孙磊

作品数:11被引量:38H指数:4
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供职机构:扬州大学信息工程学院更多>>
发文主题:非编码RNA数据库哺乳动物非编码RNA基因小鼠更多>>
发文领域:自动化与计算机技术文化科学生物学医药卫生更多>>
发文期刊:《工业和信息化教育》《计算机教育》《江苏师范大学学报(自然科学版)》《扬州大学学报(自然科学版)》更多>>
所获基金:国家自然科学基金江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目江苏省产学研联合创新资金项目江苏省高等教育教改立项研究课题更多>>
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基于全基因组序列的弯曲菌特征分析被引量:6
《生物信息学》2020年第4期254-262,共9页孙磊 杨臻辉 恽茜 黄金林 
国家重点研发计划项目(No.2018YFD0500500);江苏省人兽共患病学重点实验室资助项目(No.R1805).
空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)和结肠弯曲菌(Campylobacter coli)是引起人类腹泻的主要致病菌。传统生化方法在鉴定弯曲菌时存在步骤多、耗时长、通量低等问题。本研究通过利用生物信息学方法对弯曲菌全基因组进行序列、基因注释、...
关键词:弯曲菌 全基因组 多位点序列分型 CRISPR-Cas系统 
面向专业认证的国际化工程人才培养探索被引量:1
《高教学刊》2020年第1期92-94,共3页孙磊 丁杰 
中国工程教育长期坚持走国际化人才培养发展道路。以“华盛顿协议”为代表的国际工程教育专业认证明确要求参加认证的工程专业学生在毕业时应具备一定的国际视野,并能够在跨文化背景下进行沟通和交流。对此,各参加认证专业需根据自身情...
关键词:国际化 工程教育 专业认证 全英文 人才培养 
翻转课堂模式及其在计算机编程课程中的应用研究被引量:7
《计算机教育》2019年第2期167-171,共5页姚志均 陈舒涵 孙磊 赖重远 
国家自然科学基金项目"物体形状部分视觉显著性度量及其应用"(61501208);江汉大学研究生教育教学改革项目"‘管理科学与工程’硕士研究生培养方式研究"(3010-04220001)
根据翻转课堂在高校课程教学中应用和效果,在分析国内计算机编程课程教学现状的基础上,阐述基于翻转课堂的计算机编程课程教学设计,并分别从课前准备工作、课堂教学环节和考核评价等方面具体说明设计过程。
关键词:翻转课堂 教学设计 教学评价 计算机编程 
图像处理类课程的混合式教学实践被引量:5
《工业和信息化教育》2018年第11期37-41,共5页胡学龙 陈舒涵 孙磊 
国家文化产业发展专项资金项目"多媒体互动教学资源示范平台建设"之子项目"数字图像处理"(项目编号:PHEI-MTRL-HE-ST702);2015年江苏省高等教育教改研究立项课题"智慧校园建设中电子信息类专业混合式教学模式的研究与探索"(项目编号:2015JSJG271);江苏省"十三五"高等学校重点教材立项建设修订教材"数字图像处理(第3版)"(项目编号:苏教高﹝2016﹞22号)
本文介绍笔者近年来在图像处理类课程教学中,以混合式教学理念为基础开展课程建设的一些体会。该类课程有涉及教学对象层次多、专业类别有差异、先修课程较多、技术发展快、需要较多的视觉资源、与网上教学方式结合紧密等特点。需要通...
关键词:混合式教学 数字图像处理 课程建设 教材建设 
基于GBrowse的多源长非编码RNA数据可视化系统被引量:1
《计算机系统应用》2017年第3期81-85,共5页孙磊 陈璇 唐红 魏李婷 姬岚洋 施胜飞 杨晓华 
国家自然科学基金(61301220);扬州大学大学生学术科技创新基金(x2015423;x2015444)
针对长非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)数据类型多样带来的有用信息提取困难的问题,提出基于基因组浏览器GBrowse(Generic Genome Browser)的多源lnc RNA数据可视化系统.该系统主要包括网页服务器和lnc RNA数据存储.其中,网页...
关键词:长非编码RNA 基因组浏览器 数据库 可视化 
基于Linux的长非编码RNA信息系统
《信息化研究》2016年第6期58-63,共6页孙磊 马宏辉 王诗佳 张晓斌 李云 胡学龙 
国家自然科学基金(61301220);扬州大学大学生科创项目
长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)已成为生物信息学研究领域的热点,涉及lncRNA基因注释、结构预测、功能和机制等研究方向。研究也产生了大量分布零散的lncRNA信息(包括lncRNA知识、研究方法和数据库等),而现有的lncRNA信息平...
关键词:长非编码RNA 信息系统 数据库 网页服务 数据可视化 
一种基于随机森林的长非编码RNA预测方法被引量:2
《扬州大学学报(自然科学版)》2016年第4期50-53,共4页孙磊 许驰 胡学龙 
国家自然科学基金资助项目(61301220);江苏省"六大人才高峰"第七批高层次人才项目(2010-DZXX-149)
为了提高长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)预测的准确性,提出一种基于随机森林算法的lncRNA预测方法.在国际通用的基因注释和基因组序列训练数据集中,首先进行特征选取,然后采用随机森林算法对包含特征信息的数据集进行模型训练...
关键词:长非编码RNA 随机森林 基因预测 
人和小鼠长非编码RNA基因的特征分析
《江苏师范大学学报(自然科学版)》2016年第2期51-55,共5页孙磊 王龙 戴丹 马若楠 
国家自然科学基金资助项目(61301220)
长非编码RNA(lncRNA)与蛋白质编码基因在转录过程中具有相似性,仅通过测序方法难以有效识别.针对这一问题,以高可靠性的GENCODE基因注释数据为基础,通过生物信息学方法在全基因组范围对人和小鼠这2种哺乳动物的lncRNA基因和蛋白质编码...
关键词:长非编码RNA 蛋白质编码 哺乳动物 生物信息学 
浅议“数字电路”课程设计的教学改革被引量:2
《考试周刊》2015年第24期12-13,共2页孙磊 蔡钧 
数字电子技术是电子信息类专业的基础课程之一。数字电路课程主要由理论课程、实验课程、课程设计三部分构成。其中的课程设计具有综合性和复杂性的特点,要求学生不仅充分掌握数电的基础理论,还具备设计、开发、分析、调试电路的实践能...
关键词:数字电子技术 课程设计 选题 考核方式 
生物医学大数据处理的云计算解决方案被引量:10
《电子测量与仪器学报》2014年第11期1190-1197,共8页孙磊 胡学龙 张晓斌 李云 
国家自然科学基金(61301220;61201408;61301111);江苏省"六大人才高峰"高层次人才项目(2010-DZXX-149;2012-WLW-024);江苏省产学研联合创新资金(前瞻性联合研究)项目(BY2013063-10)资助项目
随着二代测序、质谱分析、医学影像等生物医学技术的发展和应用,生物医学数据呈现爆炸性增长趋势,其处理面临数据量大、计算强度大、维度高等问题。云计算在资源分配、数据存储、计算、共享等方面具有优势,能够帮助解决生物医学大数据...
关键词:生物医学技术 二代测序 医学影像 大数据 云计算 
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