蛋白质亚细胞定位预测

作品数：21被引量：36H指数：4
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基于聚类与特征融合的蛋白质亚细胞定位预测被引量：4
《计算机科学》2021年第3期206-213,共8页王艺皓 丁洪伟 李波 保利勇 张颖婕 
国家自然科学基金项目(61461053,61461054)。
蛋白质亚细胞的定位预测不仅是研究蛋白质结构和功能的重要基础,还对了解某些疾病的发病机理、药物设计与发现具有重要意义。然而,如何利用机器学习精准预测蛋白质亚细胞的位置一直是一项具有挑战性的科学难题。针对这一问题,提出了一...
关键词：特征融合 聚类 自相关系数 伪氨基酸组分法 主成分分析法 
基于多标记学习的蛋白质亚细胞定位预测研究综述被引量：2
《信息技术与信息化》2021年第3期112-114,共3页余静 张靖 
确定蛋白质的亚细胞位置对了解胞内蛋白质功能以及药物设计具有重要作用。利用机器学习手段进行蛋白质亚细胞定位预测可以有效弥补传统实验手段耗时费力的不足。有些蛋白质同时存在于多个亚细胞位置中,或者游走于不同亚细胞之间,以实现...
关键词：蛋白质亚细胞 蛋白质序列 多标记学习 特征提取 定位预测 
基于深度学习的蛋白质亚细胞定位预测被引量：3
《计算机应用》2020年第11期3393-3399,共7页王艺皓 丁洪伟 李波 保利勇 张颖婕 
国家自然科学基金资助项目(61461053,61461054)。
针对传统机器学习算法中仍需手工操作表示特征的问题,提出了一种基于堆栈式降噪自编码器(SDAE)深度网络的蛋白质亚细胞定位算法。首先,分别利用改进型伪氨基酸组成法(PseAAC)、伪位置特异性得分矩阵法(PsePSSM)和三联体编码法(CT)对蛋...
关键词：深度学习 特征融合 蛋白质定位 堆栈式降噪自编码器 留一法 
PSO＿BFA优化词袋模型及蛋白质亚细胞定位预测被引量：2
《计算机工程与应用》2020年第1期165-171,共7页胡雪娇 陈行健 赵南 薛卫 
中央高校基本科研业务费专项资金（No.KYZ201668）
提出了一种基于PSO_BFA优化的词袋模型。传统词袋模型有两个重要参数:窗口大小d和字典大小k。结合粒子群算法和细菌觅食算法产生新的PSO_BFA混合优化算法,在PSO进行局部搜索时,加入BFA的复制和迁移行为,得到PSO_BFA的最优解即为窗口大...
关键词：词袋模型 粒子群算法 细菌觅食 亚细胞定位预测 
基于SVM的蛋白质亚细胞定位预测被引量：4
《计算机工程与应用》2019年第11期136-141,共6页刘清华 赖裕平 丁洪伟 杨志军 崔晓龙 
国家自然科学基金(No.61461053,No61461054,No.61072079)
首先基于特征融合思想,采用氨基酸组成、熵密度和自相关系数结合的方式构建190维特征向量进行特征表达,与仅考虑氨基酸组成信息的传统方法相比,能更好地表达蛋白质结构信息。然后利用LDA(Linear Discriminant Analysis)方法进行降维,降...
关键词：特征融合 熵密度 自相关系数 线性判别分析(LDA) 支持向量机 
词袋模型在蛋白质亚细胞定位预测中的应用被引量：5
《食品与生物技术学报》2017年第3期296-301,共6页赵南 张梁 薛卫 王雄飞 任守纲 
中央高校基本科研业务费专项资金项目(KYZ201668);江苏省自然科学基金项目(BK2012363;BK2011153);江苏省博士后科研计划项目(1302038B)
运用词袋模型结合传统的蛋白质特征提取算法提取蛋白质序列特征,采用K-means算法构建字典,计算获得蛋白质序列的词袋特征,最终将提取的特征值送入SVM多类分类器,对数据集中蛋白质的亚细胞位置进行预测,在一定程度上提高了亚细胞定位预...
关键词：词袋模型 K-MEANS 支持向量机 亚细胞定位预测 
以位置特异性得分矩阵和基因本体为特征的蛋白质亚细胞定位预测被引量：1
《福州大学学报（自然科学版）》2017年第1期16-24,共9页刘冰静 郭红 
福建省自然科学基金资助项目(2012J05114);福建省产学研重大专项基金资助项目(2012G106)
提出一种蛋白质亚细胞定位预测方法.该方法以位置特异性得分矩阵和基因本体抽取对应特征,结合支持向量机构建多标签分类模型.充分考虑了蛋白质进化信息对其亚细胞定位的影响,并基于文本分类中涉及到的卡方检验的对数变换思想,构建基因...
关键词：定位预测 蛋白质亚细胞 位置特异性得分矩阵 基因本体 多标签分类 
基于氨基酸约化和统计特征的蛋白质亚细胞定位预测被引量：2
《生物信息学》2015年第2期103-110,共8页杨红 徐慧敏 严寿江 陈静 耿丽丽 姚玉华 
国家自然基金项目(61272312)资助
蛋白质亚细胞定位预测对蛋白质的功能、相互作用及调控机制的研究具有重要意义。本文基于物化性质和结构性质对氨基酸的约化,描述序列局部和全局信息的"组成"、"转换"和"分布"特征,并利用氨基酸亲疏水性的数值统计特征,提出了一种新的...
关键词：蛋白质亚细胞定位 氨基酸物化性质 支持向量机 
蛋白质亚细胞定位预测研究进展被引量：2
《科技视界》2014年第15期183-184,共2页郑珊珊 石卓兴 代琦 姚玉华 
蛋白质的功能与其亚细胞位置有着密切的联系,对于确定一个未知特性蛋白质的功能,亚细胞定位研究能够提供重要的参考信息。采用传统实验的方法研究亚细胞定位需要耗费大量的人力、财力、物力,已经不能满足数据库中蛋白质序列爆炸性增长...
关键词：亚细胞定位 特征信息提取 预测算法 
蛋白质亚细胞定位预测研究进展
《科技视界》2014年第12期12-12,32,共2页郑珊珊 石卓兴 代琦 姚玉华 
蛋白质的功能与其亚细胞位置有着密切的联系,对于确定一个未知特性蛋白质的功能,亚细胞定位研究能够提供重要的参考信息。采用传统实验的方法研究亚细胞定位需要耗费大量的人力、财力、物力,已经不能满足数据库中蛋白质序列爆炸性增长...
关键词：亚细胞定位 特征信息提取 预测算法 
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