国家自然科学基金(30871341)

作品数：17被引量：21H指数：2
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相关主题：高阶隐马氏模型VITERBI算法基因表达数据支持向量机更多>>
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高阶隐马氏模型研究进展被引量：3
《数学进展》2014年第2期219-231,共13页叶飞 王翼飞 
国家自然科学基金(No.30871341);上海市重点学科基金(No.S30104);上海市教委重点学科建设项目基金(No.J50101)
首先分析了高阶隐马氏模型的研究动机和背景,并给出了高阶隐马氏模型的一般结构和定义,然后总结了高阶隐马氏模型的一般研究方法,最后展望了高阶隐马氏模型进一步的研究方向.
关键词：隐马氏模型 高阶隐马氏模型 拓展法 模型降阶法 
基于动态规划的高阶隐马氏模型推广的Viterbi算法被引量：2
《运筹学学报》2013年第4期43-55,共13页叶飞 王翼飞 
国家自然科学基金(No.30871341);上海市重点学科基金(No.S30104);上海市教委重点学科建设项目基金(No.J50101)
首先通过Hadar等价变换方法将高阶隐马氏模型转换为与之等价的一阶向量值隐马氏模型,然后利用动态规划原理建立了一阶向量值隐马氏模型的Viterbi算法,最后通过高阶隐马氏模型和一阶向量值隐马氏模型之间的等价关系建立了高阶隐马氏模型...
关键词：高阶隐马氏模型 动态规划原理 VITERBI算法 
混合高阶隐马氏模型的EM算法被引量：2
《系统科学与数学》2013年第3期334-350,共17页叶飞 王翼飞 
国家自然科学基金(30871341);上海市重点学科建设项目(S30104);上海市教委重点学科建设项目(J50101);科技部重大科技专项基金项目(2009ZX09103-686)
提出了一类混合高阶隐马氏模型.基于模型降阶法,通过Hadar等价变换方法将混合高阶隐马氏模型分别转换为与之等价的两个混合一阶隐马氏模型,然后利用混合一阶隐马氏模型的EM算法建立了混合高阶隐马氏模型的EM算法,给出了混合高阶隐马氏...
关键词：一阶隐马氏模型 混合一阶隐马氏模型 高阶隐马氏模型 混合高阶隐马氏模型 EM算法 
基于GA-SVM方法的结肠癌基因表达谱数据分析被引量：2
《青岛科技大学学报（自然科学版）》2012年第6期587-592,共6页于彬 张岩 
国家自然科学基金项目(30871341);山东省教育厅科研基金项目(J10LA57);山东省优秀中青年科学家科研奖励基金项目(BS2012DX009)
对结肠癌的基因表达谱数据进行分析,提出选取其特征基因的新方法。首先考虑到基因表达谱数据高维数、小样本的特点,采用Bhattacharyya距离对数据进行降维,运用遗传算法生成特征基因子集,以支持向量机作为分类器,建立了基于GA-SVM的结肠...
关键词：基因表达谱 肿瘤分类 特征基因 遗传算法 支持向量机 
基于关联规则挖掘的蛋白质相互作用的预测
《上海大学学报（自然科学版）》2012年第3期265-270,共6页林合同 龚云路 秦殿刚 冯铁男 王翼飞 
国家自然科学基金资助项目(30871341);上海市重点学科建设资助项目(S30104);上海市教委重点学科建设资助项目(J50101)
利用蛋白质的一级结构信息,采用三肽频数方法刻画蛋白质序列,将关联规则(association rule,AR)挖掘应用于蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPIs)的预测.计算结果表明,提出的方法在半胱氨酸不同分类的情况下都能够准确地预...
关键词：关联规则挖掘 蛋白质相互作用 序列编码 氨基酸分类 
P311蛋白与金属硫蛋白ⅡA相互作用位点的计算机预测被引量：2
《上海大学学报（自然科学版）》2011年第6期728-733,共6页薛晓怡 冯铁男 王群群 王翼飞 
国家自然科学基金资助项目(30871341);上海市重点学科建设资助项目(S30104);上海市教委重点学科建设资助项目(J50101)
P311蛋白广泛表达于多种组织,并参与体内细胞分化、调节其他蛋白/基因转录、创伤修复、肿瘤发生等多种正常或异常的生物学活动.研究发现,金属硫蛋白ⅡA(metallothionein ⅡA,MT2A)参与P311基因的表达,并起着关键性的调节作用,这说明二...
关键词：P311蛋白 金属硫蛋白ⅡA 同源建模 分子对接 
三阶隐马氏模型算法及其与一阶隐马氏模型的关系被引量：2
《应用科学学报》2011年第5期500-507,共8页叶飞 衣娜 王翼飞 
国家自然科学基金(No.30871341);上海市重点学科基金(No.S30104);上海市教委重点学科建设项目基金(No.J50101);科技部重大科技专项基金(No.2008ZX10002-017;No.2008ZX10002-020;No.2009ZX09103-686)资助
为了考虑更多的统计特征,提出了一类三阶隐马氏模型,其中状态转移和输出观测同时取决于当前状态和前面两个状态.研究和推导了这类三阶隐马氏模型中估值问题的向前—向后算法、解码问题的Viterbi算法和学习问题的Baum-Welch算法.对此类...
关键词：一阶隐马氏模型 三阶隐马氏模型 向前-向后算法 VITERBI算法 Baum—Welch算法 
基于小波的肿瘤基因表达数据聚类分析模型被引量：1
《上海大学学报（自然科学版）》2011年第5期624-630,共7页黄文佳 冯铁男 王翼飞 
国家自然科学基金资助项目(30871341);上海市重点学科建设资助项目(S30104);上海市教委重点学科建设资助项目(J50101)
运用小波的降噪性建立一种基于肿瘤基因表达谱的聚类分析模型,采用小波变换、信息抽取、双向聚类的方法对基因表达谱进行有效的分析.通过这种模型,可以降低基因表达谱的噪音以及样本错聚率.最后,将该方法应用于结肠癌基因表达谱的分析.
关键词：基因表达数据 小波变换 特异表达基因 聚类分析 
基于小波分析的BP神经网络膜蛋白跨膜螺旋区段预测被引量：4
《青岛科技大学学报（自然科学版）》2010年第6期583-587,597,共6页于彬 
国家自然科学基金项目(30871341);科技部重大科技专项基金项目(2008ZX10002-017)
基因组计划所产生的大量蛋白质序列迫切需要从理论上预测跨膜螺旋区段。提出了基于小波多分辨分析的BP神经网络膜蛋白跨膜螺旋区段的预测新方法,并把此方法称之为WnnTM。从MPtopo数据库中随机抽取80条三维结构已知的膜蛋白质序列构建数...
关键词：小波分析 BP神经网络 膜蛋白 跨膜螺旋区段 
微丝相关蛋白HSPC300/hHBRK1与肌球蛋白Ⅵ相互作用位点的计算机预测
《上海大学学报（自然科学版）》2010年第6期635-638,648,共5页王飞飞 薛晓怡 王翼飞 
国家自然科学基金资助项目(30871341);上海市重点学科建设资助项目(S30104);上海市教委重点学科建设资助项目(J50101)
HSPC300/hHBRK1蛋白作为BRK1的人类同源蛋白,参与细胞运动和物质运输.肌球蛋白Ⅵ是肌球蛋白家族的成员.HSPC300/hHBRK1和肌球蛋白Ⅵ共同定位于细胞的胞浆,hHBRK1可能通过与肌球蛋白Ⅵ相互作用,参与细胞内的物质运输.从结构角度出发,通...
关键词：HSPC300/hHBRKl 肌球蛋白VI 结构预测 分子间对接 
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