国家自然科学基金(90203011)

作品数:13被引量:30H指数:3
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水稻基因数据集的构建与特征分析被引量:1
《计算机与数字工程》2007年第10期1-3,7,共4页朱建丽 
国家自然科学基金项目(编号:90203011;30370354);"国家科技基础条件平台"资助
水稻基因序列的特征分析解水稻基因组的组成与结构规律具有重要意义。以常用的基因结构特征为基础,进一步分析功能位点信号(翻译起始位点、翻译终止位点、供体位点和受体位点)附近序列各位的保守性、密码子使用、剪接位点上、下游区域...
关键词:特征分析 水稻基因组 C+G含量 
支持向量机方法预测离子通道蛋白被引量:1
《计算机与数字工程》2007年第10期8-10,共3页涂白 毕然 
国家自然科学基金项目(编号:90203011)资助
讨论一种基于蛋白质结构域的方法预测离子通道蛋白。通过将蛋白质的结构域转化成为固定长度的向量,使用支持向量机方法进行离子通道蛋白的预测,并将预测结果与线性判别分析以及利用InterPro与GO映射规则进行预测的结果进行了比较。通过...
关键词:离子通道 结构域 支持向量机 基因本体 
SNP功能分析的生物信息学方法及其资源被引量:9
《计算机仿真》2007年第4期297-300,共4页李延恩 周艳红 
国家自然科学基金资助项目(90203011);湖北省自然科学基金资助项目(2002AC014)
在后基因组时代,单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)数据的快速积累使得用计算方法对编码区和非编码区SNP进行功能分析成为可能;但是目前各种SNP功能预测方法的预测精度均不能令人满意。针对这一问题,文章根据SNP的分...
关键词:单核苷酸多态性 功能预测 生物信息学方法 资源工具和功能注释 
基于有效性测度的基因表达数据的模糊聚类分析被引量:5
《计算机工程与科学》2005年第9期74-76,共3页刘青 邓庆山 
国家自然科学基金资助项目(90203011)
本文讨论了模糊聚类中的模糊C均值算法和聚类有效性测度。结合基因微阵列的特点,设计并实现了一种基于聚类有效性函数的模糊C均值模型。将该种模型运用于公开的白血病基因表达数据,取得了与实际情况相吻合的实验结果。
关键词:基因表达数据 模糊聚类 FCM 聚类有效性 Xie-Beni指数 
A Contact Energy Function Considering Residue Hydrophobic Environment and Its Application in Protein Fold Recognition被引量:1
《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》2005年第4期218-224,共7页Mo-Jie Duan Yan-Hong Zhou 
supported by the National Natural Science Foundation of China(No.90203011 and 30370354);the Ministry of Education of China(No.505010 and CG2003-GA002)
The three-dimensional (3D) structure prediction of proteins :is an important task in bioinformatics. Finding energy functions that can better represent residue-residue and residue-solvent interactions is a crucial ...
关键词:protein structure prediction fold recognition contact  energy hydrophobic environment 
Prediction and Classification of Human G-protein Coupled Receptors Based on Support Vector Machines被引量:1
《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》2005年第4期242-246,共5页Yun-Fei Wang Huan Chen Yan-Hong Zhou 
supported by the National Natural Science Foundation of China(No.90203011 and 30370354);the Ministry of Education of China(No.505010 and CG2003-GA002).
A computational system for the prediction and classification of human G-protein coupled receptors (GPCRs) has been developed based on the support vector machine (SVM) method and protein sequence information. The f...
关键词:GPCR PREDICTION CLASSIFICATION SVM 
Predicting the Coupling Specificity of G-protein Coupled Receptors to G-proteins by Support Vector Machines
《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》2005年第4期247-251,共5页Cui-Ping Guan Zhen-Ran Jiang Yan-Hong Zhou 
supported by the National Natural Science Foundation of China(No.90203011 and 30370354);the Ministry of Education of China(No.505010 and CG2003-GA002).
G-protein coupled receptors (GPCRs) represent one of the most important classes of drug targets for pharmaceutical industry and play important roles in cellular signal transduction. Predicting the coupling specifici...
关键词:GPCR G-PROTEIN SVM coupling specificity 
一种改进的六联体使用频率编码测度被引量:2
《华中科技大学学报(自然科学版)》2005年第7期107-110,共4页周艳红 毕然 唐睿 
国家自然科学基金资助项目(90203011);湖北省自然科学基金资助项目(2002AC014).
在基因预测软件中常用的编码测度得到的序列编码潜力大小往往与序列的C+G含量紧密相关,从而影响了对蛋白编码区的识别效果.研究发现六联体使用偏好与其自身C+G含量存在一种近似线性的相关性,据此提出了一种改进的六联体使用偏好模型,通...
关键词:编码测度 六联体使用偏好 C+G含量 蛋白编码区识别 基因预测软件 
基于密码子使用特征预测家族性扩张型心肌病的疾病基因
《科学通报》2005年第20期2235-2239,共5页周艳红 周权雄 刘怀兰 万宏辉 
国家自然科学基会(批准号:90203011,30370354);湖北省自然科学基金(批准号:2002AC014)资助项目.
家族性扩张型心肌病(FDC)是一种以常染色体显性遗传为主的单基因病,迄今已定位了15个常染色体显性遗传FDC的疾病基因区间,但只确定了其中8个定位区间的致病基因,另外7个定位区间中的FDC疾病基因仍有待发现.本文对已知的FDC疾病基因序列...
关键词:家族性扩张型心肌病 FDC 常染色体 显性遗传 密码子 
基于隧道机制实现H.323中防火墙和NAT的穿越被引量:1
《华中科技大学学报(自然科学版)》2005年第6期12-13,60,共3页刘怀兰 匡松柏 陈光亮 黄若宏 
国家自然科学基金资助项目(90203011).
针对H.323协议与防火墙和NAT设备共处时的问题及现有解决方案的不足,提出了一种建立在运输层协议上的隧道穿越技术的解决方案:隧道机制逻辑上由客户和服务器端两部分组成,采用SocksV5协议在客户端和服务器之间建立一条或多条TCP/UDP隧道...
关键词:网络地址转换 防火墙 隧道 SOCKS V5 
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