蛋白质网络

作品数：50被引量：98H指数：6
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相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
相关作者：张兴义雷秀娟李敏李敏李鹏更多>>
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预防疾病,免疫功能检测先行
《健康生活》2024年第10期12-13,共2页周玉航 
免疫功能检测包括补体和免疫球蛋白、免疫细胞、自身抗体、微量元素等4项检测,旨在评估机体的免疫强度和完整性,对个人身体机能的评估有重要参考价值。补体和免疫球蛋白检测补体系统是一套复杂的蛋白质网络,能够在身体遭受感染时迅速启...
关键词：补体系统 肾小球肾炎 免疫球蛋白 免疫细胞 自身免疫疾病 免疫系统 蛋白质网络 预防疾病 
发面、死面、烫面哪个更“养胃”
《养生保健指南》2023年第7期82-82,共1页顾中一 
面制品的种类特别丰富,其中根据面团的制作方法分以下几种:死面死面就是凉水+面粉和成面团,特点是很有韧劲,用于制作手擀面、饺子皮等。烫面烫面就是用热水和面。面制品的韧劲来源于和面过程中形成的蛋白质网络,而热水能让蛋白质变性,...
关键词：面制品 蛋白质变性 饺子皮 蛋白质网络 面团 和面 制作方法 面粉 
基于时空图卷积神经网络的蛋白质复合物识别方法被引量：1
《南方医科大学学报》2022年第7期1075-1081,共7页盛江明 薛娟 李鹏 伊娜 
湖南省自然科学基金(2021JJ30920);湖南省教育厅创新平台开放基金项目(18K004);湖南省卫建委科研项目(202112072217)。
目的探讨利用时空图卷积神经网络在动态蛋白质网络中挖掘复合物的新方法。方法文中首先定义了边强度、节点强度和边存在概率等指标对动态蛋白质网络进行建模,然后结合图上的时间序列信息和结构信息,基于希尔伯特-黄变换、注意力机制和...
关键词：动态蛋白质网络 蛋白质复合物 图卷积神经网络 卷积算子 谱聚类 
采用隐马尔科夫模型的蛋白质复合物识别研究被引量：2
《计算机科学与探索》2021年第10期1980-1989,共10页李鹏 罗爱静 闵慧 谭荪怡 郭惠敏 
国家社会科学基金重点项目(17AZD037);国家重点研发计划(2017YFC1703306);湖南省自然科学基金青年项目(2019JJ50453);湖南省自然科学基金面上项目(2018JJ2301);湖南省科技厅重点项目(2017SK2111);湖南中医药大学开放基金项目(2018JK02);湖南省教育厅一般项目(19C1318)。
动态蛋白质网络的构建和复合物识别问题是生物信息学领域目前研究的热点。针对现有的算法在解决前述问题上的不足,提出了一种基于隐马尔科夫模型的蛋白质复合物识别算法(HMM-PC)。首先基于蛋白质的基因共表达特性构建初始蛋白质网络,然...
关键词：动态蛋白质网络 蛋白质复合物 隐马尔科夫模型 状态序列 维特比算法 
基于动态图的PPI网络构建和复合物挖掘算法研究被引量：1
《电子学报》2021年第8期1489-1497,共9页李鹏 闵慧 罗爱静 
国家社会科学基金重点项目(No.17AZD037);国家重点研发计划(No.2017YFC1703306);湖南省卫生健康委科研项目(No.202112072217);湖南自然科学基金青年项目(No.2019JJ50453);湖南自然科学基金面上项目(No.2018JJ2301);湖南省科技厅重点项目(No.2018JJ2301);湖南省教育厅一般项目(No.19C1318)。
动态蛋白质网络的构建和复合物挖掘问题是目前研究的热点.针对现有的算法在解决前述问题上的不足,文中考虑了蛋白质的活性周期和连接强度,首先提出了一种基于动态图的蛋白质网络构建算法.然后基于密度聚类设计了一种在动态蛋白质网络上...
关键词：动态蛋白质网络 蛋白质复合物 动态图 密度聚类 查全率 查准率 时间复杂度 
基于Flask的蛋白质网络分析平台设计被引量：1
《现代计算机》2021年第7期47-50,共4页胡振鑫 李川 蒲雪梅 袁榕澳 
复杂网络技术目前已经被广泛应用在现实生活中的各个领域,通过将系统表征成复杂网络可以有效提供系统的关键拓扑信息。结合基于Python实现的Flask框架搭建氨基酸网络分析平台,通过将复杂网络应用于蛋白质结构,对蛋白质结构进行网络的构...
关键词：FLASK PYTHON 氨基酸网络 
改进的动态PPI网络构建与蛋白质功能预测算法被引量：1
《计算机工程》2020年第12期52-59,共8页李鹏 闵慧 罗爱静 瞿昊宇 伊娜 许家祺 
国家重点研发计划(2017YFC1703306);国家社会科学基金重点项目(17AZD037);湖南省自然科学基金青年项目(2019JJ50453);湖南省自然科学基金面上项目(2018JJ2301);湖南省科技厅重点项目(2018JJ2301);湖南中医药大学开放基金(2018JK02)。
构建可靠的动态蛋白质网络是提高蛋白质未知功能预测和蛋白质复合物识别性能的关键,然而现有蛋白质网络构建和功能预测方法普遍存在鲁棒性低、预测精度不足等问题。为此,设计改进的动态蛋白质网络构建算法。采用进化图对蛋白质相互作用...
关键词：动态蛋白质网络 进化图 连接强度 功能预测 神经网络 
基于连接强度的动态蛋白质网络构建算法研究
《计算机与数字工程》2020年第11期2539-2543,共5页李鹏 闵慧 罗爱静 许家祺 颜湘茹 伊娜 刘杰 
国家社会科学基金重点项目(编号:17AZD037);国家重点研发计划(编号:2017YFC1703306);湖南省自然科学基金青年项目(编号:2019JJ50453);湖南省自然科学基金面上项目(编号:2018JJ2301);湖南省科技厅重点项目(编号:2018JJ2301);湖南中医药大学开放基金项目(编号:2018JK02);湖南省教育厅一般项目(编号:19C1318)资助。
为了解决现有的蛋白质网络构建方法在准确性、鲁棒性等方面的不足,提出了一种基于连接强度的动态蛋白质网络构建算法。首先,基于基因表达均值计算来对所有的蛋白质划分时间片,然后对于拥有相同时间片的蛋白质,采用连接强度来判断它们之...
关键词：动态蛋白质网络 连接强度 时间片 进化图 精度 鲁棒性 
基于衰减系数建立动态蛋白质网络模型进行关键蛋白质预测被引量：2
《计算机科学》2020年第S01期29-33,共5页戴彩艳 何菊 胡孔法 丁有伟 李新霞 
国家自然科学基金青年科学基金(61906100);江苏省青年基金(BK20180822);江苏省高等学校自然科学研究面上项目(18KJB520040)。
在生物系统的转变过程中,蛋白质的演化过程并非一成不变,而是动态变化的。通过构造模型的方法来研究蛋白质相互作用网络,可以较好地刻画蛋白质相互作用的演化机制。但是,利用构造模型的方法来研究动态蛋白质相互作用时,应该考虑在蛋白...
关键词：蛋白质相互作用网络 衰减系数 动态蛋白质网络 
基于蝙蝠算法的蛋白质网络功能模块检测
《浙江大学学报（工学版）》2019年第8期1618-1629,共12页徐嘉豪 冀俊忠 杨翠翠 
国家自然科学基金资助项目(61672065,61375059);中国博士后科学基金资助项目(2018M631291);北京市博士后工作经费资助项目(2017-ZZ-024)
为了得到更好的蛋白质功能模块,揭示蛋白质的功能,利用蝙蝠算法对蛋白质相互作用网络(PPINs)进行功能模块检测.每个蝙蝠个体所在的位置代表一种候选的功能模块划分,将PPIN中每个蛋白质节点与其所有邻居节点组成邻居有序表,采用在邻居有...
关键词：蛋白质相互作用网络(PPIN) 功能模块检测 蝙蝠算法 扰动 自适应变异 自然选择 
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