蛋白质功能

作品数:241被引量:494H指数:9
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UniProt蛋白质数据库简介被引量:44
《生物信息学》2019年第3期131-144,共14页罗静初 
UniProt(https://www.uniprot.org/)是国际知名蛋白质数据库,主要包括UniProtKB知识库、UniParc归档库和UniRef参考序列集三部分。UniProtKB知识库是UniProt的核心,除蛋白质序列数据外,还包括大量注释信息。UniProtKB知识库分Swiss-Prot...
关键词:数据库 蛋白质序列 蛋白质功能 数据库注释 数据库交叉链接 数据库高级检索 
蛋白质功能预测方法概述被引量:3
《生物信息学》2013年第1期33-38,共6页刘言 沈素萍 方慧生 陈凯先 
蛋白质是生物体内最必需也是最通用的大分子,对它们功能的认识对于科学领域和农业领域的发展有着至关重要的作用。随着后基因组时代的发展,NCBI数据库中迅速涌现出大量不明结构与功能的蛋白质序列,这些蛋白质序列甚至一跃成了研究的热...
关键词:蛋白质功能预测方法 结构基序 相互作用网络 ESG 
口腔癌相关蛋白质的细致功能预测
《生物信息学》2009年第3期223-226,共4页王敏 王靖 肖会 龚雪 郭政 
国家自然科学基金(39970397;30170515;30370388;)资助项目
口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)是人类最常见的恶性肿瘤之一。本文结合Gene Ontology功能先验知识,通过构建功能特异的蛋白质互相作用子网来预测口腔癌相关蛋白质的功能。我们以很高的精确率为已知部分功能的口腔...
关键词:口腔癌 蛋白质功能 蛋白质互作网络 GENE ONTOLOGY 
根据蛋白质互作网络预测前列腺癌相关蛋白质的细致功能
《生物信息学》2008年第4期145-147,共3页李彦辉 马文财 郭政 龚雪 张敏 姚晨 王靖 
国家自然科学基金(30370388;30670539)
对于功能部分已知的前列腺癌相关蛋白质,提出了一种基于Gene Ontology的功能特异的子网构建方法来细化其功能注释。结果显示该方法能够以很高的精确率为前列腺癌相关蛋白质预测更为精细的功能。预测的相关蛋白质的功能对于指导实验研究...
关键词:前列腺癌 蛋白质功能 蛋白质互作网络 GENE ONTOLOGY 
基于分组重量编码的蛋白质功能预测被引量:1
《生物信息学》2007年第1期25-27,共3页王秀鹤 王正华 王勇献 张振慧 
国家自然科学基金资助项目(NO.60603054)
从蛋白质序列出发,采用分组重量编码(Encoding Based on Grouped Weight,简记EBGW),并结合最近邻居算法对蛋白质功能进行预测。对酵母(Saccharomyces cerevisiae)蛋白质的1826条序列进行预测,整体预测准确率与其他基于序列信息的蛋白质...
关键词:分组重量编码 蛋白质功能预测 特征序列 最近邻居算法 
根据基因表达谱筛选间接互作蛋白质进行蛋白质功能预测
《生物信息学》2006年第3期105-108,共4页高磊 朱明珠 郭政 李霞 
国家自然科学基金(30370798;30170515;30370388)资助项目;国家863计划(2003AA2Z2051;2002AA2Z2052)资助项目;黑龙江科技攻关重点(GB03C602-4)资助项目;哈尔滨市科技攻关(2003AA3CS113)资助项目;黑龙江自然科学基金(F0177)资助项目;哈医大211工程"十五"建设项目
利用基因表达谱数据,通过计算互作蛋白质的表达相关系数,来筛选、优化蛋白质互作网络。结果显示,利用经过筛选的互作数据,根据邻居计数法和卡方法进行功能预测的预测效果明显提高,距离待测蛋白质较远的邻居也包含着与待测蛋白质功能一...
关键词:蛋白质互作 基因表达谱 基因功能 预测 相关 
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