蛋白质相互作用预测

作品数：18被引量：26H指数：3
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蛋白质与蛋白质相互作用预测模型综述被引量：3
《广州大学学报（自然科学版）》2023年第1期25-32,共8页钱冰 马宝山 刘玉 
大连市科技创新基金资助项目(2020JJ27SN066)。
蛋白质作为生命活动的物质基础,通过彼此之间的相互作用来参与生物信号传递、能量和物质代谢及细胞周期调控等,因此,预测蛋白质与蛋白质相互作用(PPIs)有助于从系统角度理解生命过程,同时为细胞机制的研究奠定重要基础。目前,高通量测...
关键词：蛋白质相互作用 预测方法 计算模型 
基于多序列特征提取的蛋白质相互作用预测被引量：4
《计算机工程与设计》2018年第1期86-89,254,共5页杜明宇 张晓龙 
国家自然科学基金项目(61273225;61502356)
考虑到现有的基于序列的蛋白质相互作用预测方法均采用单一的特征提取方法,具有一定的局限性,提出一种方法。用元学习策略作为分类器融合策略,并集成多种蛋白质序列特征提取方法。在10 702对酿酒酵母蛋白质对数据集上,得到97.28%的预测...
关键词：蛋白质-蛋白质相互作用 蛋白质序列 特征提取 支持向量机 分类器融合 
基于极限学习机的蛋白质相互作用预测
《枣庄学院学报》2017年第5期109-114,共6页朱玉萍 
蛋白质间的相互作用参与到生命活动的全过程,对它的研究有助于揭示生命活动的机制.本文采用基于序列的计算方法对蛋白质间的相互作用进行预测.首先,将蛋白质序列转换为蕴含生物进化信息的位置特异性得分矩阵,然后抽取出数值化描述符的...
关键词：极限学习机 分类器 蛋白质相互作用 
基于序列功能注释的蛋白质相互作用预测方法研究
《安徽农业科学》2015年第28期352-353,392,共3页陈霞 陈浩文 
湖南省教育厅资助科研项目(12C0921)
蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)是大多数细胞过程和生物功能的基础。该研究基于蛋白质功能注释方法(FNM)首次提出了结合蛋白的重要性的方法、结构域相互作用、基因本体论注释序列和注释;然后融合不同的策略,分别建立了3种方法结合的蛋白质...
关键词：蛋白质相互作用 多源信息融合 功能预测 本体注释 
基于深度玻尔兹曼机的蛋白质相互作用预测被引量：1
《基因组学与应用生物学》2015年第8期1791-1797,共7页薛燕娜 董洪伟 王兵 杨勤 李文静 
中央高校基本科研业务费专项资金资助
本文针对传统蛋白质相互作用预测模型预测精度不够高的问题,提出一种改进的深度玻尔兹曼机(DBM)模型以更精确地预测蛋白质的相互作用。首先,将多尺度特征组提取和自协方差编码方法结合编码序列特征,并利用DBM自动筛选有效特征。同时,为...
关键词：RE LU激活函数 深度玻尔兹曼机 序列编码 蛋白质相互作用 
SVM与主动学习方法相结合的蛋白质相互作用预测被引量：2
《计算机科学》2014年第2期82-86,共5页史文丽 郭茂祖 李晋 刘晓燕 
国家自然科学基金(60932008;61172098;61271346);高等学校博士学科点专项科研基金(20112302110040)资助
提出了基于SVM的主动学习算法,用来解决蛋白质相互作用的预测问题。细胞中的生物过程是通过蛋白质相互作用实现的。但是通过实验验证蛋白质之间是否具有相互作用的代价非常大,而且数据很难获取。为了在有限的阳性样本情况下更加快速准...
关键词：支持向量机 主动学习 蛋白质相互作用 
蛋白质相互作用研究进展被引量：1
《生物学通报》2012年第11期11-14,共4页庞尔丽 
国家自然科学基金资助项目(31171235)
蛋白质行使功能时,需要与其他蛋白质或者其他分子相互作用才能完成。在蛋白质相互作用水平上研究蛋白质对理解蛋白质功能、疾病与进化具有重要的意义。就蛋白质相互作用的预测、常用的蛋白质相互作用数据库以及蛋白质相互作用网络的研...
关键词：蛋白质相互作用预测 蛋白质相互作用网络 数据库 
蛋白质相互作用预测、设计与调控被引量：7
《物理化学学报》2012年第10期2363-2380,共18页张长胜 来鲁华 
国家自然科学基金(11021463;90913021);国家科技部(2009CB9185000)资助项目;北京大学-清华大学生命科学联合中心优秀博士后项目资助~~
蛋白质相互作用是生命活动在分子水平上的基本事件.蛋白质相互作用的三维图像可以给出关键生命活动过程的分子细节.了解蛋白质相互作用的原理有助于揭示生命活动的机制,并在此基础上开展有重要价值的蛋白质设计.本文对于蛋白质相互作用...
关键词：蛋白质相互作用 相互作用预测 蛋白质-蛋白质对接 蛋白质相互作用设计 蛋白质药物 药物设计 
蛋白质相互作用预测方法研究进展
《计算机光盘软件与应用》2012年第18期70-71,共2页彭利红 刘海燕 唐启涛 
湖南省教育厅资助科研项目(项目编号:09C163;项目名:互作网络中的蛋白质功能预测及其在疾病分析中的应用研究)
蛋白质间的相互作用是细胞实现功能的基础,其研究对疾病的诊断和治疗有着重要意义。蛋白质相互作用预测方法有实验方法和计算方法两大类。作为实验方法的有效补充和验证工具,计算方法受到越来越多人的重视。本文主要分析了预测蛋白质相...
关键词：蛋白质相互作用预测 实验方法 计算方法 
基于集成学习方法的蛋白质相互作用预测被引量：1
《四川大学学报（工程科学版）》2011年第3期68-75,共8页朱敏 张永清 李梦龙 周大威 黄俊 
国家自然科学基金资助项目(20972103;20905054)
针对蛋白质相互作用的预测问题,提出了集成学习的方法。该方法使用人工神经网络和支持向量机为成员分类器的集成学习方法,并分别用自协方差编码方式和二肽组成来表示蛋白质序列的特征集合,预测的准确率和ROC曲线面积分别达到92.16%、94....
关键词：集成学习 人工神经网络 支持向量机 蛋白质相互作用 
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