蛋白质二级结构

作品数：339被引量：1289H指数：18
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结合蛋白质二级结构信息预测蛋白质空间结构中的二硫键被引量：3
《计算机应用研究》2011年第6期2049-2051,2077,共4页石鸥燕 蔡春泉 孙伟 杨晶 黎小沛 
天津医科大学科学研究基金资助项目(2009ky41);天津市卫生局科技基金资助项目(09KY14)
在蛋白质空间结构预测中,二硫键的确定可以大大减少蛋白质构象的搜索空间。为提高二硫键预测的准确率,对形成二硫键的半胱氨酸及其周围的氨基酸残基在蛋白质二级结构形成上的偏性进行了分析,并提出将蛋白质二级结构信息加入到BP神经网...
关键词：二硫键 神经网络 蛋白质二级结构 
蛋白质二级结构的协同训练预测方法被引量：1
《计算机应用研究》2011年第5期1688-1691,共4页刘君 熊忠阳 王银辉 
中国博士后科学基金资助项目(20070420711);重庆市科委自然科学基金资助项目(2007BB2372)
针对蛋白质二级结构机器学习预测方法,忽略氨基酸疏水性特征以及氨基酸之间的长程作用和准确率不高的现状,进行了比较实验分析。采用氨基酸对应的疏水能值替换蛋白质中相应的氨基酸,得到疏水能值的序列。实验结果表明,用长的疏水能值序...
关键词：协同训练 蛋白质 二级结构预测 支持向量机 神经网络 
基于距离矩阵灰度图的蛋白质二级结构类型预测被引量：4
《计算机应用研究》2010年第10期3698-3700,共3页肖绚 肖纯材 王普 
国家自然科学基金资助项目(60961003);国家教育部科学技术研究重点项目(210116);江西省自然科学基金资助项目(2009GZS0064);江西省教育厅科研基金资助项目(GJJ09271);江西省青年科学家(井冈之星)培养对象基金资助项目
蛋白质二级结构预测在蛋白质结构预测中具有很重要的作用。基于伪氨基酸成分表示蛋白质的方法,能提高蛋白质结构和功能预测的成功率,利用蛋白质距离矩阵灰度图,基于几何矩提出了一种伪氨基酸构造方法,结合氨基酸的成分对蛋白质二级结构...
关键词：蛋白质二级结构 距离矩阵 模糊K近邻 几何矩 Jackknife测试 
合成金字塔预测模型中内含的改进型CBA预测方法
《计算机应用研究》2009年第12期4617-4620,共4页杨炳儒 周谆 侯伟 
国家自然科学基金重点资助项目(69835001);国家教育部科技重点资助项目([2000]175);北京市自然科学基金资助项目(4022008)
蛋白质二级结构预测问题,是生物信息学领域中最为重要的任务之一,历经三十多年的研究,已取得了一些进展,尤其是近来集成预测模型与混合预测模型的引入,为预测精度带来了一定程度的提高,然而其离从二级结构推导三级结构的目标,仍然存在...
关键词：关联规则 蛋白质二级结构预测 KDD＊ 合成金字塔模型 基于关联分类算法 
基于GEP-BP网络集成的蛋白质二级结构预测方法研究
《计算机应用研究》2009年第10期3687-3689,3693,共4页王艳春 
国家自然科学基金资助项目(30471138)
为提高蛋白质二级结构预测的精度,提出了一种基于GEP-BP网络集成的两层结构预测模型。首先利用基因表达式编程(GEP)的全局搜索能力同时进化设计BP网络的结构和连接权,并将进化最后一代的个体用BP算法进一步训练学习,然后采用组合方法将...
关键词：蛋白质 二级结构 基因表达式编程 神经网络集成 
基于条件随机场进行蛋白质二级结构预测
《计算机应用研究》2009年第3期832-833,839,共3页罗亮 邵泽辉 
国家自然科学基金资助项目(60373089;60674106;60533010;60703047)
使用一种新的概率图模型——条件随机场对蛋白质二级结构进行预测,并给出了模型的构建、训练以及解码的算法。应用这一模型对一个典型的蛋白质数据集CB513的二级结构进行了预测,并将预测结果与其他方法进行比较,预测准确度有明显的提高。
关键词：二级结构预测 条件随机场 概率图模型 
应用ANN/HMM混合模型预测蛋白质二级结构被引量：1
《计算机应用研究》2008年第12期3590-3592,共3页石鸥燕 杨惠云 杨晶 田心 
国家自然科学基金资助项目(30770545)
针对3-状态隐马尔可夫模型(hidden Markov model,HMM)预测蛋白质二级结构准确率不高的问题,提出15-状态HMM,通过改进的算法与BP神经网络相结合进行二级结构预测。研究对象为CB513数据集中筛选出的492条蛋白质序列,将其随机均分7组。应...
关键词：蛋白质二级结构预测 隐马尔可夫模型 人工神经网络 
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