蛋白质二级结构

作品数：339被引量：1289H指数：18
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蛋白质二级结构预测服务器PSRSM被引量：3
《生物信息学》2020年第2期116-126,共11页韩心怡 刘毅慧 
国家自然科学基金(No.61375013);山东省自然科学基金(No.ZR2013FM020)资助.
蛋白质二级结构预测是蛋白质结构研究的一个重要环节,大量的新预测方法被提出的同时,也不断有新的蛋白质二级结构预测服务器出现。试验选取7种目前常用的蛋白质二级结构预测服务器:PSRSM、SPOT-1D、MUFOLD、Spider3、RaptorX,Psipred和J...
关键词：蛋白质 蛋白质二级结构预测 PSRSM 预测方法评估 
蛋白质二级结构在线服务器预测评估被引量：1
《生物信息学》2019年第1期53-60,共8页朱树平 刘毅慧 
国家自然科学基金(No.61375013);山东省自然科学基金(No.ZR2013FM020)
蛋白质二级结构的预测,对于研究蛋白质的功能和人类生命科学意义非凡。1951年开始提出预测蛋白质二级结构,1983年对于二级结构的预测只有50%的准确率。经过多年的发展,预测方式不断的改进和完善,到如今准确率已经超过80%。但目前预测在...
关键词：蛋白质二级结构 预测 在线服务器 准确率 评估 
基于CNN与LSTM模型的蛋白质二级结构预测被引量：2
《生物信息学》2018年第2期130-136,共7页王剑 成金勇 赵志刚 鹿文鹏 
国家自然科学基金(61375013);山东省自然科学基金(ZR2013FM020)
蛋白质结构的预测在理解蛋白质结构组成和蛋白质的生物学功能有重要意义,而蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测的重要环节。当PSSM位置特异性进化矩阵被广泛应用于将蛋白质初级结构序列编码作为输入样本后,每个残基可以被表示成二维空...
关键词：卷积神经网络 长短记忆网络 蛋白质二级结构预测 Ensemble方法 
自动编码器方法的蛋白质二级结构预测被引量：2
《生物信息学》2018年第1期36-42,共7页张帅燕 刘毅慧 
国家自然科学基金项目(61375013);山东省自然科学基金项目(ZR2013FM020)
蛋白质二级结构预测是进行蛋白质三级结构研究的重要基础,氨基酸的编码方式对二级结构预测有一定的影响。本文应用了一种新的组合编码方式,即将基团编码与位置特异性打分矩阵(PSSM)进行组合的编码方式。本文中提出的基团编码是针对氨基...
关键词：蛋白质二级结构预测 基团编码 PSSM 贝叶斯分类器 自动编码器 
蛋白质二级结构指定被引量：7
《生物信息学》2016年第3期181-187,共7页曹晨 马堃 
蛋白质二级结构是指蛋白质骨架结构中有规律重复的构象。由蛋白质原子坐标正确地指定蛋白质二级结构是分析蛋白质结构与功能的基础,二级结构的指定对于蛋白质分类、蛋白质功能模体的发现以及理解蛋白质折叠机制有着重要的作用。并且蛋...
关键词：蛋白质二级结构指定 蛋白质结构 
基于集成分类器的蛋白质折叠模式识别
《生物信息学》2012年第2期112-115,共4页胡始昌 江弋 林琛 邹权 
国家自然科学基金(61001013;61102136);福建省自然科学基金(2011J05158)
蛋白质折叠问题被列为"21世纪的生物物理学"的重要课题,他是分子生物学中心法则尚未解决的一个重大生物学问题,因此预测蛋白质折叠模式是一个复杂、困难、和有挑战性的工作。为了解决该问题,我们引入了分类器集成,本文所采用的是三种分...
关键词：集成分类器 蛋白质二级结构 分类 折叠模式 
氨基酸邻域对二级结构的影响程度研究
《生物信息学》2012年第1期37-43,共7页朱佳杰 马文丽 郑文岭 
广州市科技计划项目(2006z1-10061)
通过研究神经网络权值矩阵的算法,挖掘蛋白质二级结构与氨基酸序列间的内在规律,提高一级序列预测二级结构的准确度。神经网络方法在特征分类方面具有良好表现,经过学习训练后的神经元连接权值矩阵包含样本的内在特征和规律。研究使用...
关键词：神经网络 氨基酸邻域 蛋白质二级结构 
基于 RBF 神经网络的蛋白质二级结构预测被引量：1
《生物信息学》2011年第3期224-228,234,共6页张斌 尹京苑 薛丹 
蛋白质二级结构对于研究其功能具有重要作用。采用主成分分析方法对氨基酸的基本物化属性及其二级结构倾向性进行降维降噪处理,使用径向基神经网络对蛋白质二级结构进行预测。主成分分析使得之前 20 ×12 矩阵变为 20 ×4 矩阵,极大地...
关键词：RBF神经网络 蛋白质二级结构预测 主成分分析 
《生物信息学》2010年总目次　
《生物信息学》2010年第4期378-380,共3页
关键词：生物信息学 蛋白质二级结构预测 全基因组分析 序列比对算法 电子克隆 拟南芥 目次 肝细胞癌 王志坚 文丽 2010 
基于SVM的蛋白质二级结构预测被引量：3
《生物信息学》2010年第3期187-190,共4页吴琳琳 徐硕 
蛋白质结构预测是现代计算生物领域最重要的问题之一,而蛋白质二级结构预测是蛋白质高级结构预测的基础。目前蛋白质二级结构的预测方法较多,其中SVM方法取得了较高的预测精度。重在阐述使用SVM用于蛋白质二级结构预测的步骤,以及与其...
关键词：支持向量机 蛋白质二级结构预测 非典型肺炎 
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