生物化学与生物物理进展》《化工学报》《Chinese Journal of Structural Chemistry》《南开大学学报(自然科学版)》更多>>
所获基金:国家自然科学基金国家杰出青年科学基金国家高技术研究发展计划天津市教委基金更多>>
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蛋白质分子与配体结合过程构象变化的研究
《化学学报》2000年第7期772-776,共5页刘志杰 江林 李维忠 韩玉真 来鲁华 
中国科学技术部和国家自然科学基金(29525306;29703001)资助项目
蛋白质分子与配体的作用模式主要有直接的环区结合及铰链式结合两种方式.针对这两种不同的作用方式,我们提出采用不同的策略进行结合过程的构象研究.对于直接的环区结合模式,通过建立环区主链构象库,来实现蛋白质环区与配体的准柔性对接...
关键词:蛋白质 配体 环区结合 铰链式结合 构象变化 
化学修饰胰蛋白酶的溶剂化能计算被引量:3
《化工学报》2000年第6期797-802,共6页张子丁 何志敏 李维忠 
国家自然科学基金!资助项目 (No .2 9776 0 33)
运用分子模拟技术研究亲水化修饰胰蛋白酶热稳定性提高的机理 .首先从天然胰蛋白酶晶体结构出发 ,运用统一价键力场 (CVFF)对氨基修饰前后酶分子结构进行合理建模 ,再用Ooi模型和Vila模型计算了胰蛋白酶修饰前后溶剂化能的变化 .结果发...
关键词:胰蛋白酶 化学修饰 溶剂化能 热稳定性 
基于微扰突变的蛋白质侧链安装的遗传算法被引量:2
《计算机与应用化学》1999年第5期349-350,共2页刘志杰 李维忠 韩玉真 来鲁华 
国家高科技发展计划资助
在侧链转子库的基础上, 我们提出了用于蛋白质侧链安装的微扰突变的遗传算法。它在常规单点突变的同时又采用了微扰突变的方法, 因而同时具有传统遗传算法和理论搜索模拟方法的特点。我们分别用均方根偏差能量函数和真实的能量函灵敏...
关键词:蛋白质 侧链安装 构象 序列 设计 侧链转子库 
取代脱氧脲苷的量子化学计算及分子对接
《物理化学学报》1999年第9期834-837,共4页孙命 李维忠 郁铭 王瑾玲 缪方明 IBasnak TAHamor RTWalker 
天津市教委基金资助项目
substituted 6 aza 2’ deoxyuridines are inhibitors of herps simplex virius type 1 thymidine kinase (HSV 1 TK). In this paper, the semiempirical self consistent field PM3 calculations have been undertaken for two typic...
关键词:脱氧脲苷 胸腺激酶抑制剂 设计 分子对接 脲苷 
蛋白质功能环区肽库的合理筛选
《科学通报》1999年第16期1718-1721,共4页李维忠 刘志杰 梁世德 韩玉真 来鲁华 
国家"八六三"高技术计划 !(批准号 :86 3 10 3 13 0 3 0 5);国家自然科学基金! (批准号 :2 970 30 0 1;2 952 530 6 )资助项目
改变蛋白环区序列是功能蛋白质设计的重要方法 .运用环区数据库的最新统计结果 ,凭借精确快速的环区构象计算程序 ,将分子对接算法与组合化学策略结合 ,提出了用计算机模拟筛选组合肽库以获得功能蛋白的合理方法 .其优势在于将主侧链计...
关键词:组合肽库 蛋白环区 蛋白质设计 蛋白质工程 
国内外生物信息学数据库服务新进展被引量:18
《生物化学与生物物理进展》1999年第1期22-26,共5页李维忠 王任小 林大威 毛凤楼 韩玉真 来鲁华 
863高技术计划;攀登计划;国家杰出青年科学基金;国家教委资助
生物信息学是生命科学中最活跃的领域之一.各类生物信息学数据库在近年不断出现,其规模呈爆炸趋势增长,同时数据结构日趋复杂.目前生物信息学数据库服务已实现了高度的计算机和网络化.算法和软件的进步、数据库的一体化、服务器...
关键词:生物信息学 数据库 软件 
酶-配体复合物亲和性的计算被引量:3
《物理化学学报》1998年第9期826-832,共7页王任小 李维忠 来鲁华 唐有祺 
"九五"攀登项目
描述了一种新的计算酶-配体复合物亲和性的方法.它考虑了酶-配体结合过程中自由能变化的各主要因素,并利用经验公式加以计算、从蛋白质结构数据库中选取了66个酶-配体复合物作为训练集,利用回归分析得出最后的模型.此模型通用于...
关键词:药物设计  配体 复合物 亲和性 定量构效关系 
溶剂化对修饰超氧化物歧化酶稳定性的影响被引量:2
《物理化学学报》1998年第4期289-292,共4页李维忠 缪方明 
天津市高等教育局重点学科资助
The stability of Copper, Zinc superoxide dismutase increases remarkably when thelysines on the surface of the enzyme are modified. The fmite difference solution to the Poisson-Boltzman equation (FDPB) method is usedf ...
关键词:稳定性 超氧化物歧化酶 化学修饰 溶剂化 
静电作用与修饰铜锌超氧化物歧化酶的稳定性
《生物化学与生物物理进展》1996年第6期537-541,共5页李维忠 缪方明 
天津市高等教育局重点学科资助
铜锌超氧化物歧化酶(Cu,Zn-SOD)表面的赖氨酸经化学修饰后,酶的稳定性显著提高.赖氨酸被修饰后,酶的电荷结构遂发生变化,从而影响到酶分子电场.使用FDPB方法(有限差分法求解Poission-BOltzman方...
关键词:超氧化物歧化酶 酶稳定性 化学修饰 静电作用 
大分子静电势程序软件包MMEP被引量:2
《化学通报》1996年第3期58-61,共4页李维忠 王瑾玲 刘小兰 缪方明 
天津市高等教育局重点学科资助
在SGI图形工作站上开发大分子静电势程序软件包MacroMolecularElectrostaticPotential(MMEP)。使用有限差分法求解大分子体系的Poisson-Boltzman方程。得到在溶液状态下...
关键词:静电势 有限差分 计算机图形 生物大分子 MMEP 
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