余国先

作品数：16被引量：65H指数：5
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供职机构：西南大学计算机与信息科学学院更多>>
发文主题：蛋白质功能预测蛋白质样例基因本体半监督学习更多>>
发文领域：自动化与计算机技术生物学文化科学政治法律更多>>
发文期刊：《华南理工大学学报（自然科学版）》《计算机工程与应用》《计算机工程与设计》《大数据》更多>>
所获基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金广东省自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目更多>>
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基于0-1矩阵分解的蛋白质功能预测被引量：2
《中国科学：信息科学》2019年第9期1159-1174,共16页赵颖闻 王峻 郭茂祖 张自力 余国先 
国家自然科学基金(批准号:61872300,61741217,61873214,61871020);国家重点研发计划(批准号:2016YFC0901902);中央高校基本科研业务(批准号:XDJK2019B024);重庆市基础与前沿研究(批准号:cstc2018jcyjAX0228,cstc2016jcyjA0351)资助项目
准确地标注蛋白质功能是功能基因组学的核心任务之一.蛋白质功能标注信息存在大量缺失且功能标签空间巨大.近期一些标签压缩方法被提出并应用于蛋白质功能预测,但是这些方法获取的压缩标签可解释性差,且面临着多标记学习中的阈值划分难...
关键词：蛋白质功能预测 矩阵分解 蛋白质互作网 基因本体 阈值划分 
基于网络约束双聚类的癌症亚型分类被引量：5
《计算机学报》2019年第6期1274-1288,共15页王星 王峻 余国先 郭茂祖 
国家自然科学基金(61873214,61872300,61741217,61871020,61571163,61532014);重庆市基础与前沿研究项目(cstc2018jcyjAX0228,cstc2016jcyjA0351)资助~~
癌症亚型识别在肿瘤异质性分析中具有重要意义.双聚类可以在大规模基因表达数据的基因和样本维度上同时进行聚类分析,发现部分样本在部分基因子集上表达相似的双聚类簇,进而发现相应的癌症亚型,为癌症的精准基因治疗等提供了重要的信息...
关键词：双聚类 均方残差 非负矩阵分解 癌症亚型 基因网络 
我国地方大数据政策的扩散模式与转移特征研究被引量：13
《大数据》2019年第3期76-95,共20页丁文姚 张自力 余国先 韩毅 
为揭示我国地方大数据政策的发展趋势与内容关联性,基于政策扩散与政策转移理论,采用内容分析法、社会网络分析方法,探索我国各省市68条地方大数据政策的时空扩散模式与内容转移特征。研究发现:我国地方大数据政策发布与参照的时间扩散...
关键词：地方政策 大数据政策 政策参照 政策扩散 政策转移 
基于稀疏语义的蛋白质噪声功能标注识别
《中国科学：信息科学》2018年第8期1035-1050,共16页路畅 陈霞 王峻 余国先 余志文 
国家自然科学基金(批准号:61402378;61572199;61741217);重庆市基础与前沿研究计划项目(批准号:cstc2014jcyj A40031;cstc2016jcyj A0351)资助
蛋白质功能自动标注是生物信息学领域的关键问题之一.蛋白质功能标注信息来源广泛,噪声标注信息不可避免地被引入.已有蛋白质功能预测研究更关注预测功能信息完全未知(或部分已知)蛋白质的功能,极少关注识别蛋白质的噪声功能标注.本文...
关键词：蛋白质功能 噪声功能标注 稀疏表示 语义相似度 标签结构 
面向科研创新的MATLAB课程教学模式探索被引量：18
《西南师范大学学报（自然科学版）》2018年第1期164-168,共5页余国先 王峻 
国家自然科学基金项目(61402378,61741217);西南大学教育教学改革研究项目(2015JY201,2015JY028,2017JY094).
总结多年MATLAB课程教学经验,基于MATLAB课程教学实践和应用性强的特点,设计多层次分阶段模块化的教学步骤,以大学生数学建模和实际工程应用案例为实践教学素材,积极探索面向大学生科研创新能力培养的MATLAB课程教学模式,以激发学生对...
关键词：MATLAB课程教学 创新能力培养 科研目标驱动 案例教学法 分层模块化教学 
基于多网络数据协同矩阵分解预测蛋白质功能被引量：1
《计算机研究与发展》2017年第12期2931-2944,共14页余国先 王可尧 傅广垣 王峻 曾安 
国家自然科学基金项目(61402378;61772143);重庆市自然科学基金项目(cstc2016jcyjA0351)~~
准确预测蛋白质功能是生物信息学的核心任务之一,也是人工智能在生物数据分析中的重要应用点之一.高通量技术的广泛应用产生了大量的生物分子功能关联网络,整合这些网络可更为全面地分析理解蛋白质功能机理,提升蛋白质功能预测精度.已...
关键词：蛋白质功能预测 功能关联网络 网络集成 非负矩阵分解 协同分解 
基于标记与特征依赖最大化的弱标记集成分类被引量：3
《软件学报》2017年第11期2851-2864,共14页谭桥宇 余国先 王峻 郭茂祖 
国家自然科学基金(61402378;61571163;61532014;61671189);重庆市基础与前沿研究项目(cstc2014jcyj A40031;cstc2016jcyj A0351)~~
弱标记学习是多标记学习的一个重要分支,近几年已被广泛研究并被应用于多标记样本的缺失标记补全和预测等问题.然而,针对特征集合较大、更容易拥有多个语义标记和出现标记缺失的高维数据问题,现有弱标记学习方法普遍易受这类数据包含的...
关键词：弱标记学习 高维数据 特征子集 依赖最大化 集成分类 
基于降维的蛋白质不相关功能预测被引量：4
《中国科学：信息科学》2017年第10期1349-1368,共20页余国先 傅广垣 王峻 郭茂祖 
国家自然科学基金(批准号:61402378;61571163;61532014;61671189);重庆市研究生科研创新项目(批准号:CYS16070);重庆市基础与前沿研究计划项目(批准号:cstc2014jcyj A40031;cstc2016jcyj A0351);中央高校基本科研业务费(批准号:2362015XK07;XDJK2016B009;XDJK2017D061)资助项目
蛋白质是生命活动的重要物质基础,对其功能的准确标注可以极大地促进生命科学的研究与发展.已有的蛋白质功能预测方法通常仅关注利用蛋白质具有某些功能的信息(正样例),并没有关注利用蛋白质不相关的功能信息(负样例).已有研究表明,结...
关键词：蛋白质功能预测 正负样例 蛋白质互作网 功能标记 降维 
基于正负样例的蛋白质功能预测被引量：6
《计算机研究与发展》2016年第8期1753-1765,共13页傅广垣 余国先 王峻 郭茂祖 
国家自然科学基金项目(61402378;61571163;61532014);重庆市基础与前沿研究项目(cstc2014jcyjA40031;cstc2016jcyjA0351);重庆市研究生科研创新项目(CYS16070);中央高校基本科研业务费基金项目(2362015XK07;XDJK2016B009;XDJK2016D021)~~
蛋白质功能预测是后基因组时代生物信息学的核心问题之一.蛋白质功能标记数据库通常仅提供蛋白质具有某个功能(正样例)的信息,极少提供蛋白质不具有某个功能(负样例)的信息.当前的蛋白质功能预测方法通常仅利用蛋白质正样例,极少关注量...
关键词：蛋白质功能预测 正样例 负样例 符号混合图 标签传播 
基于有向混合图的蛋白质新功能预测被引量：5
《中国科学：信息科学》2016年第4期461-475,共15页傅广垣 余国先 王峻 张自力 
国家自然科学基金(批准号:61402378,61101234);重庆市基础与前沿研究计划(批准号:cstc2014jcyj A40031);中央高校基本科研业务费(批准号:XDJK2014C044,2362015XK07)资助项目
蛋白质执行着生物体内各种重要生物活动,对蛋白质功能的准确标注能极大地促进生命科学研究与应用.传统的湿实验法通量低,已无法测定高通量技术产生的海量蛋白质功能,基于计算模型的大规模蛋白质功能预测是后基因时代生物信息学的核心任...
关键词：蛋白质功能预测 机器学习 有向混合图 随机游走 基因本体 蛋白质互作网 
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