密码子使用频率

作品数：18被引量：68H指数：4
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相关作者：张伟张宇宏刘波张艳丽续晨更多>>
相关机构：中国农业科学院生物技术研究所华中农业大学中国农业大学内蒙古大学更多>>
相关期刊：《菌物学报》《中国兽医学报》《海洋与湖沼》《林业科学研究》更多>>
相关基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家高技术研究发展计划更多>>
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思茅松及云南松转录组密码子偏好性比较分析被引量：1
《中南林业科技大学学报》2023年第9期153-163,共11页原晓龙 王毅 罗婷 李云琴 毕玮 陈伟 李江 
云南省重点研发计划项目(202102AE090022);云南省种子种业联合实验室工业思茅松品种选育项目(202202AR070001-17);云南省森林植物培育与开发利用重点实验室开放基金项目(KFJJ21-03);云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(202205AC160044)。
【目的】比较思茅松Pinus kesiya var.langbianensis和云南松P.yunnanensis转录组中表达基因的密码子使用模式,为运用基因工程技术改造密码子实现思茅松基因异源表达提供理论依据。【方法】利用CodonW1.4.2软件分析思茅松不同组织和云...
关键词：思茅松 云南松 转录组 密码子使用模式 密码子偏好性 密码子使用频率 
圆红冬孢酵母的密码子用法分析被引量：2
《菌物学报》2018年第11期1454-1465,共12页张琦 焦翔 刘香健 张月 张素芳 赵宗保 
国家自然科学基金(31370128;51761115014)~~
运用CodonW等软件,分析了圆红冬孢酵母Rhodosporidium toruloides基因组中191个蛋白质编码基因的密码子使用模式,包括密码子3个位置上的GC含量、有效密码子数和密码子使用频率。圆红冬孢酵母有效密码子数ENc值为38.9,密码子GC含量为63%...
关键词：密码子偏好性 高表达优越密码子 密码子使用频率 相对同义密码子使用度 有效密码子数 
人溶菌酶基因的密码子优化设计及生物信息学初步分析
《中国畜牧兽医文摘》2013年第10期144-144,共1页沈冰蕾 刘博洋 杨润军 
对猪乳蛋白密码子使用偏好性进行了分析，并基于其使用规则，在不改变编码氨基酸序列的基础上对人溶菌酶基因hLYZ的密码子进行了优化设计和生物信息学初步分析。研究结果表明，人hLYZ基因与猪乳蛋白相关基因的密码子使用频率存在明显差异，
关键词：密码子使用频率 溶菌酶基因 生物信息学 优化设计 氨基酸序列 使用规则 相关基因 乳蛋白 
长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)表达序列标记分析
《海洋与湖沼》2011年第6期804-810,共7页刘晨临 黄晓航 刘建国 
国家海洋公益项目;2012418039号;200705010号;国家海洋局基本科研业务经费项目;2008G19号
分别采用BlastX和Blast2go软件对453条非冗余的长心卡帕藻EST序列进行匹配分析和GO注释。结果表明,有281条序列与蛋白数据库中序列匹配,有132条序列被归属为3个子本体:分子功能、生物学过程和细胞组成。同时筛选到24个与逆境适应相关的...
关键词：长心卡帕藻 表达序列标记分析 抗逆基因 密码子使用频率 
牛乳蛋白的遗传密码子使用频率分析被引量：1
《中国兽医学报》2011年第2期267-271,共5页刘晶 于浩 杨润军 鲍永华 李俊雅 戴蕴平 赵志辉 
转基因生物新品种培育重大专项资助(2008ZX08007-001;2009ZX08009-156B;2009ZX08007-005B)
研究牛乳蛋白不同氨基酸的密码子使用频率对利用乳腺生物反应器表达目标蛋白过程中密码子的优化具有重要意义。本试验运用ENBOSS的CHIPS和SMS中的密码子使用工具对7种牛乳蛋白编码的基因进行了分析,并将这7个编码序列拼接在一起进行了...
关键词：牛乳蛋白 密码子使用频率 蛋白编码序列的密码子异质性 密码子偏爱性 
动物学
《中国生物学文摘》2008年第3期75-82,共8页
用溶血素从感染红细胞分离羊泰勒虫裂殖予;不同培养方法对昆虫病原线虫质量影响及其评价；日粮添加豆油和胡麻油对肉牛瘤胃发酵及主要微生物数量的影响；五个鸡群中催乳素基因密码子使用频率与产蛋量的关系分析；猪4．8和13染色体上肉...
关键词：动物学 密码子使用频率 昆虫病原线虫 微生物数量 催乳素基因 QTL定位 羊泰勒虫 细胞分离 
五个鸡群中催乳素基因密码子使用频率与产蛋量的关系分析被引量：13
《生物化学与生物物理进展》2007年第10期1101-1106,共6页刘华贵 王小花 刘玉方 赵兴波 李宁 吴常信 
国家重点基础研究发展计划(973)资助项目(2006CB102100);教育部"新世纪优秀人才支持计划"(NCET-04-0135)资助项目.~~
通过鸡催乳素基因编码区基因扫描,发现3个SNP位点,分别是外显子2的C1607T、外显子5的C5749T和T5821C,3个SNP均没有改变氨基酸的编码.同时发现不同的单倍型间存在不同的密码子使用频率.对5个鸡群共370只鸡进行SSCP的基因型检测,共发现7...
关键词：鸡 催乳素基因 密码子使用频率 酶联免疫检测 产蛋量 
竹类植物与水稻等其它禾本科作物的系统进化关系及基因序列组成的比较被引量：18
《林业科学研究》2006年第2期165-169,共5页樊龙江 郭兴益 马乃训 
国家自然科学基金(30270810)
利用8个全长mRNA基因序列比较了竹类植物和水稻等禾本科作物的系统进化和序列组成等。结果表明,在与水稻、玉米和麦类作物的比较中,竹类植物与水稻有着最近的亲缘关系和更相似的基因序列特征(GC含量分布和密码子使用频率),它们甚至比水...
关键词：竹类植物 水稻 系统进化 GC含量 密码子使用频率 
低蛋白猪日粮添加氨基酸的研究
《养猪大视野》2005年第5期36-37,共2页康怀彬 李银聚 程相朝 
以密码子使用频率为指导进行低蛋白日粮氨基酸生物配比。低蛋白日粮中添加氨基酸能显著改善猪的生产性能。对照组与试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ的日增重分别为561．07g±48．02g，389．27g±27．31g，526．79g±33．72g和476．71g±39．59g。结果...
关键词：密码子 使用频率 氨基酸 生物配比 日粮氨基酸 日粮添加 白猪 密码子使用频率 低蛋白日粮 生产性能 
基于Cytb基因序列探讨蝽亚科11种昆虫的系统发育关系被引量：12
《昆虫知识》2005年第4期395-399,共5页代金霞 郑哲民 
国家自然科学基金资助项目(编号:39391800);宁夏大学青年基金资助项目(编号:QN0418)。
对蝽亚科6属11种昆虫线粒体DNA细胞色素b基因部分序列进行PCR扩增和序列测定,比较其同源性,统计密码子使用频率并应用生物学软件构建分子系统树。在获得的432bp序列中,碱基T,C,A和G的平均含量分别是38.1,18.2,31.9和11.8%,表现出强烈的A...
关键词：蝽亚科 细胞色素b基因 序列 系统发育关系 B基因序列 昆虫 密码子使用频率 Cyt 分子系统树 线粒体DNA 
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