亲缘性分析

作品数:59被引量:498H指数:11
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相关领域:医药卫生更多>>
相关作者:糜祖煌金辉秦玲许文波王慧玲更多>>
相关机构:无锡市克隆遗传技术研究所东南大学南京医科大学中国疾病预防控制中心更多>>
相关期刊:《中国热带医学》《江汉大学学报(自然科学版)》《陕西农业科学》《国际流行病学传染病学杂志》更多>>
相关基金:国家自然科学基金杭州市卫生科技计划项目江苏省实验诊断学重点实验室基金艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
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2013—2022年上海浦东新区麻疹和风疹疑似病例的检测结果分析
《上海预防医学》2024年第6期534-539,共6页王筱 张爱华 傅慧琴 杨玉颖 崔晓娴 郝莉鹏 周艳秋 潘丽峰 
上海市浦东新区卫生健康委员会公共卫生高原学科病原微生物检验基金项目(PWYggy2021-01)。
【目的】了解2013—2022年上海市浦东新区麻疹、风疹的流行特征,为适时调整消除麻疹、控制风疹的策略提供数据支持。【方法】采用酶联免疫吸附法检测疑似病例血清标本的麻疹和风疹IgM抗体,采用逆转录-聚合酶链反应法扩增麻疹病毒N基因C...
关键词:麻疹 风疹 亲缘性分析 消除 
蒙古黄芪叶绿体全基因组特征解析及亲缘性分析被引量:2
《中草药》2024年第7期2366-2374,共9页李俊霖 郭淑红 张强 张丽君 田洪岭 张琼 
国家重点研发专项(2019YFC1710800);国家中药材产业技术体系浑源综合试验站(CARS-21-03);山西农业大学校育种工程(YZGC056);山西省现代农业产业技术体系建设专项资金资助(2021-11)。
目的以蒙古黄芪Astragalus membranaceus var.mongholicus为材料,解析其叶绿体基因组的序列特征,并进行系统发育分析。方法利用Illumina NovaSeq测序平台对蒙古黄芪叶绿体全基因组进行测序,完成其组装、注释、特征分析,构建系统发育树...
关键词:蒙古黄芪 叶绿体基因组 序列比对 IRLC 系统发育 
2001—2018年上海市麻疹病毒流行株血凝素基因特征分析被引量:1
《上海预防医学》2022年第5期436-440,共5页杨玉颖 陈达瑜 唐伟 李云逸 王嘉瑜 李淑佩 李崇山 
上海市卫生健康委员会面上项目(201940311);上海市第五轮公共卫生三年行动计划(GWV-2);上海市科学技术委员会上海市青年科技英才扬帆计划(19YF1441500)。
【目的】分析2001—2018年上海市麻疹病毒(MeV)流行株血凝素(H)基因特征。【方法】收集2001—2018年上海市报告疑似麻疹病例的咽拭子样本,采用非洲绿猴肾细胞(Vero)/转染人信号淋巴细胞激活因子(hSLAM)细胞分离MeV,提取病毒核酸,采用逆...
关键词:麻疹病毒 血凝素 亲缘性分析 氨基酸变异 
基于机器学习的β-内酰胺酶注释预测和分析平台
《桂林电子科技大学学报》2021年第4期320-328,共9页侯镱 蓝小斌 陈嘉豪 管军霖 
广西研究生科研创新项目(YCSW2020152);桂林电子科技大学研究生教育创新计划项目(2020YCXS045)。
为了对潜在β-内酰胺酶蛋白质的功能和性质进行深入分析,构建了一个包含蛋白质信息注释、预测和特征性分析的综合平台(BLHub)。BLHub采用Java、Bootstrap3.3.6、Ajax、jQuery、MySQL和Strust2等技术实现了平台前后端的数据交互,并且该...
关键词:数据库 机器学习预测 抗生素耐药性 BLAST序列比对 亲缘性分析 重定向分析 
河北省首例D8基因亚型麻疹病毒株的分子流行病学分析
《医学动物防制》2021年第7期617-620,共4页王伟 杜慧 史卫卫 丛艳丽 崔世恒 刘岩 郭玉 张振国 
河北省自然科学基金青年科学基金(H2016303010)。
目的开展麻疹患者的病原学和分子监测,加强麻疹病毒基因型的监测。方法利用Vero/SLAM细胞(淋巴信号激活因子转染的非洲绿猴肾细胞),按常规方法分离病毒;利用RT-PCR扩增麻疹病毒N基因,然后测序并构建基因亲缘性关系树。对麻疹疫苗株S191...
关键词:麻疹病毒 N基因 D8基因亚型 亲缘性分析 
6个香菇菌株菌丝特性及亲缘性分析
《陕西农业科学》2019年第3期48-50,共3页王静之 王玲 党芳志 刘阳 
通过比较6个香菇菌株在不同温度下的菌丝生长速度,得出了其菌丝最适生长速度温度为26±1℃,最快生长速度温度为28±1℃。最适温度下,对6个香菇菌株菌丝生长速度之间的差异性和6个香菇菌株之间的亲缘性做了分析,得出了申香10号生长速度最...
关键词:香菇 菌丝特性 亲缘性 
中药白芍亲缘性分析及分子鉴定标记的筛选被引量:4
《浙江工业大学学报》2018年第5期581-584,共4页李敏 洪露 茅学群 
提取4种白芍的DNA基因组,筛选26条随机引物对浙白芍、亳白芍、山白芍和川白芍进行PCR扩增,共扩增出385条带,多态百分率为89%.聚类分析得到山白芍与亳白芍遗传相似性系数最高(为0.723 7),而与浙白芍的遗传相似性系数最低(为0.520 2).其...
关键词:白芍 多态百分率 中药分子鉴定标记 
中国菜豆凝集素序列的亲缘性分析
《江汉大学学报(自然科学版)》2017年第4期323-326,共4页韩雪 屈晓展 崔勇青 胡子颖 
湖北省豆类(蔬菜)植物工程技术研究中心开放性项目(2016-01)
菜豆凝集素可专一与寡糖结合,是其发挥凝血及杀虫功能的主要原因。将菜豆凝集素序列和其他豆科凝集素进行序列对比,发现菜豆凝集素与豇豆凝集素序列相似度最高。对不同国家产地凝集素序列进行对比分析,发现菜豆凝集素高度保守,高度相似...
关键词:菜豆 凝集素 序列分析 进化树亲缘性 
2013~2014年我国输入性B3基因型麻疹病毒的基因特征分析被引量:8
《病毒学报》2017年第4期577-582,共6页王慧玲 王淑蕾 任丽 毛乃颖 张燕 许文波 
国家自然科学基金课题(项目号:81371791),题目:麻疹病毒血凝素蛋白分子进化抗原变异及疫苗保护效果的影响~~
研究2013~2014年中国大陆分离到的输入性B3基因型麻疹野毒株的N蛋白羧基端核苷酸和氨基酸特征。应用MEGA6.0软件对2013~2014年输入我国的B3基因型麻疹病毒、GenBank下载的WHO参考株、2013~2014年全球流行的B3基因型麻疹病毒代表株和中...
关键词:麻疹病毒 病毒学监测 B3基因型 亲缘性分析 
20株鲍氏不动杆菌获得性耐药元件检测与菌株亲缘关系研究被引量:5
《中华医院感染学杂志》2017年第2期259-262,共4页杨丽华 陆利君 吴毅凌 翁幸鐾 糜祖煌 
上海市松江区医学重点学科建设项目(2013XK09)
目的了解鲍氏不动杆菌携带的获得性耐药元件,以及菌株间的亲缘关系。方法收集2015年1-12月医院分离到的20株鲍氏不动杆菌,采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法分析31种β-内酰胺类药物获得性耐药基因和12种氨基糖苷类药物获得性耐药...
关键词:鲍氏不动杆菌 亲缘性分析 获得性耐药元件 Β-内酰胺类 氨基糖苷类 可移动遗传元件 
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