国家自然科学基金(20276026)

作品数：15被引量：71H指数：5
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相关作者：方柏山张光亚陈宏文胡宗定王蔚更多>>
相关机构：华侨大学天津大学浙江大学更多>>
相关期刊：《计算机与应用化学》《华侨大学学报（自然科学版）》《食品科学》《生命的化学》更多>>
相关主题：克雷伯杆菌1,3-丙二醇1,3-丙二醇氧化还原酶甘油脱氢酶BP神经网络更多>>
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系统生物学(Systems Biology)的几大重要问题被引量：3
《生物信息学》2007年第3期129-136,共8页陈铭 
国家自然科学基金(20276026);福建省自然科学重点项目基金资助(D0120002)
近几年来,系统生物学从正式提出到受到普遍关注和研究,对生物学的研究发展起了革命性的变化。主要从系统生物学的发展及其内容进行分析,讨论了生物数据整合,模型建立和模拟分析等几点关键性的问题,并展望了系统生物学的研究。
关键词：系统生物学 生物信息学 整合生物学 整合生物信息学 重要问题 
来源于克雷伯氏菌的1,3-丙二醇氧化还原酶的同源建模被引量：3
《生物信息学》2006年第3期102-104,127,共4页张燎原 曹阳 夏启容 洪燕 方柏山 
国家自然科学基金资助项目(20276026);福建省自然科学重点项目基金资助(D0120002)
用Swiss-Model和Modeller对来源于Klebsiella pneumonide的1,3-丙二醇氧化还原酶(PDOR)进行三级结构建模,并对所得的6个目标模型进行评价和比较,从中选择最好的一个模型,预测了辅酶NADP+和Fe2+在PDOR结构空间的近似位置,并定位了与NADP+...
关键词：1 3-丙二醇氧化还原酶 三级结构 同源建模 NADP^+ 
基于二肽组成识别嗜热和常温蛋白的研究被引量：5
《生物工程学报》2006年第2期293-298,共6页张光亚 方柏山 
国家自然科学基金资助项目(No.20276026);国务院侨办科研基金资助项目(No.05Q0018)。~~
通过分析3216条嗜热蛋白和4007条常温蛋白的二肽组成,结果发现,在嗜热蛋白中存在更多EE,EK,KE,VE,EI,KI,EV,KK,VK和IE等二肽,更少AA,LL,LA,AL,QA,QL,AQ,LT,TL和EQ等二肽。在此基础上发展了一种识别嗜热和常温蛋白的统计学方法,通过对两...
关键词：二肽组成 识别 嗜热蛋白 蛋白质热稳定性 
BYSJ软件设计及在生物信息中的应用
《华侨大学学报（自然科学版）》2006年第1期105-107,共3页张光亚 郑兰香 方柏山 
国家自然科学基金资助项目(20276026);华侨大学科研基金资助项目(03HZR7)
针对生物信息处理过程中难于找到相关程序进行序列分析的问题,自行设计一套数据处理软件.经实际应用,软件可用于处理生物数据库Transterm中获得的海量原始数据.文中简介Transterm数据库中所需信息的格式,并说明BYSJ软件的设计目标、实...
关键词：BYSJ软件 数据处理 Transterm数据库 生物信息学 
主成分分析的神经网络及其在木聚糖酶最适pH建模中的应用被引量：7
《计算机与应用化学》2005年第9期749-752,共4页张光亚 葛慧华 方柏山 
国家自然科学基金资助项目(20276026)
木聚糖酶结构与功能、性质的关系错综复杂,传统的回归分析往往不能满足要求。本文采用主成分分析法对样本数据集进行预处理,将得到的新样本数据集输入神经网络,籍助于均匀设计(UD),构建了木聚糖酶氨基酸组成和最适pH的模型。当学习速率...
关键词：主成分分析 BP神经网络 木聚糖酶 最适PH 虚拟筛选 
1,3-丙二醇氧化还原酶结构与功能关系的探讨
《生物信息学》2005年第3期101-103,共3页林锦霞 张光亚 方柏山 
国家自然科学基金资助项目(20276026);福建省科技计划项目(20031020)
用生物信息学方法对来源于klebsiella pneumonide的1,3-丙二醇氧化还原酶(即1,3-丙二醇氧化还原酶,PDOR)进行高级结构模建,并搜索其功能位点,以所得三维结构为对象,定位其铁信号结合位点、辅酶NADP大致位置以及可能的底物结合部位;在此...
关键词：1 3-丙二醇氧化还原酶 结构与功能 同源模建 活性部位 
嗜热和常温蛋白模式识别的研究被引量：3
《生物工程学报》2005年第6期960-964,共5页张光亚 方柏山 
国家自然科学基金资助项目(No.20276026);国务院侨办科研基金资助项目(No.05QZR06)。~~
采用主成分分析、偏最小二乘回归和BP神经网络三种方法对嗜热和常温蛋白进行模式识别。结果表明,三种方法对训练集拟合的平均正确率分别为92%、95%和98%,对测试集进行预测的平均正确率分别为60%、72.5%和72.5%,对嗜热蛋白预测正确率最高...
关键词：模式识别 主成分分析 偏最小二乘回归 BP神经网络 热稳定性 
宏基因组——生物催化剂的新来源被引量：7
《生命的化学》2005年第4期278-281,共4页张光亚 方柏山 
国家自然科学基金资助项目(No.20276026)
生物催化剂是工业生物催化的重要组成部分,宏基因组是生物催化剂的新来源。该文介绍了从宏基因组中寻找生物催化剂的主要步骤,着重描述了DNA的分离和目标克隆的筛选这两个关键技术,并列举了利用宏基因组技术所获得的生物催化剂。
关键词：宏基因组 生物催化剂 DNA分离 筛选 
克雷伯杆菌甘油脱氢酶的分离纯化及性质被引量：11
《无锡轻工大学学报（食品与生物技术）》2005年第1期1-5,37,共6页陈宏文 吴雅红 吴振华 方柏山 胡宗定 
国家自然科学基金项目(20276026);福建省自然科学重点基金项目(D0120002);福建省科学技术重点基金项目(20031020)资助课题.
在有氧条件下,利用Q Sepharose Fast Flow离子交换层析和Blue Sepharose CL 6B亲和层析提纯克雷伯杆菌胞内甘油脱氢酶.酶的纯化倍数和回收率分别为 32.61 倍和 5.83%.通过SDS PAGE电泳测得该酶亚基的相对分子质量约为 34 000.该酶最适...
关键词：甘油脱氢酶 克雷伯杆菌 纯化 
克雷伯杆菌生产1,3-丙二醇关键酶发酵条件研究被引量：19
《高校化学工程学报》2004年第5期621-627,共7页陈宏文 王蔚 方柏山 胡宗定 
国家自然科学基金(20276026);福建省自然科学重点项目基金(D0120002);福建省科技计划重点项目基金(2003I020)。
研究了克雷伯杆菌生产1,3-丙二醇关键酶(甘油脱氢酶、1,3-丙二醇氧化还原酶、甘油脱水酶)的发酵条件。研究各种碳源、无机氮源、有机氮源及无机盐对产酶的影响,应用均匀设计、神经网络和遗传算法优化发酵培养基组成,结果为(gL-1):甘油30...
关键词：1 3-丙二醇 甘油脱氢酶 1 3-丙二醇氧化还原酶 甘油脱水酶 发酵 优化 
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