李向阳

作品数:13被引量:25H指数:3
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供职机构:复旦大学环境科学与工程系更多>>
发文主题:基因组教学质量教学改革基因簇四氢嘧啶更多>>
发文领域:生物学农业科学理学文化科学更多>>
发文期刊:《生命科学研究》《凯里学院学报》《湖北医药学院学报》《物理学报》更多>>
所获基金:中国博士后科学基金国家自然科学基金贵州省科学技术基金湖南省研究生科研创新项目更多>>
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利用Batch-ANIm快速分析无色杆菌属菌株间的亲缘关系
《基因组学与应用生物学》2021年第2期695-704,共10页李向阳 杨紫琳 汤宏 潘佳莉 
国家自然科学基金项目(21507012和21966015);中国博士后科学基金项目(2015M570329);贵州省科学技术基金项目(黔科合基础[2019]1287号);贵州省科技厅联合基金项目(黔科合LH字[2017]7176);凯里学院博士专项基金项目(BS201412)共同资助。
基因组平均核苷酸相似度(average nucleotide identity,ANI)已成为鉴定细菌种内关系的黄金方法,开发可用于快速分析大量基因组之间ANI值的生物信息学工具具有重要意义。本研究以广泛应用的ANI分析软件JSpecies为基础,采用Perl集成编写...
关键词:无色杆菌属 平均核苷酸相似度 JSpecies软件 基因组 细菌分类 
基于大量质粒序列研究耐药基因与重金属抗性基因共分布
《湖北医药学院学报》2020年第3期205-208,215,F0002,共6页李向阳 杨紫琳 
国家自然科学基金(21507012、21966015);中国博士后科学基金(2015M570329);贵州省科学技术基金项目(黔科合基础[2019]1287号);贵州省科技厅联合基金(黔科合LH字[2017]7176);凯里学院博士专项基金(BS201412)。
目的:抗生素或重金属通过共选择机制促进携带耐药基因(ARG)和重金属抗性基因(MRG)的质粒在细菌中传播与扩散是形成耐药的重要因素,本研究通过已测序的大量质粒基因组数据分析ARGs和MRGs的共分布规律。方法:对已测序的17 387个细菌质粒...
关键词:耐药基因 重金属抗性基因 质粒 共分布 
四氢嘧啶基因簇在假单胞菌基因组中的分布研究
《科技与创新》2020年第12期132-133,135,共3页李向阳 何兰 
四氢嘧啶(Ectoine)是由细菌产生的一种次级代谢产物,赋予细菌抵御高渗透压环境的一种相容性溶质。研究显示许多细菌具有四氢嘧啶基因簇(ect ABCD-ask),然而关于该基因簇在假单胞菌属(Pseudomonas)中的分布还没有系统报道。鉴于此,以公...
关键词:假单胞菌 基因组 四氢嘧啶 四氢嘧啶合成基因簇 
凯里市大气降尘中可培养微生物群落结构分析研究被引量:1
《凯里学院学报》2020年第3期84-90,共7页李向阳 王楠 朱小章 杨蒙 
国家自然科学基金(21507012,21966015);中国博士后科学基金(2015M570329);贵州省科学技术基金计划项目(黔科合基础[2019]1287号);贵州省科技厅联合基金(黔科合LH字[2017]7176);凯里学院博士专项基金(BS201412);凯里学院校级教学改革与研究项目(JG201821)。
为了探究空气质量指数较好区域大气沉降中微生物组成及多样性,以凯里市为代表,通过采集凯里城区、炉山工业区、清水江畔3个典型区域大气降尘颗粒物,采用细菌可培养法、梯度稀释计数法及16S rRNA基因分子鉴定方法对凯里市大气降尘颗粒物...
关键词:大气沉降 16S rRNA基因 可培养细菌 凯里市 
中国江苏太湖和阳澄湖细菌群落组成、多样性和时空动态比较研究被引量:2
《生命科学研究》2020年第3期187-198,I0001-I0005,共17页李向阳 李媛 杨紫琳 李丹 曾思育 何苗 
国家自然科学基金资助项目(21507012,21966015);中国博士后科学基金资助项目(2015M570329);贵州省科学技术基金资助项目(黔科合基础[2019]1287号);贵州省科技厅联合基金资助项目(黔科合LH字[2017]7176)。
为了调查与比较太湖和阳澄湖浮游细菌群落的分布、多样性及动态,采用密集时间(每周)采样法于2012年6月至10月采集了85个样品,并通过16S rRNA基因高通量测序分析了其菌群组成。原始读长序列经过滤后,共获得142354条高质量读长序列,归属于...
关键词:细菌群落 16S RRNA基因 454焦磷酸测序 太湖 阳澄湖 
比较基因组分析斯氏假单胞菌遗传多样性及固氮基因岛进化机制被引量:1
《江苏农业科学》2017年第1期33-38,共6页李向阳 汤宏 张国辉 
国家自然科学基金(编号:21507012);中国博士后科学基金(编号:黔教合KY字[2015]395);贵州省教育厅自然科学研究项目[重点项目][(编号:KY2015395);凯里学院博士专项基金(编号:BS201412)
对5株固氮与11株非固氮斯氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)基因组开展综合比较分析,从基因组水平上研究斯氏假单胞菌种内遗传多样性及其固氮基因岛进化机制。核心与元基因组分析发现,16个斯氏假单胞菌拥有的独特基因数占元基因数的46.3...
关键词:斯氏假单胞菌 固氮基因岛 比较基因组 基因组变异型 多样性 
土壤学实验教学改革实践与探索被引量:9
《当代教育理论与实践》2016年第12期40-43,共4页汤宏 王建伟 李向阳 张杨珠 
凯里学院获得博士学位教师专项课题(BS201334)
土壤学实验作为农林高校资源与环境类专业的一门实验课程,具有应用性强、涉及面广、综合性强的特点。在土壤学实验教学过程中,通过改变或增加实验项目类型来改革实验教学内容,通过让学生自主进行实验、室内实验和室外实验相结合、运用...
关键词:土壤学实验 教学内容改革 教学方法改革 教学质量 实验教学 
施氏假单胞菌四氢嘧啶/羟基四氢嘧啶合成基因簇进化分析被引量:1
《凯里学院学报》2015年第6期70-73,共4页李向阳 张国辉 汤宏 
国家自然科学基金项目(编号:21507012);中国博士后科学基金面上项目(编号:2015M570329);凯里学院博士专项课题(编号:BS201412)
本文以9施氏假单胞菌完整基因组为材料,借助比较基因组学以及系统谱系进化树推导方法,分析了施氏假单胞菌生物四氢嘧啶/羟基四氢嘧啶合成基因簇(ectABCD-ask)的进化关系.结果表明ectABCD-ask基因簇在施氏假单胞菌种内具有很高的保守性,...
关键词:施氏假单胞菌 基因组比较 四氢嘧啶/羟基四氢嘧啶基因簇 系统发育树 
西南少数民族地区地方院校微生物学实验教学的改革探讨
《科技创新导报》2015年第26期16-17,共2页张国辉 张文华 李向阳 罗国涛 袁玮 王召 
凯里学院2014年"精品资源共享课"微生物学(JZGX201404)
西南地区微生物资源丰富但教育落后,少数民族地区地方院校对微生物实验也不曾重视,没有意识到它与学生就业和民族特色等方面的重要关系。鉴于西南少数民族地区地方院校实验设备落后、投入经费不足和学生学习兴趣不高等因素,为提高西南...
关键词:西南地区 少数民族 地方院校 微生物实验教学 
西部民族地区地方院校的《微生物学》授课改革探讨被引量:1
《科技创新导报》2015年第22期238-239,共2页张国辉 张文华 李向阳 
凯里学院2014年"精品资源共享课"微生物学(JZGX201404)
微生物学的快速发展使得本课程的教与学都面临着巨大的挑战,西部民族地区地方院校由于微生物的授课资料、课外实践和实验设备较为缺乏,出现学习条件相对落后和学生参与程度不高等现象,该文就西部民族地区地方院校当前《微生物学》授课...
关键词:西部地区 地方院校 微生物学 教学改革 
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